Metabolômica, alvos enzimáticos e ferramentas in silico na busca por substâncias bioativas de plantas

• Processo: 14/26866-7
• Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Vigência: 01 de junho de 2016 - 30 de novembro de 2018
• Área do conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Química - Química Orgânica
• Pesquisador responsável: Fernando Batista da Costa
• Beneficiário: Fernando Batista da Costa
• Instituição-sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Pesq. associados: Flavio da Silva Emery ; Marcelo Claro de Souza ; Maria Cristina Nonato ; Ricardo Pereira Rodrigues
• Assunto(s): Asteraceae Quimioinformática Metabolômica Química de produtos naturais

Resumo

Com o rápido desenvolvimento de técnicas analíticas, em especial as cromatográficas e espectrométricas, houve uma drástica diminuição do tempo para a separação, isolamento e identificação de substâncias de origem natural. Logo, o processo de descoberta de novas substâncias bioativas a partir de fontes naturais tem sido bastante facilitado, ainda mais com sua associação a métodos in silico, por exemplo no âmbito da metabolômica. Com vistas ao aumento de produtividade na busca por componentes inéditos ou bioativos, bem como realizar estudos in silico (triagem de moléculas) e de desreplicação de matrizes biológicas, também é importante a criação de coleções de substâncias puras e de suas estruturas químicas, bem como de extratos e frações cromatográficas. Portanto, o principal objetivo desse projeto é empregar a metabolômica via cromatografia líquida acoplada a espectrometria de massas e métodos in silico para encontrar substâncias naturais oriundas de plantas da família Asteraceae com potencial anti-inflamatório e antiparasitário. Os alvos selecionados são enzimas envolvidas na inflamação (cicloxigenase e lipoxigenase) e em doenças causadas por parasitas (diidroorotato desidrogenase - DHODH de Trypanosoma cruzi e Leishmania major). Além disto, propõe-se desenvolver uma biblioteca de substâncias puras, uma extratoteca, uma biblioteca de estruturas químicas e uma base de dados integrada. Estruturas químicas oriundas da desreplicação de extratos e do levantamento bibliográfico dos grupos vegetais estudados, bem como dados de bioensaios, serão utilizados na triagem virtual de substâncias com potencial anti-inflamatório. Os dados resultantes deste projeto serão integrados e inseridos em um banco de dados. Trata-se, portanto, do desenvolvimento de uma plataforma integrada para a descoberta de substâncias bioativas e desreplicação. (AU)

Publicações científicas

(21)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

CCANA-CCAPATINTA, GARI V.; MONGE, MARCELO; FERREIRA, PAOLA L.; DA COSTA, FERNANDO B.. Chemistry and medicinal uses of the subfamily Barnadesioideae (Asteraceae). PHYTOCHEMISTRY REVIEWS, v. 17, n. 3, p. 471-489, JUN 2018. (14/26866-7, 14/16850-6)

GALLON, MARILIA ELIAS; MONGE, MARCELO; CASOTI, ROSANA; DA COSTA, FERNANDO BATISTA; SEMIR, JOAO; GOBBO-NETO, LEONARDO. Metabolomic analysis applied to chemosystematics and evolution of megadiverse Brazilian Vernonieae (Asteraceae). Phytochemistry, v. 150, p. 93-105, JUN 2018. (15/05453-9, 12/14397-7, 14/26866-7)

GALLON, MARILIA ELIAS; JAIYESIMI, OLAKUNLE ADEBOYE; GOBBO-NETO, LEONARDO. LC-UV-HRMS dereplication of secondary metabolites from Brazilian Vernonieae (Asteraceae) species supported through in-house database. Biochemical Systematics and Ecology, v. 78, p. 5-16, JUN 2018. (15/05453-9, 14/26866-7)

PADILLA-GONZALEZ, GUILLERMO F.; DIAZGRANADOS, MAURICIO; CCANA-CCAPATINTA, GARI; CASOTI, ROSANA; DA COSTA, FERNANDO B.. Caffeic acid derivatives and further compounds from Espeletia barclayana Cuatrec. (Asteraceae, Espeletiinae). Biochemical Systematics and Ecology, v. 70, p. 291-293, FEB 2017. (14/26866-7, 14/17702-0)

