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Retrotransposons e enzimas de edição de ácidos nucléicos: ativação, eventos somáticos e associação com o câncer

Resumo

Os retrotransponíveis ou elementos móveis (MEs), representam uma constante ameaça à integridade do genoma hospedeiro pela sua capacidade mutagênica. Como mecanismo que busca assegurar esta integridade, um conjunto de enzimas de edição de ácidos nucléicos atua para inibir a atividade deletéria desses MEs. No entanto, este mesmo mecanismo de proteção à integridade do genoma, acaba sendo uma fonte crônica de danos pois é capaz de induzir mutações no DNA. A relação entre a ativação dos MEs e as mutações colaterais resultantes destas enzimas ainda não é totalmente esclarecida e precisa ser melhor explorada. Este projeto visa identificar e fornecer informações críticas para deduzir os agentes prejudiciais ao DNA, mecanismos moleculares casuais e, portanto, sugerir alvos terapêuticos adicionais para evitar eventos mutacionais desta natureza. Para alcançar esse objetivo, estruturaremos uma abordagem integrativa para interrogar o transcriptoma de 75 linhagens celulares, genoma e exoma total de 207 amostras (normal vs tumor) de pacientes com linfoma. No final, prentendemos expandir nosso conhecimento a respeito dos danos molelulares, apontando para novas alterações genômicas determinantes durante a formação e progressão nos tumores de células B. (AU)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
BUTTURA, JAQUELINE RAMALHO; PROVISOR SANTOS, MONIZE NAKAMOTO; VALIERIS, RENAN; DRUMMOND, RODRIGO DUARTE; DEFELICIBUS, ALEXANDRE; LIMA, JOAO PAULO; CALSAVARA, VINICIUS FERNANDO; FREITAS, HELANO CARIOCA; CORDEIRO DE LIMA, VLADMIR C.; BARTELLI, THAIS FERNANDA; WIEDNER, MARC; ROSALES, RAFAEL; GOLLOB, KENNETH JOHN; LOIZOU, JOANNA; DIAS-NETO, EMMANUEL; NUNES, DIANA NORONHA; DA SILVA, ISRAEL TOJAL. Mutational Signatures Driven by Epigenetic Determinants Enable the Stratification of Patients with Gastric Cancer for Therapeutic Intervention. CANCERS, v. 13, n. 3 FEB 2021. Citações Web of Science: 0.
VALIERIS, RENAN; AMARO, LUCAS; BUENO DE TOLEDO OSORIO, CYNTHIA APARECIDA; BUENO, ADRIANA PASSOS; ROSALES MITROWSKY, RAFAEL ANDRES; CARRARO, DIRCE MARIA; NUNES, DIANA NORONHA; DIAS-NETO, EMMANUEL; DA SILVA, ISRAEL TOJAL. Deep Learning Predicts Underlying Features on Pathology Images with Therapeutic Relevance for Breast and Gastric Cancer. CANCERS, v. 12, n. 12 DEC 2020. Citações Web of Science: 0.
ROSALES, RAFAEL A.; DRUMMOND, RODRIGO D.; VALIERIS, RENAN; DIAS-NETO, EMMANUEL; DA SILVA, ISRAEL T. signeR: an empirical Bayesian approach to mutational signature discovery. Bioinformatics, v. 33, n. 1, p. 8-16, JAN 1 2017. Citações Web of Science: 19.

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