Estudo proteômico dirigido da localização e translocação subcelular de proteínas na transição epitélio-mesenquimal

• Processo: 16/03809-3
• Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Vigência: 01 de agosto de 2016 - 31 de julho de 2018
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Química de Macromoléculas
• Pesquisador responsável: Vitor Marcel Faça
• Beneficiário: Vitor Marcel Faça
• Instituição-sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Pesq. associados: Aline Poersch ; Andrea Gutierrez Maria ; Carolina Hassibe Thomé
• Auxílios(s) vinculado(s): 17/50031-0 - Identification of novel mediators of age-associated chronic inflammation and cancer development through targeted proteomics, AP.R SPRINT
• Assunto(s): Proteômica Transporte proteico Transição epitelial-mesenquimal Metástase neoplásica Fracionamento celular

Resumo

O proteôma é um sistema multidimensional e altamente dinâmico, no qual cada proteína apresenta várias propriedades interconectadas, que conjuntamente representam o fenótipo de uma célula ou organismo. A medida precisa destas propriedades é algo particularmente desafiador devido a diversidade e dinâmica das proteínas. Com os avanços em espectrometria de massas voltada ao estudo de proteômas, várias medidas de abundância, localização celular, síntese/degradação, modificações pós-traducionais, etc, começam a ser analisadas de maneira integrada, permitindo uma melhor compreensão de processos fisiológicos e celulares. Especificamente, a localização subcelular de proteínas e o seu tráfico entre subcompartimentos representam fatores fundamentais para a correta função das mesmas, pois a localização aberrante de proteínas contribui para a patogênese de diversas doenças humanas, entre elas o câncer. Em várias situações, esta localização aberrante está associada a presença de modificações pós-traducionais e/ou de interações proteína-proteína não comuns. Portanto, o estudo proteômico multidimensional é uma ferramenta importante para a compreensão de mecanismos patogênicos. Neste contexto, o presente projeto objetiva avaliar quantitativamente alterações na localização de proteínas, bem como as potenciais modificações pós-traducionais responsáveis por estas alterações, associadas ao processo de metástase do câncer. Para tal, serão utilizados modelos de indução da transição epitélio-mesenquimal (EMT) em linhagens de adenocarcinoma já estabelecidos em nosso grupo para representar a progressão e metástase do câncer. As alterações multidimensionais do proteôma serão avaliadas pela combinação de métodos de fracionamento subcelular e proteômica dirigida, a fim de gerar perfis de correlação proteica (PCPs), possibilitando uma análise quantitativa, temporal e, consequentemente, de processos de transporte e translocação entre subcompartimentos celulares. A inibição funcional ou knockout/knockdown de proteínas-alvo permitirá validar o papel da alteração de localização subcelular na regulação de processos biológicos importantes para a EMT. Este projeto promove, portanto, além do desenvolvimento de métodos proteômicos multidimensionais modernos para análise de mecanismos celulares complexos, a verificação e estudo de processos potencialmente relevantes para o desenvolvimento de novas estratégias terapêuticas para detectar e prevenir a metástase do câncer. (AU)

Publicações científicas

(4)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

LANFREDI, GUILHERME P.; THOME, CAROLINA H.; FERREIRA, GERMANO A.; SILVESTRINI, VIRGINIA C.; MASSON, ANA P.; VARGAS, ALESSANDRA P.; GRASSI, MARIANA L.; POERSCH, ALINE; CANDIDO DOS REIS, FRANCISCO J.; FACA, VITOR M. Analysis of ovarian cancer cell secretome during epithelial to mesenchymal transition reveals a protein signature associated with advanced stages of ovarian tumors. BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-PROTEINS AND PROTEOMICS, v. 1869, n. 6 JUN 2021. Citações Web of Science: 0.

THOME, CAROLINA HASSIBE; FERREIRA, GERMANO AGUIAR; PEREIRA-MARTINS, DIEGO ANTONIO; DOS SANTOS, GUILHERME AUGUSTO; ORTIZ, CESAR ALEXANDER; BOTELHO DE SOUZA, LUCAS EDUARDO; SOBRAL, LAYS MARTINS; ARAUJO SILVA, CLEIDE LUCIA; SCHEUCHER, PRISCILA SANTOS; GIL, CRISTIANE DAMAS; LEOPOLDINO, ANDREIA MACHADO; SILVEIRA, DOUGLAS R. A.; COELHO-SILVA, JUAN L.; TRAINA, FABIOLA; KOURY, LUISA C.; MELO, RAUL A. M.; BITTENCOURT, ROSANE; PAGNANO, KATIA; PASQUINI, RICARDO; NUNES, ELENAIDE C.; FAGUNDES, EVANDRO M.; GLORIA, ANA BEATRIZ F.; KERBAUY, FABIO RODRIGUES; CHAUFFAILLE, MARIA DE LOURDES; KEATING, ARMAND; TALLMAN, MARTIN S.; RIBEIRO, RAUL C.; DILLON, RICHARD; GANSER, ARNOLD; LOWENBERG, BOB; VALK, PETER; LO-COCO, FRANCESCO; SANZ, MIGUEL A.; BERLINER, NANCY; FACA, VITOR MARCEL; REGO, EDUARDO M. NTAL is associated with treatment outcome, cell proliferation and differentiation in acute promyelocytic leukemia. SCIENTIFIC REPORTS, v. 10, n. 1 JUN 25 2020. Citações Web of Science: 0.

SILVESTRINI, VIRGINIA CAMPOS; THOME, CAROLINA HASSIBE; ALBUQUERQUE, DANIELE; PALMA, CAMILA DE SOUZA; FERREIRA, GERMANO AGUIAR; LANFREDI, GUILHERME PAUPERIO; MASSON, ANA PAULA; ALBERICI DELSIN, LARA ELIS; FERREIRA, FERNANDA URSOLI; DE SOUZA, FELIPE CANTO; FRANCO DE GODOY, LYRIS MARTINS; AQUINO, ADRIANO; CARRILHO, EMANUEL; PANEPUCCI, RODRIGO ALEXANDRE; COVAS, DIMAS TADEU; FACA, VITOR MARCEL. Proteomics analysis reveals the role of ubiquitin specific protease (USP47) in Epithelial to Mesenchymal Transition (EMT) induced by TGF beta 2 in breast cells. JOURNAL OF PROTEOMICS, v. 219, MAY 15 2020. Citações Web of Science: 0.

SILVESTRINI, VIRGINIA CAMPOS; LANFREDI, GUILHERME PAUPERIO; MASSON, ANA PAULA; POERSCH, ALINE; FERREIRA, GERMANO AGUIAR; THOME, CAROLINA HASSIBE; FACA, VITOR MARCEL. A proteomics outlook towards the elucidation of epithelial-mesenchymal transition molecular events. MOLECULAR OMICS, v. 15, n. 5, p. 316-330, OCT 1 2019. Citações Web of Science: 0.