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Rede de interação e dados de espectrometria de massas de proteínas de superfície de Xanthomonas citri subsp. citri oriunda de análise proteômica diferencial de células infecciosas e não-infecciosas

Processo: 16/17284-0
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Publicações científicas - Artigo
Vigência: 01 de setembro de 2016 - 28 de fevereiro de 2017
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Bioquímica de Microorganismos
Pesquisador responsável:Maria Teresa Marques Novo Mansur
Beneficiário:Maria Teresa Marques Novo Mansur
Instituição-sede: Centro de Ciências Biológicas e da Saúde (CCBS). Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR). São Carlos , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:07/50910-2 - Análise proteômica diferencial em Xanthomonas axonopodis: proteínas e genes de interesse biotecnológico, AP.JP
Assunto(s):Cancro (doença de planta)  Proteômica  Xanthomonas 

Resumo

Neste trabalho nós fornecemos um conjunto de dados de espectrometria de massas e rede de interação das proteinas in silico identificadas em nosso artigo de pesquisa sobre análise proteômica de superfície de células de Xanthomonas citri subsp. citri (XAC) crescidas in vivo (infecciosas) e in vitro (não infecciosas), utilizando 2D-DIGE. Marcação fluorescente das proteinas foi realizada nas células intactas seguida de lise celular e spots do gel 2D diferindo em abundancia entre as duas condições (ANOVA, p-valor menor que 0,05) foram analisados por espectrometria de massas (ESI-Q-Tof, Waters)(LC-ESI-MS/MS). Este artigo contem dados brutos de proteinas detectadas nos 79 spots analisados por LC-ESI-MS/MS e também uma análise de enriquecimento da rede de interação proteína-proteina realizada com Sistema Interatoma Integrado (plataforma IIS) e software Cytoscape. Os dados são suplementares ao nosso artigo original, "Xanthomonas citri subsp. citri surface proteome by 2D-DIGE: ferric enterobactin receptor and other outer membrane proteins potentially involved in citric host interaction" [1], e dados brutos estão disponíveis via Peptide Atlas. (AU)