EMU: aquisição de um espectrômetro de massas acoplado a cromatografia líquida para...
- Auxílios pontuais (curta duração)
Resumo
O espectrômetro de massas do tipo quadrupolo-orbitrap híbrido QExactive Plus da empresa Thermo Scientific será utilizado em todos os sub-projetos dentro do projeto "Abordagem racional na busca por alvos moleculares envolvidos nos eventos de inflamação e sobrevivência celular" que envolvam análises proteômicas visando a identificação de proteínas em amostras complexas. Para tal, este espectrômetro de massas de última geração permitirá a detecção de proteínas em baixas concentrações cobrindo uma vasta faixa dinâmica em amostras biológicas in vitro, preparados de células em cultura ou de tumores extraídos de animais. Além disso, este equipamento será utilizado para quantificar as proteínas identificadas em diferentes condições. Além de apresentar uma altíssima resolução que atinge a ordem de 140.000, sendo que os demais equipamentos similares do tipo QTof chegam a apenas 50.000, e precisão de massas na ordem de 1 a 3ppm (sendo os demais entre 5 a 10ppm), o QExactive Plus é o único equipamento comparado aos demais equipamentos similares que permite a quantificação utilizando a metodologia PRM, do inglês Monitoramento de Reações em Paralelo (Parallel Reaction Monitoring). Esta metodologia de quantificação é realizada injetando junto com a amostra biológica complexa, peptídeos de fragmentos de proteínas às quais se deseja monitorar e quantificar. Esta metodologia conhecida como targeted quantification ou, quantificação-alvo permite a quantificação relativa e absoluta de dezenas de proteínas simultaneamente sem a necessidade de varredura de todo o proteoma da amostra. Em suma, o espectrômetro de massas QExactive Plus será essencial na identificação dos alvos moleculares poderá ser realizada inicialmente no modo de varredura completa do proteoma e os monitoramentos desses alvos específicos poderão ser feitos pelo método PRM. (AU)