Busca avançada
Ano de início
Entree

Redes regulatórias e sinalização associadas à cana energia

Processo: 14/50921-8
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Programa BIOEN - Temático
Vigência: 01 de setembro de 2016 - 31 de agosto de 2021
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Glaucia Mendes Souza
Beneficiário:Glaucia Mendes Souza
Instituição-sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Pesquisadores principais:Helaine Carrer
Bolsa(s) vinculada(s):19/17104-0 - Avaliação dos componentes de parede celular de progênies de cana-de-açúcar contrastantes para produção de biomassa, BP.IC
19/05397-2 - Desenvolvimento e gerenciamento de ferramentas de bioinformática para a plataforma SUCEST-FUN, BP.TT
18/17561-9 - Elementos regulatórios do metabolismo de carbono em cana-de-açúcar, BP.DD
+ mais bolsas vinculadas 18/13520-6 - Análises morfológicas e agrotecnológicas de progênies de Saccharum spp, BP.TT
18/09867-0 - Obtenção da cana energia por transgenia, BP.PD
17/14279-8 - Análise fenotípica de progênie de cana-energia e cultivo in vitro de variedades comerciais de cana-de-açúcar, BP.TT
17/02842-0 - Desenvolvimento de ferramentas de bioinformática para a plataforma SUCEST-FUN, BP.TT
17/02270-6 - Avaliação do transcriptoma de progênies contrastantes para o acúmulo de biomassa e identificação de redes de regulação, BP.PD
17/02851-9 - Avaliação de parâmetros bioquímicos e fisiológicos em progênies contrastantes de cana-energia, BP.IC
17/01515-5 - Análise fenotípica de progênie de cana-energia e transformação genética de variedades comerciais de cana-de-açúcar, BP.TT
16/21008-8 - Estudo dos metabólitos de cana-de-açúcar ao longo do seu desenvolvimento em campo, BP.DD - menos bolsas vinculadas
Assunto(s):Biologia computacional  Biologia de sistemas  Cana-de-açúcar  Cana-energia  Metaboloma  Transcriptoma 

Resumo

Nós pretendemos acrescentar conhecimento ao sistema cana-de-açúcar, usando abordagens de análise da fisiologia, de análise de elementos regulatórios, do transcriptoma e do metaboloma em variedades comerciais e em cruzamentos com espécies ancestrais em plantios que se assemelham ao realizado nas indústrias sucroalcooleiras e também em experimentos em casa de vegetação. O estudo das redes regulatórias de cana-de-açúcar será feito com auxílio da técnica de Chip-Seq e de RNAseq com as quais poderemos identificar possíveis regiões regulatórias é promotoras no genoma referência de cana-de-açúcar sequenciado e parcialmente montado pelo grupo e colaboradores/ Através da utilização de abordagens da Biologia de Sistemas e biologia sintética, iremos definir os principais alvos ou redes de genes para o melhoramento da cana-de-açúcar com o aumento de sua produtividade, alteração do conteúdo de sacarose, fibra e lignina e assim desenvolver a Cana-Energia O grande volume de dados gerado será armazenado no banco de dados SUCEST-FUN (http://sucest-fun.org) onde é possível avaliar e interrogar os dados com foco em diferentes aspectos. (AU)

