Busca avançada
Ano de início
Entree

Estudo de regiões genômicas de Trichoderma harzianum associadas ao controle da expressão de enzimas envolvidas na degradação de biomassa

Resumo

O estudo da constituição do genoma e das atividades de regulação da expressão gênica do fungo Trichoderma harzianum fornecerá informações importantes sobre os mecanismos genéticos de degradação de biomassa que o fungo utiliza, informações estas que poderão ser utilizadas para outras espécies de fungos filamentosos com potencial para a biodegradação. Desta maneira propõe-se neste projeto a análise de regiões genômicas do Trichoderma harzianum envolvidas com a degradação de celulose e hemicelulose e o estudo de genes e sequencias genômicas relacionados com a regulação e expressão gênica das enzimas que promovem degradação de compostos lignocelulósicos. Estudos anteriores do nosso grupo determinaram o transcriptoma do fungo em condições de biodegradação, através de sequenciamento de nova geração, anotação dos genes e determinação dos níveis de expressão dos genes relacionados à degradação, em especial das frações celulósica e hemicelulósica. Resultados recentes do grupo obtidos pelo sequenciamento de clones BACs (Bacterial Artificial Chromosome) determinaram a existência de regiões genômicas que contém grupos de genes envolvidos na degradação da biomassa, bem como seus prováveis genes acessórios e as respectivas sequências responsáveis pela regulação de sua transcrição. A extensão dos estudos associados aos resultados recentemente obtidos pelo nosso grupo trará grande impacto nas descobertas da regulação e expressão dos genes responsáveis pela biodegradação em T. harzianum. Desta maneira, o próximo passo é a análise e determinação dos mecanismos de regulação da expressão gênica, proposto neste projeto. Para o estudo pretende-se proceder à fermentação de outras linhagens de T. harzianum (CBMAI 0020 e CBMAI 0179) e Trichoderma reesei, determinar o transcriptoma e o exoproteoma das fermentações. Em seguida, determinar os genes expressos potencialmente envolvidos nas reações de degradação por meio de análise da transcrição global e analisar a estrutura genômica (sequencias, genes e motifs) presente em regiões do genoma de T. harzianum IOC3844 comparativamente com as linhagens CBMAI 0020, CBMAI 0179 e T. reesei (CBMAI 711). Esta análise será realizada através da anotação das sequências de BACs previamente selecionadas a partir da biblioteca de BACs já existente no laboratório (para linhagem IOC3844) e de outras duas bibliotecas reduzidas a serem construídas para as linhagens CBMAI 0020 e CBMAI 0179. Desta forma, por meio da análise das diferenças na expressão entre os genes, proteínas presentes no exoproteoma e perfil do transcriptoma das diferentes linhagens, espera-se identificar elementos nas sequências de BACs das três diferentes linhagens que possam responder pela diferença na expressão gênica. (AU)

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre o auxílio:
Matéria(s) publicada(s) em Outras Mídias (0 total):
Mais itensMenos itens
VEICULO: TITULO (DATA)
VEICULO: TITULO (DATA)

Publicações científicas (7)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
ALMEIDA, DEBORAH AIRES; CRIVELENTE HORTA, MARIA AUGUSTA; FERREIRA FILHO, JAIRE ALVES; MURAD, NATALIA FARAJ; DE SOUZA, ANETE PEREIRA. The synergistic actions of hydrolytic genes reveal the mechanism of Trichoderma harzianum for cellulose degradation. Journal of Biotechnology, v. 334, p. 1-10, JUN 20 2021. Citações Web of Science: 0.
LEAL MOTTA, MARIA LORENZA; FERREIRA FILHO, JAIRE ALVES; DE MELO, RICARDO RODRIGUES; ZANPHORLIN, LETICIA MARIA; DOS SANTOS, CLELTON APARECIDO; DE SOUZA, ANETE PEREIRA. A novel fungal metal-dependent alpha-l-arabinofuranosidase of family 54 glycoside hydrolase shows expanded substrate specificity. SCIENTIFIC REPORTS, v. 11, n. 1 MAY 26 2021. Citações Web of Science: 0.
FERREIRA FILHO, JAIRE A.; HORTA, MARIA AUGUSTA C.; DOS SANTOS, CLELTON A.; ALMEIDA, DEBORAH A.; MURAD, NATALIA F.; MENDES, JULIANO S.; SFORCA, DANILO A.; SILVA, CLAUDIO BENICIO C.; CRUCELLO, ALINE; DE SOUZA, ANETE P. ``Integrative genomic analysis of the bioprospection of regulators and accessory enzymes associated with cellulose degradation in a filamentous fungus (Trichoderma harzianum){''}. BMC Genomics, v. 21, n. 1 NOV 2 2020. Citações Web of Science: 0.
SANTOS, CLELTON A.; MORAIS, MARIANA A. B.; TERRETT, OLIVER M.; LYCZAKOWSKI, JAN J.; ZANPHORLIN, LETICIA M.; FERREIRA, JAIRE A.; TONOLI, CELISA C. C.; MURAKAMI, MARIO T.; DUPREE, PAUL; SOUZA, ANETE P. An engineered GH1 ss-glucosidase displays enhanced glucose tolerance and increased sugar release from lignocellulosic materials. SCIENTIFIC REPORTS, v. 9, MAR 20 2019. Citações Web of Science: 2.
CRIVELENTE HORTA, MARIA AUGUSTA; FERREIRA FILHO, JAIRE ALVES; MURAD, NATALIA FARAJ; SANTOS, EIDY DE OLIVEIRA; DOS SANTOS, CLELTON APARECIDO; MENDES, JULIANO SALES; BRANDAO, MARCELO MENDES; AZZONI, SINDELIA FREITAS; DE SOUZA, ANETE PEREIRA. Network of proteins, enzymes and genes linked to biomass degradation shared by Trichoderma species. SCIENTIFIC REPORTS, v. 8, JAN 22 2018. Citações Web of Science: 5.
FERREIRA FILHO, JAIRE ALVES; CRIVELENTE HORTA, MARIA AUGUSTA; BELOTI, LILIAN LUZIA; DOS SANTOS, CLELTON APARECIDO; DE SOUZA, ANETE PEREIRA. Carbohydrate-active enzymes in Trichoderma harzianum: a bioinformatic analysis bioprospecting for key enzymes for the biofuels industry. BMC Genomics, v. 18, OCT 12 2017. Citações Web of Science: 4.
SANTOS, CLELTON A.; FERREIRA-FILHO, JAIRE A.; O'DONOVAN, ANTHONIA; GUPTA, VIJAI K.; TUOHY, MARIA G.; SOUZA, ANETE P. Production of a recombinant swollenin from Trichoderma harzianum in Escherichia coli and its potential synergistic role in biomass degradation. Microbial Cell Factories, v. 16, MAY 16 2017. Citações Web of Science: 4.
Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

Por favor, reporte erros na lista de publicações científicas escrevendo para: cdi@fapesp.br.