Busca avançada
Ano de início
Entree

Estudos estruturais acerca do trocador de Na+/Ca2+ e de proteínas do vírus Zika por espectroscopia de Ressonância Magnética Nuclear em solução

Processo: 16/07490-1
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de setembro de 2016 - 31 de agosto de 2018
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
Pesquisador responsável:Roberto Kopke Salinas
Beneficiário:Roberto Kopke Salinas
Instituição-sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Pesq. associados: Simona Tomaselli
Assunto(s):Vírus Zika  Ressonância magnética nuclear 

Resumo

O objetivo deste projeto de pesquisa é dar continuidade a estudos estruturais e mecanísticos acerca do trocador de Na+/Ca2+ (NCX) utilizando para isso Ressonância Magnética Nuclear (RMN) em solução. O NCX é um dos principais mecanismos de extrusão de Ca2+ intracelular em células cardíacas. Além de transportar Na+ e Ca2+, o NCX também é regulado por estes íons. O NCX é uma proteína grande, com cerca de 950 amino ácidos que formam um grande domínio transmembranar, domínios citosólicos e regiões desordenadas. Este caráter multifacetado faz com que a caracterização estrutural do NCX seja uma tarefa difícil. Com base em estudos de RMN dos domínios solúveis do NCX de Drosophila melanogaster, CALX, propusemos um modelo para o mecanismo de regulação alosterica do NCX e do CALX (Abiko et al. (2016) Proteins. doi:10.1002/prot.25003). Esta proposta pretende dar continuidade a estes estudos, e iniciar a caracterização estrutural das porções transmembranares necessária para testar diferentes aspectos do modelo. Além disso, pretende-se estudar proteínas do vírus da Zika que desempenham papel essencial nos mecanismos de entrada e replicação do vírus nas células. As proteínas de interesse são a glicoproteína do envelope (E), a proteína NS1 que interage com o sistema imune, e NS2B-NS3pro, a protease do vírus. Se houver tempo, pretende-se utilizar técnicas de transferência de saturação (STD) para testar diferentes ligantes que possam funcionar como inibidores de entrada do vírus ou replicação. Espera-se que estes estudos contribuam para uma maior compreensão da biologia e patogenicidade deste vírus, e para o desenvolvimento de drogas antivirais de amplo espectro no futuro. (AU)

Publicações científicas (5)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
V.V. DE SOUZA; P.A.M. VITALE; F.H. FLORENZANO; R.K. SALINAS; I.M. CUCCOVIA. A novel method for DNA delivery into bacteria using cationic copolymers. Brazilian Journal of Medical and Biological Research, v. 54, n. 5, p. -, 2021. Citações Web of Science: 0.
CARDOSO, MARCUS V. C.; RIVERA, JOSE D.; VITALE, PHELIPE A. M.; DEGENHARDT, MAXIMILIA F. S.; ABIKO, LAYARA A.; OLIVEIRA, CRISTIANO L. P.; SALINAS, ROBERTO K. CALX-CBD1 Ca2+-Binding Cooperativity Studied by NMR Spectroscopy and ITC with Bayesian Statistics. BIOPHYSICAL JOURNAL, v. 119, n. 2, p. 337-348, JUL 21 2020. Citações Web of Science: 0.
SARAIVA, G. K. V.; DE SOUZA, V. V.; COUTINHO DE OLIVEIRA, L.; NORONHA, M. L. C.; MASINI, J. C.; CHAIMOVICH, H.; SALINAS, R. K.; FLORENZANO, F. H.; CUCCOVIA, I. M. Characterization of PMMA-b-PDMAEMA aggregates in aqueous solutions. COLLOID AND POLYMER SCIENCE, v. 297, n. 4, p. 557-569, APR 2019. Citações Web of Science: 0.
DAMASCENO, TICIANE F.; DIAS, RENATA O.; DE OLIVEIRA, JULIANA R.; SALINAS, ROBERTO K.; JULIANO, MARIA A.; FERREIRA, CLELIA; TERRA, WALTER R. Active subsite properties, subsite residues and targeting to lysosomes or midgut lumen of cathepsins L from the beetle Tenebrio molitor. Insect Biochemistry and Molecular Biology, v. 89, p. 17-30, OCT 2017. Citações Web of Science: 3.
SANZ, MIRIAM; SALINAS, ROBERTO KOPKE; PINTO, ERNANI. Namalides B and C and Spumigins K-N from the Cultured Freshwater Cyanobacterium Sphaerospermopsis torques-reginae. Journal of Natural Products, v. 80, n. 9, p. 2492-2501, SEP 2017. Citações Web of Science: 3.

Por favor, reporte erros na lista de publicações científicas escrevendo para: cdi@fapesp.br.