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Pan-resistoma de Klebsiella pneumoniae e Escherichia coli produtoras de beta-lactamases (KPC-2, CTX-M-8, CTX-M-15) endêmicas no Brasil

Processo: 16/08593-9
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de outubro de 2016 - 30 de novembro de 2018
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
Pesquisador responsável:Nilton Erbet Lincopan Huenuman
Beneficiário:Nilton Erbet Lincopan Huenuman
Instituição-sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo, SP, Brasil
Assunto(s):Microbiologia médica  Plasmídeos  Farmacorresistência bacteriana 

Resumo

A resistência aos antimicrobianos entre patógenos de importância clínica, humana e veterinária, é um desafio à saúde pública mundial, onde a disseminação dos determinantes genéticos pode ocorrer de forma dinâmica do ambiente hospitalare para o meio externo e vice-versa. De fato, linhagens de bactérias patogênicas multirresistentes (MRs) podem disseminar-se entre animais e humanos, bem como entre os diferentes ecossistemas. Por outro lado, elementos que mobilizam genes de resistência podem ser transferidos horizontalmente entre patógenos e a microbiota comensal, favorecendo a adaptação e endemicidade de complexos clonais (CC) considerados de alto risco. A epidemiologia, controle e manejo das infecções causadas por bactérias MRs, assim como, a descoberta e desenvolvimento de novos agentes antimicrobianos podem ser favorecidos pela análise dos genomas e genótipos de resistência "resistoma", obtidos por métodos de sequenciamento de nova geração (NGS). O presente projeto de pesquisa visa à obtenção de um banco de dados de sequências que permita a análise bioinformática do pan-resistoma de cepas de Klebsiella pneumoniae e Escherichia coli produtoras de beta-lactamases (KPC-2, CTX-M-8, CTX-M-15) endêmicas no Brasil, isoladas de amostras humanas, veterinárias e do ambiente. Os resultados contribuirão para a criação de uma plataforma de seqüências de referência que poderá ser utilizada para fim diagnóstico, terapêutico e/ou controle epidemiológico, entre outros; elucidando "a priori" aspectos genéticos de adaptação, resistência e virulência de clones endêmicos. (AU)

