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Análise do perfil de transcrição durante o processo de indução fotoperiódica em cana-de-açúcar via RNA-seq

Processo: 16/02679-9
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de setembro de 2016 - 28 de fevereiro de 2019
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Agronomia - Fitotecnia
Pesquisador responsável:Luciana Rossini Pinto Machado da Silva
Beneficiário:Luciana Rossini Pinto Machado da Silva
Instituição-sede: Instituto Agronômico (IAC). Agência Paulista de Tecnologia dos Agronegócios (APTA). Secretaria de Agricultura e Abastecimento (São Paulo - Estado). Campinas , SP, Brasil
Pesq. associados:Elisson Antonio da Costa Romanel ; Maximiliano Salles Scarpari ; Michael dos Santos Brito ; Renato Vicentini dos Santos
Auxílios(s) vinculado(s):18/08380-0 - Identificação de genes alvos para manipulação do florecimento em cana-de-açúcar, AP.R SPRINT
Assunto(s):Fotoperíodo  Floração  Expressão gênica 

Resumo

No Brasil, os programas de melhoramento genético de cana-de-açúcar tem impactado positivamente o setor sucroenergético pelo desenvolvimento de cultivares produtivas e adaptadas as diferentes condições edafoclimáticas do país. O florescimento é um dos fatores relevantes para esta cultura. Apesar de sua importância, ainda é escasso, em cana-de-açúcar, o conhecimento dos genes envolvidos durante o processo de indução fotoperiódica, sendo que a investigação de genes diferencialmente expressos em condições controladas de indução fotoperiódica, de fato, ainda precisa ser explorada. O presente projeto tem como objetivo principal estudar o transcriptoma de uma cultivar de cana-de-açúcar durante a indução fotoperiódica do florescimento identificando genes diferencialmente expressos, via aplicação da técnica de RNA-seq (RNA-sequencing). Os dados obtidos serão também explorados para a obtenção de marcadores SSRs e SNPs. Para tanto, uma cultivar de cana-de-açúcar será submetida a tratamentos fotoperiódicos de indução e não indução do florescimento em Câmara de fotoperíodo automatizada, por um período que compreende o início da indução até o florescimento, sendo que o tempo de coleta correspondente à mudança do estádio vegetativo para o reprodutivo será utilizado para a análise de RNA-seq. Para o nosso conhecimento, até o presente momento, o transcriptoma da cana-de-açúcar durante a indução do florescimento, em condições controladas de fotoperíodo ainda não foi investigado caracterizando a presente proposta de pesquisa como de grande potencial para trazer à luz genes críticos ao florescimento de cana-de-açúcar contribuindo para a bioeconomia agrícola do país. (AU)