Elucidating the role of disorder during biomolecular fuction

• Processo: 14/50739-5
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de maio de 2017
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2019
• Área do conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Física - Física da Matéria Condensada
• Proposta de Mobilidade: SPRINT - Projetos de pesquisa - Mobilidade
• Pesquisador responsável: Vitor Barbanti Pereira Leite
• Beneficiário: Vitor Barbanti Pereira Leite
• Pesquisador Responsável no exterior: Paul Charles Whitford
• Instituição Parceira no exterior: Northeastern University, Estados Unidos
• Instituição Sede: Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (IBILCE). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de São José do Rio Preto. São José do Rio Preto , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 14/06862-7 - Estudos computacionais em enovelamento de proteínas e engenharia de enzimas envolvidas na geração de bioetanol, AP.R
• Assunto(s): Biofísica Dinâmica molecular de proteínas Proteínas ras Receptores de estrogênio Simulação de dinâmica molecular
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Fisica

Resumo

A compreensão da relação entre estrutura, energética e dinâmica funcional de proteínas é um grande desafio em biofísica molecular. Neste projeto, vamos reunir uma equipe bi-nacional e multi-institucional de grupos de pesquisa que visam revelar como desordem molecular é utilizada durante a função biológica. Em particular, vamos investigar como a desordem parcial transiente está ligada a grandes transições conformacionais em Ras GTPase e do domínio de ligação do receptor de estrogênio. Por meio de esforços combinados de cristalografia de raios-X e mutagênese, espectroscopia de EPR e simulações moleculares, vamos elucidar os determinantes moleculares que governam transições conformacionais de grande escala associados à função nestas proteínas. Ao estudar ambas as proteínas, esperamos que a elucidação do papel da desordem durante a função, e as ferramentas para a caracterização de doença, sejam transferíveis. Assim, a descoberta científica para cada sistema será mutuamente benéfica, permitindo que a nossa equipe elabore perspectivas mais amplas sobre os princípios físico-químicos que regulam a dinâmica biológica. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

DE OLIVEIRA, VINICIUS M.; DIAS, MARIELI M. G.; AVELINO, THAYNA M.; VIDEIRA, NATALIA B.; DA SILVA, FERNANDO B.; DORATIOTO, TABATA R.; WHITFORD, PAUL C.; LEITE, VITOR B. P.; FIGUEIRA, ANA CAROLINA M.. pH and the Breast Cancer Recurrent Mutation D538G Affect the Process of Activation of Estrogen Receptor alpha. BIOCHEMISTRY, v. 61, n. 6, p. 9-pg., 2022-02-21. (18/11614-3, 19/10274-7, 14/50739-5, 16/02348-2, 19/22540-3, 16/19766-1, 19/14465-1)

OLIVEIRA, JR., ANTONIO B.; YANG, HUAN; WHITFORD, PAUL C.; LEITE, VITOR B. P.. Distinguishing Biomolecular Pathways and Metastable States. JOURNAL OF CHEMICAL THEORY AND COMPUTATION, v. 15, n. 11, p. 6482-6490, NOV 2019. (16/19766-1, 14/50739-5, 18/18668-1)

YANG, HUAN; BANDARKAR, PRASAD; HORNE, RANSOM; LEITE, VITOR B. P.; CHAHINE, JORGE; WHITFORD, PAUL C.. Diffusion of tRNA inside the ribosome is position-dependent. Journal of Chemical Physics, v. 151, n. 8, AUG 28 2019. (16/19766-1, 14/50739-5, 18/18668-1)