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre o auxílio:
Concluído o maior sequenciamento do genoma da cana-de-açúcar comercial 
Doutorado direto em Bioinformática e Genômica com bolsa da FAPESP  
Pós-doutorado em Biologia Molecular de Plantas com Bolsa da FAPESP  
Pós-Doutorado em Genômica e Bioinformática de cana-de-açúcar com Bolsa da FAPESP 
Matéria(s) publicada(s) em Outras Mídias (55 total):
Mais itensMenos itens
Concluyen la mayor secuenciación del genoma de la caña de azúcar comercial 
Publican la secuencia genómica más completa de la caña de azúcar comercial 
Publican la secuencia genómica más completa de la caña de azúcar comercial 
Científicos brasileños publican la secuencia genómica más completa de caña de azúcar comercial 
Científicos brasileños publican la secuencia genómica más completa de caña de azúcar comercial 
Cientistas brasileiras lideram o maior e mais completo mapeamento genético já feito da cana-de-açúcar 
Cientistas brasileiras quebram um recorde da genética 
Concluyen la mayor secuenciación del genoma de la caña de azúcar comercial 
Concluído o maior sequenciamento do genoma da cana-de-açúcar comercial 
Científicos brasileños publican la secuencia genómica más completa de la caña de azúcar comercial 
Montada sequência de genoma mais completo da cana 
Most complete commercial sugarcane genome sequence assembled 
Cientistas brasileiras lideram mapeamento genético da cana-de-açúcar 
Montada sequência de genoma mais completo da cana 
Montada sequência de genoma mais completo da cana 
Cientistas do Brasil decifram genoma da cana-de-açúcar 
Brazilian scientists sequence “most complete” commercial sugarcane genome 
Concluído o maior sequenciamento do genoma da cana-de-açúcar comercial 
Concluído maior sequenciamento do genoma da Cana-de-Açúcar comercial 
Duas cientistas brasileiras lideram o maior e mais completo mapeamento genético já feito da cana-de-açúcar 
Montada sequência de genoma mais completo da cana 
Cientistas quebram um recorde da genética com o sequenciamento do genoma da cana-de-açúcar 
Cientistas brasileiras quebraram um recorde de genética 
Pesquisadores desvendam genoma da cana de açúcar 
MAIS SEQUCIA COMERCIAL ABRANGENTE DO GENOMA DE CANA MONTADO 
Grupo da USP publica o mais completo genoma da cana 
Concluído o maior sequenciamento do genoma da cana-de-açúcar comercial 
Concluído o maior sequenciamento do genoma da cana-de-açúcar comercial 
Grupo da USP publica o mais completo genoma da cana-de-açúcar 
Grupo da USP publica o mais completo genoma da cana 
Brazilian Scientists Publish Most Complete Genome Sequence of Commercial Sugarcane 
Cientistas brasileiras quebram um recorde da genética 
Cientistas brasileiras quebram um recorde da genética 
Most complete commercial sugarcane genome sequence assembled 
Concluído maior sequenciamento do genoma da cana-de-açúcar comercial 
Cientistas brasileiros lideram mais completo mapeamento do genoma da cana 
Grupo da USP publica o mais completo genoma da cana de açúcar 
Concluído o maior sequenciamento do genoma da cana-de-açúcar comercial 
Concluído maior sequenciamento do genoma da Cana de Açúcar comercial 
Concluído maior sequenciamento do genoma da Cana de Açúcar comercial 
Most complete commercial sugarcane genome sequence has been assembled 
Cientistas brasileiras quebram um recorde da genética 
Concluído maior sequenciamento do genoma da cana-de-açúcar comercial 
Cientistas brasileiros lideram mais completo mapeamento do genoma da cana 
Cientistas brasileiros lideram mais completo mapeamento do genoma da cana 
Most complete commercial sugarcane genome sequence has been assembled 
Concluído o maior sequenciamento do genoma da cana-de-açúcar comercial 
Concluído maior sequenciamento do genoma da Cana de Açúcar comercial 
Concluído o maior sequenciamento do genoma da cana-de-açúcar comercial 
Concluído maior sequenciamento do genoma da Cana de Açúcar comercial 
Most Complete Commercial Sugarcane Genome Sequence Has Been Assembled 
Most complete commercial sugarcane genome sequence has been assembled 
Most complete commercial sugarcane genome sequence has been assembled 
Most complete commercial sugarcane genome sequence has been assembled 
Pesquisadores encontram mais de 370 mil genes em cultivar comercial da cana-de-açúcar 