PADILLA-GONZALEZ, GUILLERMO F.; DIAZGRANADOS, MAURICIO; DA COSTA, FERNANDO B.. Biogeography shaped the metabolome of the genus Espeletia: a phytochemical perspective on an Andean adaptive radiation. SCIENTIFIC REPORTS, v. 7, AUG 18 2017. (14/26866-7, 14/17702-0, 10/51454-3)

DE SOUZA, MARCELO CLARO; HABERMANN, GUSTAVO; DO AMARAL, CARITA LIBERATO; ROSA, ANNYLORY LIMA; ONGARO PINHEIRO, MARCELO HENRIQUE; DA COSTA, FERNANDO BATISTA. Vochysia tucanorum Mart.: an aluminum-accumulating species evidencing calcifuge behavior. PLANT AND SOIL, v. 419, n. 1-2, p. 377-389, OCT 2017. (14/26866-7, 13/21293-6, 10/51454-3)

ZIAROVSKA, JANA; PADILLA-GONZALEZ, GUILLERMO F.; VIEHMANNOVA, IVA; FERNANDEZ, ELOY. Genetic and chemical diversity among yacon [Smallanthus sonchifolius (Poepp. et Endl.) H. Robinson] accessions based on iPBS markers and metabolomic fingerprinting. Plant Physiology and Biochemistry, v. 141, p. 183-192, AUG 2019. (14/26866-7, 14/17702-0, 16/21183-4)

CCANA-CCAPATINTA, V, GARI; PADILLA-GONZALEZ, GUILLERMO F.; FERREIRA, PAOLA L.; MONGE, MARCELO; CASOTI, ROSANA; CORRADIN, MARINA D.; SEMIR, JOAO; GROPPO, MILTON; DA COSTA, FERNANDO B.. Phenolic Profiling of Medicinal Species of Chuquiraga, Asteraceae, by HPLC Fingerprinting. REVISTA BRASILEIRA DE FARMACOGNOSIA-BRAZILIAN JOURNAL OF PHARMACOGNOSY, v. 31, n. 5, SEP 2021. (14/16850-6, 14/26866-7)

FREITAS, J. A.; CCANA-CCAPATINTA, G. V.; DA COSTA, F. B.. LC-MS metabolic profiling comparison of domesticated crops and wild edible species from the family Asteraceae growing in a region of Sa?o Paulo state, Brazil. PHYTOCHEMISTRY LETTERS, v. 42, p. 45-51, APR 2021. (14/26866-7)

CCANA-CCAPATINTA, GARI V.; SAMPAIO, BRUNO L.; DOS SANTOS, JR., FERNANDO M.; BATISTA, JR., JOAO M.; DA COSTA, FERNANDO B.. Absolute configuration assignment of caffeic acid ester derivatives from Tithonia diversifolia by vibrational circular dichroism: the pitfalls of deuteration. TETRAHEDRON-ASYMMETRY, v. 28, n. 12, p. 1823-1828, DEC 15 2017. (15/07089-2, 14/25222-9, 11/13361-6, 16/23794-0, 14/16850-6, 14/26866-7)

CHIBLI, LUCAS A.; ROSA, ANNYLORY L.; NONATO, MARIA CRISTINA; DA COSTA, FERNANDO B.. Untargeted LC-MS metabolomic studies of Asteraceae species to discover inhibitors of Leishmania major dihydroorotate dehydrogenase. METABOLOMICS, v. 15, n. 4, APR 2019. (14/26866-7, 14/01443-6)

FREITAS, JOLINDO A.; CCANA-CCAPATINTA, V, GARI; DA COSTA, FERNANDO B.. Pyrrolizidine alkaloids and other constituents from Emilia fosbergii Nicolson. Biochemical Systematics and Ecology, v. 92, OCT 2020. (14/26866-7)

