Análise funcional de genes polimórficos em carcinoma de células escamosas de orofaringe

• Processo: 15/18039-6
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Vigência: 01 de maio de 2016 - 31 de dezembro de 2018
• Área do conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
• Pesquisador responsável: Carmen Silvia Passos Lima
• Beneficiário: Carmen Silvia Passos Lima
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Médicas (FCM). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Albina Messias de Almeida Milani Altemani ; Gustavo Jacob Lourenço ; Manoela Marques Ortega
• Assunto(s): Oncologia Polimorfismo gênico
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Carcinoma de orofaringe | Erp29 | Kif13B | Polimorfismo gênico | Xpc | Cancerologia

Resumo

As diferenças individuais geradas por polimorfismos de base única (SNPs) em genes de reparo de danos ao DNA, em mecanismos de processamento e transporte de proteínas e em mecanismos de transporte intracelular indicam que a constituição genética pode predispor indivíduos ao carcinoma de células escamosas (CCE) de orofaringe (OF) e influenciar no prognóstico de pacientes portadores do tumor. Os papéis desempenhados pelos SNPs XPC c.2815A>C, ERP29 c.*293A>G e KIF13B c.*3163G>A no CCEOF são desconhecidos. Frente ao exposto, os objetivos do presente estudo são: 1) verificar se os genótipos dos SNPs XPC c.2815A>C, ERP29 c.*293A>G e KIF13B c.*3163G>A influenciam o risco de ocorrência do CCEOF, os aspectos clínicos dos pacientes com CCEOF e as características do tumor; 2) verificar se os genótipos dos SNPs XPC c.2815A>C, ERP29 c.*293A>G e KIF13B c.*3163G>A influenciam a expressão do gene em células tumorais, 3) verificar se os genótipos dos SNPs XPC c.2815A>C, ERP29 c.*293A>G e KIF13B c.*3163G>A influenciam na capacidade de reparo de DNA, ciclo celular e apoptose em células tumorais; e 4) verificar se os distintos genotipos dos SNPs ERP29 c.*293A>G e KIF13B c.*3163G>A alteram a expressao dos miRNAs miR-4421 e let-7e-3p, respectivamente. O DNA genômico do sangue periférico de 250 pacientes com CCEOF e 250 controles será analisado para identificar os genótipos do SNP com a reação em cadeia da polimerase (PCR) em tempo real com o ensaio TaqMan® (Applied Biosystems®). A linhagem celular de CCE de faringe humano (FaDu) será modificada geneticamente para apresentar o genótipo homozigoto selvagem ou o genótipo homozigoto variante dos SNPs XPC c.2815A>C, ERP29 c.*293A>G e KIF13B c.*3163G>A. RNA total e proteína total serão obtidos de sangue periférico de controles, de células tumorais de pacientes (dez com o genótipo homozigoto selvagem, dez heterozigotos e dez homozigotos variantes dos SNPs XPC c.2815A>C, ERP29 c.*293A>G e KIF13B c.*3163G>A) e da linhagem celular FaDu modificada (genótipo homozigoto selvagem ou genótipo homozigoto variante dos SNPs XPC c.2815A>C, ERP29 c.*293A>G e KIF13B c.*3163G>A). A expressão gênica será analisada nas amostras por meio da PCR quantitativa com iniciadores específicos e o corante SYBR Green (Applied Biosystems®). A quantificação da proteína nas amostras será realizada pelo método de western blotting e imunohistoquímica. Reparo de DNA, ciclo celular e apoptose serão avaliados por meio do ensaio cometa e por citometria de fluxo em linhagem celular FaDu modificada (genótipo homozigoto selvagem ou genótipo homozigoto variante dos SNPs XPC c.2815A>C, ERP29 c.*293A>G e KIF13B c.*3163G>A. As diferenças entre os grupos serão avaliadas por testes estatísticos específicos. Acreditamos que nossos resultados contribuirão para definir a função dos SNPs em CCEOF. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

CARRON, JULIANA; DALLA COSTA, ANA PAULA; RINCK-JUNIOR, JOSE AUGUSTO; MARIANO, FERNANDA VIVIANE; CARVALHO, BENILTON DE SA; PASSOS LIMA, CARMEN SILVIA; LOURENCO, GUSTAVO JACOB. Role of a genetic variation in the microRNA-4421 binding site of ERP29 regarding risk of oropharynx cancer and prognosis. SCIENTIFIC REPORTS, v. 10, n. 1, OCT 12 2020. (12/17182-1, 15/18039-6, 06/06231-0)