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
SOUZA, GLAUCIA MENDES; VAN SLUYS, MARIE-ANNE; LEMBKE, CAROLINA GIMILIANI; LEE, HAYAN; MARGARIDO, GABRIEL RODRIGUES ALVES; HOTTA, CARLOS TAKESHI; GAIARSA, JONAS WEISSMANN; DINIZ, AUGUSTO LIMA; OLIVEIRA, MAURO DE MEDEIROS; FERREIRA, SAVIO DE SIQUEIRA; NISHIYAMA, MILTON YUTAKA; TEN-CATEN, FELIPE; RAGAGNIN, GEOVANI TOLFO; ANDRADE, PABLO DE MORAIS; DE SOUZA, ROBSON FRANCISCO; NICASTRO, GIANLUCCA GONCALVES; PANDYA, RAVI; KIM, CHANGSOO; GUO, HUI; DURHAM, ALAN MITCHELL; CARNEIRO, MONALISA SAMPAIO; ZHANG, JISEN; ZHANG, XINGTAN; ZHANG, QING; MING, RAY; SCHATZ, MICHAEL C.; DAVIDSON, BOB; PATERSON, ANDREW H.; HECKERMAN, DAVID. Assembly of the 373k gene space of the polyploid sugarcane genome reveals reservoirs of functional diversity in the world's leading biomass crop. GIGASCIENCE, v. 8, n. 12 DEC 2019. Citações Web of Science: 3.
DINIZ, AUGUSTO L.; FERREIRA, SAVIO S.; TEN-CATEN, FELIPE; MARGARIDO, GABRIEL R. A.; DOS SANTOS, JOAO M.; BARBOSA, GERALDO V. DE S.; CARNEIRO, MONALISA S.; SOUZA, GLAUCIA M. Genomic resources for energy cane breeding in the post genomics era. COMPUTATIONAL AND STRUCTURAL BIOTECHNOLOGY JOURNAL, v. 17, p. 1404-1414, 2019. Citações Web of Science: 0.
ZHANG, JISEN; ZHANG, XINGTAN; TANG, HAIBAO; ZHANG, QING; HUA, XIUTING; MA, XIAOKAI; ZHU, FAN; JONES, TYLER; ZHU, XINGUANG; BOWERS, JOHN; WAI, CHING MAN; ZHENG, CHUNFANG; SHIL, YAN; CHEN, SHUAI; XU, XIUMING; YUE, JINGJING; NELSONS, DAVID R.; HUANG, LIXIAN; LI, ZHEN; XU, HUIMIN; ZHOU, DONG; WANG, YONGJUN; HU, WEICHANG; LIN, JISHAN; DENG, YOUJIN; PANDEY, NEHA; MANCINI, MELINA; ZERPA, DESSIREE; NGUYEN, JULIE K.; WANG, LIMING; YU, LIANG; XIN, YINGHUI; GE, LIANGFA; ARRO, JIE; HAN, JENNIFER O.; CHAKRABARTY, SETU; PUSHKO, MARIJA; ZHANG, WENPING; MA, YANHONG; MA, PANPAN; LV, MINGJU; CHEN, FAMING; ZHENG, GUANGYONG; XU, JINGSHENG; YANG, ZHENHUI; DENG, FANG; CHEN, XUEQUN; LIAO, ZHENYANG; ZHANG, XUNXIAO; LIN, ZHICONG; LIN, HAI; YAN, HANSONG; KUANG, ZHENG; ZHONG, WEIMIN; LIANG, PINGPING; WANG, GUOFENG; YUAN, YUAN; SHI, JIAXIAN; HOU, JINXIANG; LIN, JINGXIAN; JIN, JINGJING; CAO, PEIJIAN; SHEN, QIAOCHU; JIANG, QING; ZHOU, PING; MA, YAYING; ZHANG, XIAODAN; XU, RONGRONG; LIU, JUAN; ZHOU, YONGMEI; JIA, HAIFENG; MA, QING; QI, RUI; ZHANG, ZHILIANG; FANG, JINGPING; FANG, HONGKUN; SONG, JINJIN; WANG, MENGJUAN; DONG, GUANGRUI; WANG, GANG; CHEN, ZHENG; MA, TENG; LIU, HONG; DHUNGANA, SINGHA R.; HUSS, SARAH E.; YANG, XIPING; SHARMA, ANUPMA; TRUJILLO, JHON H.; MARTINEZ, MARIA C.; HUDSON, MATTHEW; RIASCOS, JOHN J.; SCHULER, MARY; CHEN, LI-QING; BRAUN, DAVID M.; LI, LEI; YU, QINGYI; WANG, JIANPING; WANG, KAI; SCHATZ, MICHAEL C.; HECKERMAN, DAVID; VAN SLUYS, MARIE-ANNE; SOUZA, GLAUCIA MENDES; MOORE, PAUL H.; SANKOFF, DAVID; VANBUREN, ROBERT; PATERSON, ANDREW H.; NAGAI, CHIFUMI; MING, RAY. Allele-defined genome of the autopolyploid sugarcane Saccharum spontaneum L.. Nature Genetics, v. 50, n. 11, p. 1565+, NOV 2018. Citações Web of Science: 37.

Por favor, reporte erros na lista de publicações científicas escrevendo para: cdi@fapesp.br.