Mecanismos fisiopatológicos e moleculares de tumorigênese: abordagem baseada em plataformas de sequenciamento em escala genômica (NGS - Next-Generation Sequencing)

• Processo: 14/03989-6
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Temático
• Vigência: 01 de março de 2017 - 29 de fevereiro de 2024
• Área do conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
• Pesquisador responsável: Margaret de Castro
• Beneficiário: Margaret de Castro
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Pesquisadores principais: Léa Maria Zanini Maciel ; Sonir Roberto Rauber Antonini
• Pesquisadores associados: Ana Valeria Castro ; Ayrton Custodio Moreira ; Fabiano Pinto Saggioro ; Helio Rubens Machado ; Houtan Noushmehr ; Luciano Neder Serafini ; Paula Condé Lamparelli Elias ; Wilson Araújo da Silva Junior
• Auxílios(s) vinculado(s): 24/02256-7 - Controle Epigenético dos craniofaringiomas, PUB.ART; 22/15461-2 - EMU concedido no processo 2014/03989-6: SeqStudio Genetic Analyzer System, AP.EMU
• Bolsa(s) vinculada(s): 22/09929-1 - Geração de modelos animais e estudo dos mecanimos moleculares envolvidos na tumorigênese de corticotrofinomas e carcinomas adrenocorticais, BP.PD; 22/04899-7 - Investigação bioquímica e molecular do hiperaldosteronismo primário, BP.IC; 22/04883-3 - Identificação de variações moleculares envolvidas na tumorigênese hipofisária baseada em sequenciamento exômico e transcriptoma, BP.PD; + mais bolsas vinculadas 21/04368-9 - Mecanismos fisiopatológicos e moleculares de tumorigênese: abordagem baseada em plataformas de sequenciamento em escala genômica, BP.TT; 20/03835-0 - Aplicação de protocolos padrão de Inteligência Artifical na transcritômica de tumores adrenocorticais pediátricos para estratificação e busca de biomarcadores, BP.TT; 19/08041-4 - Via Wnt/beta-catenina em tumores adrenocorticais pediátricos, BP.IC; 19/00860-6 - Mecanismos fisiopatológicos e moleculares de tumorigênese: abordagem baseada em plataformas de sequenciamento em escala genômica (NGS - Next-generation sequencing)., BP.PD; 19/00849-2 - Mecanismos fisiopatológicos e moleculares de tumorigênese: abordagem baseada em plataformas de sequenciamento em escala genômica (NGS - Next-generation sequencing), BP.PD; 18/08210-8 - Sequenciamento Genômico em Larga Escala em Tumores Adrenocorticais Pediátricos, BP.PD - menos bolsas vinculadas
• Assunto(s): Endocrinologia Exoma Transformação celular neoplásica Transcriptoma Neoplasias hipofisárias Transdução de sinais
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: exoma | mecanismos de tumorigênese | metiloma | next sequencing generation | tireoidianos e adrenais | trascriptoma | tumores hipofisários | vias de sinalização celular | Endocrinologia

Resumo

Na tentativa de esclarecer a patogênese molecular dos tumores endócrinos, estudos utilizando abordagens baseadas em genes candidatos e estudos de ligação (linkage), têm investigado o papel de genes específicos do desenvolvimento de cada glândula endócrina, genes envolvidos em tumorigênese de outros tecidos, como genes que levam à progressão do ciclo e divisão celular (oncogenes) ou que bloqueiam o ciclo celular (genes de supressão tumoral). Ainda, miRNAs e lncRNAs (large noncoding RNAs) têm sido associados à tumorigênese geral e especifica das glândulas endócrinas. Houve grande avanço no esclarecimento molecular de várias síndromes genéticas associadas a tumores hipofisários (McCune-Albright, Neoplasia endócrina múltipla (NEM) tipo 1 e tipo 4, síndrome de Carney e adenoma hipofisário familial isolado-FIPA); associadas a tumores adrenais (Li-Fraumeni, Beckwith-Wiedemann, Complexo de Carney, McCune-Albright e NEM1) e aquelas associadas com tumores tireoidianos (NEM2 e Carcinoma Medular de Tireóide Hereditário). Apesar dos avanços, a patogênese molecular dos tumores endócrinos, principalmente dos esporádicos, ainda não está elucidada. As novas plataformas de sequenciamento em escala genômica, ou ainda, de última geração (Next-generation sequencing ou NGS) apresentam vantagens e diversas aplicações, dependendo da hipótese formulada. Para a análise do genoma pode-se utilizar sequenciamento de novo, Target-seq, análise de exoma (whole exoma seq) ou análise de todo o genoma (whole genoma seq). Para a análise epigenômica pode-se utilizar imunoprecipitação de cromatina (ChIP) e análise de metilação (metiloma); outra abordagem é a análise do perfil de expressão gênica do transcriptoma inteiro. Portanto, este projeto objetiva, pelo uso de uma ferramenta atual e poderosa - os NGS, entender e esclarecer a gênese dos tumores hipofisários, adrenais, tireoideanos e de um subtipo de tumor do sistema nervoso central, os gliomas, avaliando alterações na totalidade de genes expressos, nos processos epigenéticos e no estudo de transcriptomas em amostras desses tumores. A casuística será composta por pacientes seguidos no Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo (HCFMRP-USP). Como controles, serão utilizadas amostras de tecido normal, obtidas no CEMEL (Centro de Medicina Legal) após necropsia de indivíduos com morte acidental ou súbita de causa cardíaca. O NGS certamente indicará novos genes e/ou novas vias de sinalização que poderão ser chaves para o esclarecimento da tumorigênese. (AU)

Publicações científicas

(18)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

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