Análise do Perfil de transcrição durante o processo de indução fotoperiódica em cana-de-açúcar via RNA-seq

• Processo: 16/02679-9
• Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Vigência: 01 de setembro de 2016 - 28 de fevereiro de 2019
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia - Fitotecnia
• Pesquisador responsável: Luciana Rossini Pinto Machado da Silva
• Beneficiário: Luciana Rossini Pinto Machado da Silva
• Instituição-sede: Instituto Agronômico (IAC). Agência Paulista de Tecnologia dos Agronegócios (APTA). Secretaria de Agricultura e Abastecimento (São Paulo - Estado). Campinas , SP, Brasil
• Pesq. associados: Elisson Antonio da Costa Romanel ; Maximiliano Salles Scarpari ; Michael dos Santos Brito ; Renato Vicentini dos Santos
• Auxílios(s) vinculado(s): 18/08380-0 - Identificação de genes alvos para manipulação do florecimento em cana-de-açúcar, AP.R SPRINT
• Assunto(s): Fotoperíodo Floração Expressão gênica

Resumo

No Brasil, os programas de melhoramento genético de cana-de-açúcar tem impactado positivamente o setor sucroenergético pelo desenvolvimento de cultivares produtivas e adaptadas as diferentes condições edafoclimáticas do país. O florescimento é um dos fatores relevantes para esta cultura. Apesar de sua importância, ainda é escasso, em cana-de-açúcar, o conhecimento dos genes envolvidos durante o processo de indução fotoperiódica, sendo que a investigação de genes diferencialmente expressos em condições controladas de indução fotoperiódica, de fato, ainda precisa ser explorada. O presente projeto tem como objetivo principal estudar o transcriptoma de uma cultivar de cana-de-açúcar durante a indução fotoperiódica do florescimento identificando genes diferencialmente expressos, via aplicação da técnica de RNA-seq (RNA-sequencing). Os dados obtidos serão também explorados para a obtenção de marcadores SSRs e SNPs. Para tanto, uma cultivar de cana-de-açúcar será submetida a tratamentos fotoperiódicos de indução e não indução do florescimento em Câmara de fotoperíodo automatizada, por um período que compreende o início da indução até o florescimento, sendo que o tempo de coleta correspondente à mudança do estádio vegetativo para o reprodutivo será utilizado para a análise de RNA-seq. Para o nosso conhecimento, até o presente momento, o transcriptoma da cana-de-açúcar durante a indução do florescimento, em condições controladas de fotoperíodo ainda não foi investigado caracterizando a presente proposta de pesquisa como de grande potencial para trazer à luz genes críticos ao florescimento de cana-de-açúcar contribuindo para a bioeconomia agrícola do país. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

DA SILVA SANTOS, PAULO H.; VIEIRA MANECHINI, JOAO R.; BRITO, MICHAEL S.; ROMANEL, ELISSON; VICENTINI, RENATO; SCARPARI, MAXIMILIANO; JACKSON, STEPHEN; PINTO, LUCIANA R.. Selection and validation of reference genes by RT-qPCR under photoperiodic induction of flowering in sugarcane (Saccharum spp.). SCIENTIFIC REPORTS, v. 11, n. 1, FEB 25 2021. (16/02679-9, 18/08380-0)

MANECHINI, JOAO RICARDO VIEIRA; SANTOS, PAULO HENRIQUE DA SILVA; ROMANEL, ELISSON; BRITO, MICHAEL DOS SANTOS; SCARPARI, MAXIMILIANO SALLES; JACKSON, STEPHEN; PINTO, LUCIANA ROSSINI; VICENTINI, RENATO. Transcriptomic Analysis of Changes in Gene Expression During Flowering Induction in Sugarcane Under Controlled Photoperiodic Conditions. FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, v. 12, JUN 15 2021. (18/08380-0, 16/02679-9)