Publicações científicas (19)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
SELLERA, FABIO P.; FERNANDES, MIRIAM R.; SABINO, CAETANO P.; DE FREITAS, LAURA M.; DA SILVA, LUCIANO C. B. A.; POGLIANI, FABIO C.; RIBEIRO, MARTHA S.; HAMBLIN, MICHAEL R.; LINCOPAN, NILTON. Effective treatment and decolonization of a dog infected with carbapenemase (VIM-2)-producing Pseudomonas aeruginosa using probiotic and photodynamic therapies. VETERINARY DERMATOLOGY, v. 30, n. 2, p. 170+, APR 2019. Citações Web of Science: 0.
CASTELANI, L.; ARCARO, J. R. P.; BRAGA, J. E. P.; ROSSO, A. S.; MOURA, Q.; ESPOSITO, F.; SAUTER, I. P.; CORTEZ, M.; LINCOPAN, N. Short communication: Activity of nisin, lipid bilayer fragments and cationic nisin-lipid nanoparticles against multidrug-resistant Staphylococcus spp. isolated from bovine mastitis. JOURNAL OF DAIRY SCIENCE, v. 102, n. 1, p. 678-683, JAN 2019. Citações Web of Science: 0.
SILVA, MEIRE M.; FERNANDES, MIRIAM R.; SELLERA, FABIO P.; CERDEIRA, LOUISE; MEDEIROS, LYLIAN K. G.; GARINO, FELICIO; AZEVEDO, SERGIO S.; LINCOPAN, NILTON. Multidrug-resistant CDX-M-15-producing Klebsiella pneumoniae ST231 associated with infection and persistent colonization of dog. DIAGNOSTIC MICROBIOLOGY AND INFECTIOUS DISEASE, v. 92, n. 3, p. 259-261, NOV 2018. Citações Web of Science: 1.
SELLERA, FABIO P.; FERNANDES, MIRIAM R.; MOURA, QUEZIA; CARVALHO, MARCELO P. N.; LINCOPAN, NILTON. Extended-spectrum-beta-lactamase (CTX-M)-producing Escherichia coli in wild fishes from a polluted area in the Atlantic Coast of South America. Marine Pollution Bulletin, v. 135, p. 183-186, OCT 2018. Citações Web of Science: 2.
MOURA, QUEZIA; CERDEIRA, LOUISE; FERNANDES, MIRIAM R.; VIANELLO, MARCO A.; LINCOPAN, NILTON. Novel class 1 integron (In1390) harboring bla(GES)(-5) in a Morganella morganii strain recovered from a remote community. DIAGNOSTIC MICROBIOLOGY AND INFECTIOUS DISEASE, v. 91, n. 4, p. 345-347, AUG 2018. Citações Web of Science: 0.
MELO, LUANA C.; ORESCO, CINTIA; LEIGUE, LUCIANNE; NETTO, HILDEBRANDO M.; MELVILLE, PRISCILLA A.; BENITES, NILSON R.; SARAS, ESTELLE; HAENNI, MARISA; LINCOPAN, NILTON; MADEC, JEAN-YVES. Prevalence and molecular features of ESBL/pAmpC-producing Enterobacteriaceae in healthy and diseased companion animals in Brazil. Veterinary Microbiology, v. 221, p. 59-66, JUL 2018. Citações Web of Science: 2.
FERNANDES, MIRIAM R.; SELLERA, FABIO P.; MOURA, QUEZIA; CARVALHO, MARCELO P. N.; ROSATO, PAULA N.; CERDEIRA, LOUISE; LINCOPAN, NILTON. Zooanthroponotic Transmission of Drug-Resistant Pseudomonas aeruginosa, Brazil. Emerging Infectious Diseases, v. 24, n. 6, p. 1160-1162, JUN 2018. Citações Web of Science: 6.
SELLERA, FABIO P.; FERNANDES, MIRIAM R.; MOURA, QUEZIA; SOUZA, TIAGO A.; NASCIMENTO, CRISTIANE L.; CERDEIRA, LOUISE; LINCOPAN, NILTON. Draft genome sequence of an extensively drug-resistant Pseudomonas aeruginosa isolate belonging to ST644 isolated from a footpad infection in a Magellanic penguin (Spheniscus magellanicus). JOURNAL OF GLOBAL ANTIMICROBIAL RESISTANCE, v. 12, p. 88-89, MAR 2018. Citações Web of Science: 1.
TAMARIZ, JESUS; LLANOS, CARLOS; SEAS, CARLOS; MONTENEGRO, PAOLA; LAGOS, JOSE; FERNANDES, MIRIAM R.; CERDEIRA, LOUISE; LINCOPAN, NILTON. Draft Genome Sequence of the First New Delhi Metallo-beta-Lactamase (NDM-1)-Producing Escherichia coli Strain Isolated in Peru. MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS, v. 6, n. 13 MAR 2018. Citações Web of Science: 1.
ESPOSITO, FERNANDA; FERNANDES, MIRIAM R.; LOPES, RALF; MUNOZ, MARIA; SABINO, CAETANO P.; CUNHA, MARCOS P.; SILVA, KETRIN C.; CAYO, RODRIGO; MARTINS, WILLAMES M. B. S.; MORENO, ANDREA M.; KNOBL, TEREZINHA; GALES, ANA C.; LINCOPAN, NILTON. Detection of Colistin-Resistant MCR-1-Positive Escherichia coli by Use of Assays Based on Inhibition by EDTA and Zeta Potential. Journal of Clinical Microbiology, v. 55, n. 12, p. 3454-3465, DEC 2017. Citações Web of Science: 13.
