Busca avançada
Ano de início
Entree

Isolamento de microssatélites e de SNPs em garça-vaqueira (Bubulcus ibis, Ardeidae, aves) e sua aplicação em estudos familiais e populacionais

Processo: 16/01673-7
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de julho de 2016 - 30 de junho de 2018
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
Pesquisador responsável:Silvia Nassif Del Lama
Beneficiário:Silvia Nassif Del Lama
Instituição-sede: Centro de Ciências Biológicas e da Saúde (CCBS). Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR). São Carlos , SP, Brasil
Pesq. associados: Carolina Isabel Miño
Assunto(s):Aves  Repetições de microssatélites  Comportamento reprodutivo  Polimorfismo de um único nucleotídeo 

Resumo

Essa proposta objetiva isolar novos marcadores genético, do tipo microssatélites e SNPs (Polimorfismos de nucleotídeo único) e aplicá-los nos estudos familiais e populacionais da garça-vaqueira (Bubulcus ibis). O painel dos microssatélites polimórficos será ampliado com o uso de dados gerados pelo sequenciamento de próxima geração (NGS). Os SNPs serão identificados pelo método GBS (Genotipagem pelo Sequenciamento). Após isolamento, genótipos nesses novos locos de microssatélites serão identificados em todos integrantes de 30 famílias, parentais e filhotes, e o parentesco será verificado pela análise mendeliana e pela análise de máxima verossimilhança. Será confirmada ou não a ocorrência de comportamentos alternativos à monogamia (Fertilização Extra-par e Parasitismo de Ninho Intraespecífico). Os genótipos nos locos de microssatélites serão levantados em quatro populações africanas e em uma representativa do Brasil para averiguar o nível de diversidade genética dessas populações e se elas se diferenciam geneticamente. Os SNPs serão usados nas mesmas amostras para análises populacionais e determinação do nível de diversidade e de estruturação genética. Os resultados das análises populacionais com os dois tipos de marcadores moleculares (microssatélites e SNPs) serão comparados entre si e o esperado é obter um grau muito mais alto de discriminação populacional com os SNPs do que com os microssatélites. Os resultados populacionais permitirão inferir se há um grau de diferenciação e isolamento entre as populações dos dois continentes, esclarecendo se o resultado obtido no projeto anterior é ou não um artefato, devido à baixa variação dos locos usados, ou se ocorre um fluxo de entrada de aves contínuo da África para o Brasil. (AU)

Publicações científicas (5)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
VILLAR COUTO, CYNTHIA M.; CUMMING, GRAEME S.; LACORTE, GUSTAVO A.; CONGRAINS, CARLOS; IZBICKI, RAFAEL; BRAGA, ERIKA MARTINS; ROCHA, CRISTIANO D.; MORALEZ-SILVA, EMMANUEL; HENRY, DOMINIC A. W.; MANU, SHIIWUA A.; ABALAKA, JACINTA; REGALLA, AISSA; DA SILVA, ALFREDO SIMAO; DIOP, MOUSSA S.; DEL LAMA, SILVIA N. Avian haemosporidians in the cattle egret (Bubulcus ibis) from central-western and southern Africa: High diversity and prevalence. PLoS One, v. 14, n. 2 FEB 22 2019. Citações Web of Science: 0.
DA SILVA, FAGNER M.; MINO, CAROLINA I.; IZBICKI, RAFAEL; DEL LAMA, SILVIA N. Considerations for monitoring population trends of colonial waterbirds using the effective number of breeders and census estimates. ECOLOGY AND EVOLUTION, v. 8, n. 16, p. 8088-8101, AUG 2018. Citações Web of Science: 0.
CHAHAD-EHLERS, SAMIRA; FUSHITA, ANGELA TERUMI; LACORTE, GUSTAVO AUGUSTO; PEREIRA DE ASSIS, PAMELA CARLA; DEL LAMA, SILVIA NASSIF. Effects of habitat suitability for vectors, environmental factors and host characteristics on the spatial distribution of the diversity and prevalence of haemosporidians in waterbirds from three Brazilian wetlands. PARASITES & VECTORS, v. 11, MAY 2 2018. Citações Web of Science: 2.
MORALEZ-SILVA, EMMANUEL; DEL LAMA, SILVIA NASSIF. Multiple Females Laying in Cattle Egret (&ITBubulcus ibis&IT) Clutches: Behavioral and Genetic Evidence. WATERBIRDS, v. 40, n. 4, p. 403-409, DEC 2017. Citações Web of Science: 0.
MINO, CAROLINA ISABEL; DE SOUZA, ELAINE DANTAS; MORALEZ-SILVA, EMMANUEL; VALDES, TALITA ALVARENGA; CORTICO CORREA RODRIGUES, VERA LUCIA; DEL LAMA, SILVIA NASSIF. Use of noninvasive `bug-eggs' to enable comparative inferences on genetic mating system with and without parental information: A study in a cattle egret colony. PLoS One, v. 12, n. 8 AUG 30 2017. Citações Web of Science: 1.

Por favor, reporte erros na lista de publicações científicas escrevendo para: cdi@fapesp.br.
Mapa da distribuição dos acessos desta página
Para ver o sumário de acessos desta página, clique aqui.