Aplicação da técnica de sequenciamento do exoma para identificar mutações patogênicas na disgenesia gonadal parcial 46,XY

• Processo: 15/04763-4
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Vigência: 01 de maio de 2016 - 30 de abril de 2018
• Área do conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina - Saúde Materno-infantil
• Pesquisador responsável: Andrea Trevas Maciel Guerra
• Beneficiário: Andrea Trevas Maciel Guerra
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Médicas (FCM). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Ana Paula dos Santos ; Fábio Rossi Torres ; Gil Guerra Júnior ; Maricilda Palandi de Mello
• Assunto(s): Genética molecular Endocrinologia pediátrica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: disgenesia gonadal parcial 46 | distúrbios da diferenciação do sexo | Genética Molecular | Xy | Endocrinologia Pediátrica

Resumo

A disgenesia gonadal parcial 46,XY (DGP XY) é uma condição rara e quase sempre esporádica. Caracteriza-se por ambiguidade genital com diferenciação testicular parcial e cariótipo 46,XY. Já foram descritas mutações no gene NR5A1 e em outros genes participantes da diferenciação gonadal, como SRY, WT1, SOX9 e LHX9, mas a maioria dos casos tem etiologia desconhecida. Atualmente, técnicas de sequenciamento de nova geração permitem a busca de variantes patogênicas em todo o genoma humano. O sequenciamento do exoma completo (whole exome sequencing, WES) possibilita a pesquisa de mutações deletérias na região codificante completa de um indivíduo, sendo empregada para estudo de condições de etiologia ainda obscura, como a DGP XY. Este projeto tem por objetivo investigar novas variantes patogênicas em pacientes com DGP XY buscando identificar a presença de mutações deletérias que possam ser a causa dessa afecção e, eventualmente, identificar novos genes envolvidos na diferenciação testicular. Nossa casuística será composta por trios de 4 a 5 pacientes e respectivos pais, cujas amostras de DNA serão fragmentadas e empregadas na construção de uma biblioteca de DNA. Após a adição de adaptadores e etapas de PCR em fase sólida com formação de clusters, será realizado o sequenciamento por síntese da plataforma Illumina, utilizando nucleotídeos terminadores reversíveis e fluoróforos. As sequências obtidas serão analisadas por bioinformática para detecção de variantes patogênicas em heterozigose ("de novo" ou herdadas da mãe) ou homozigose (herança recessiva). Essas variantes serão validadas por sequenciamento de Sanger e sua presença será investigada em um grupo controle de no mínimo 100 indivíduos. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

DE OLIVEIRA, FELIPE RODRIGUES; MAZZOLA, TAIS NITSCH; DE MELLO, MARICILDA PALANDI; FRANCESE-SANTOS, ANA PAULA; DE LEMOS-MARINI, SOFIA HELENA V.; MACIEL-GUERRA, ANDREA TREVAS; HIORT, OLAF; WERNER, RALF; GUERRA-JUNIOR, GIL; FABBRI-SCALLET, HELENA. DHX37 and NR5A1 Variants Identified in Patients with 46,XY Partial Gonadal Dysgenesis. LIFE-BASEL, v. 13, n. 5, p. 11-pg., 2023-04-27. (18/19445-6, 15/04763-4, 20/01054-0)

FABBRI-SCALLET, HELENA; DE SOUSA, LIZANDRA MAIA; MACIEL-GUERRA, ANDREA TREVAS; GUERRA-JUNIOR, GIL; DE MELLO, MARICILDA PALANDI. Mutation update for the NR5A1 gene involved in DSD and infertility. Human mutation, v. 41, n. 1, p. 58-68, JAN 2020. (15/04763-4, 18/19445-6, 13/05603-5)