PADILLA-GONZALEZ, GUILLERMO F.; AMREHN, EVELYN; FREY, MAXIMILIAN; GOMEZ-ZELEDON, JAVIER; KAA, ALEVTINA; DA COSTA, FERNANDO B.; SPRING, OTMAR. Metabolomic and Gene Expression Studies Reveal the Diversity, Distribution and Spatial Regulation of the Specialized Metabolism of Yacon (Smallanthus sonchifolius, Asteraceae). INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES, v. 21, n. 12, JUN 2020. (14/26866-7, 14/17702-0, 16/21183-4)

CCANA-CCAPATINTA, GARI V.; FEITAS, JOLINDO A.; MONGE, MARCELO; FERREIRA, PAOLA DE L.; SEMIR, JOAO; GROPPO, MILTON; DA COSTA, FERNANDO B.. Metabolomics and chemophenetics support the new taxonomy circumscription of two South America genera (Barnadesioideae, Asteraceae). PHYTOCHEMISTRY LETTERS, v. 40, p. 89-95, DEC 2020. (16/06260-2, 14/16850-6, 14/26866-7)

PADILLA-GONZALEZ, GUILLERMO E.; DIAZGRANADOS, MAURICIO; DA COSTA, FERNANDO B.. Effect of the Andean Geography and Climate on the Specialized Metabolism of Its Vegetation: The Subtribe Espeletiinae (Asteraceae) as a Case Example. METABOLITES, v. 11, n. 4, APR 2021. (16/21183-4, 14/17702-0, 14/26866-7, 10/51454-3)

SOUZA, MARCELO CLARO; SCALON, MARINA CORREA; POSCHENRIEDER, CHARLOTTE; TOLRA, ROSER; VENANCIO, TIAGO; TEIXEIRA, SIMONE PADUA; DA COSTA, FERNANDO BATISTA. Mechanisms of storage and detoxification of Al in two tropical mistletoes. ENVIRONMENTAL AND EXPERIMENTAL BOTANY, v. 150, p. 37-45, JUN 2018. (14/26866-7, 13/21293-6, 10/51454-3)

DE SOUZA, MARCELO CLARO; ROSA, ANNYLORY LIMA; POSCHENRIEDER, CHARLOTTE; TOLRA, ROSER; DA COSTA, FERNANDO BATISTA. Fingerprinting metabolomics in tropical mistletoes: A case study with facultative aluminum-accumulating species. PHYTOCHEMISTRY LETTERS, v. 25, p. 90-94, JUN 2018. (14/26866-7, 13/21293-6, 10/51454-3)

CCANA-CCAPATINTA, V, GARI; FERREIRA, PAOLA L.; GROPPO, MILTON; DA COSTA, FERNANDO B.. Caffeic acid ester derivatives and flavonoids of genus Arnaldoa (Asteraceae, Barnadesioideae). Biochemical Systematics and Ecology, v. 86, OCT 2019. (16/06260-2, 14/26866-7, 14/16850-6)

PADILLA-GONZALEZ, GUILLERMO F.; FREY, MAXIMILIAN; GOMEZ-ZELEDON, JAVIER; DA COSTA, FERNANDO B.; SPRING, OTMAR. Metabolomic and gene expression approaches reveal the developmental and environmental regulation of the secondary metabolism of yacon (Smallanthus sonchifolius, Asteraceae). SCIENTIFIC REPORTS, v. 9, SEP 11 2019. (14/26866-7, 16/21183-4, 14/17702-0)

CHIBLI, LUCAS A.; SCHMIDT, THOMAS J.; CRISTINA NONATO, M.; CALIL, FELIPE A.; DA COSTA, FERNANDO B.. Natural products as inhibitors of Leishmania major dihydroorotate dehydrogenase. EUROPEAN JOURNAL OF MEDICINAL CHEMISTRY, v. 157, p. 852-866, SEP 5 2018. (14/01443-6, 14/26866-7, 16/18579-3, 15/25099-5)

PLAZAS, ERIKA; CASOTI, ROSANA; AVILA MURILLO, MONICA; DA COSTA, FERNANDO BATISTA; ENRIQUE CUCA, LUIS. Metabolomic profiling of Zanthoxylum species: Identification of anti-cholinesterase alkaloids candidates. Phytochemistry, v. 168, DEC 2019. (14/26866-7)