MOURA, QUEZIA; ESPOSITO, FERNANDA; FERNANDES, MIRIAM R.; ESPINOZA-MUNOZ, MARIA; SOUZA, TIAGO A.; SANTOS, SILVIA R.; CERDEIRA, LOUISE; CASSETTARI, VALERIA; LINCOPAN, NILTON. Genome sequence analysis of a hypermucoviscous/hypervirulent and MDR CTX-M-15/K19/ST29 Klebsiella pneumoniae isolated from human infection. PATHOGENS AND DISEASE, v. 75, n. 9 DEC 2017. Citações Web of Science: 0.
NASCIMENTO, TATIANE; CANTAMESSA, RODRIGO; MELO, LUANA; FERNANDES, MIRIAM R.; FRAGA, EDMIR; DROPA, MILENA; SATO, MARIA I. Z.; CERDEIRA, LOUISE; LINCOPAN, NILTON. International high-risk clones of Klebsiella pneumoniae KPC-2/CC258 and Escherichia coli CTX-M-15/CC10 in urban lake waters. Science of The Total Environment, v. 598, p. 910-915, NOV 15 2017. Citações Web of Science: 9.
CERDEIRA, LOUISE T.; CUNHA, MARCOS P. V.; FRANCISCO, GABRIELA R.; BUENO, MARIA FERNANDA C.; ARAUJO, BRUNA F.; RIBAS, ROSINEIDE M.; GONTIJO-FILHO, PAULO P.; KNOBL, TEREZINHA; GARCIA, DOROTI DE OLIVEIRA; LINCOPAN, NILTON. IncX3 plasmid harboring a non-Tn4401 genetic element (NTEKPC) in a hospital-associated clone of KPC-2-producing Klebsiella pneumoniae ST340/CG258. DIAGNOSTIC MICROBIOLOGY AND INFECTIOUS DISEASE, v. 89, n. 2, p. 164-167, OCT 2017. Citações Web of Science: 4.
LOPES, RALF; CERDEIRA, LOUISE T.; FERNANDES, MIRIAM R.; PEREZ-CHAPARRO, PAULA J.; MCCULLOCH, JOHN A.; LINCOPAN, NILTON. Draft genome sequence of a CTX-M-15-producing endophytic Klebsiella pneumoniae ST198 isolate from commercial lettuce. JOURNAL OF GLOBAL ANTIMICROBIAL RESISTANCE, v. 10, p. 19-20, SEP 2017. Citações Web of Science: 2.
MOURA, QUEZIA; FERNANDES, MIRIAM R.; CERDEIRA, LOUISE; SANTOS, ANA CAROLINA M.; DE SOUZA, TIAGO A.; IENNE, SUSAN; PIGNATARI, ANTONIO CARLOS C.; GALES, ANA C.; SILVA, ROSA M.; LINCOPAN, NILTON. Draft genome sequence of a multidrug-resistant Aeromonas hydrophila ST508 strain carrying rmtD and bla(CTX-M-131) isolated from a bloodstream infection. JOURNAL OF GLOBAL ANTIMICROBIAL RESISTANCE, v. 10, p. 289-290, SEP 2017. Citações Web of Science: 1.
SELLERA, FABIO P.; FERNANDES, MIRIAM R.; MOURA, QUEZIA; SOUZA, TIAGO A.; CERDEIRA, LOUISE; LINCOPAN, NILTON. Draft genome sequence of Enterobacter cloacae ST520 harbouring bla(KPC-2), bla(CTX-M-15) and bla(OXA-17) isolated from coastal waters of the South Atlantic Ocean. JOURNAL OF GLOBAL ANTIMICROBIAL RESISTANCE, v. 10, p. 279-280, SEP 2017. Citações Web of Science: 5.
FERNANDES, MIRIAM R.; SELLERA, FABIO P.; ESPOSITO, FERNANDA; SABINO, CAETANO P.; CERDEIRA, LOUISE; LINCOPAN, NILTON. Colistin-Resistant mcr-1-Positive Escherichia coli on Public Beaches, an Infectious Threat Emerging in Recreational Waters. Antimicrobial Agents and Chemotherapy, v. 61, n. 7 JUL 2017. Citações Web of Science: 14.
MONTE, DANIEL FARIAS; MEM, ANDRESSA; FERNANDES, MIRIAM R.; CERDEIRA, LOUISE; ESPOSITO, FERNANDA; GALVAO, JULIA A.; FRANCO, BERNADETTE D. G. M.; LINCOPAN, NILTON; LANDGRAF, MARIZA. Chicken Meat as a Reservoir of Colistin-Resistant Escherichia coli Strains Carrying mcr-1 Genes in South America. Antimicrobial Agents and Chemotherapy, v. 61, n. 5 MAY 2017. Citações Web of Science: 20.
TURANO, HELENA; GOMES, FERNANDO; BARROS-CARVALHO, GESIELE A.; LOPES, RALF; CERDEIRA, LOUISE; NETTO, LUIS E. S.; GALES, ANA C.; LINCOPAN, NILTON. Tn6350, a Novel Transposon Carrying Pyocin S8 Genes Encoding a Bacteriocin with Activity against Carbapenemase-Producing Pseudomonas aeruginosa. Antimicrobial Agents and Chemotherapy, v. 61, n. 5 MAY 2017. Citações Web of Science: 1.

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