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Cromossomos sexuais, cromossomos B e seus enigmas: sistemas modelo para estudos de evolução cromossômica e genômica

Processo: 15/16661-1
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Temático
Vigência: 01 de maio de 2017 - 30 de abril de 2022
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
Pesquisador responsável:César Martins
Beneficiário:César Martins
Instituição-sede: Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
Pesq. associados:Adauto Lima Cardoso ; Adriane Pinto Wasko ; Camila do Nascimento Moreira ; Danillo Pinhal ; David Ray ; Diogo Cavalcanti Cabral de Mello ; Flávia Karina Delella ; Guilherme Targino Valente ; Ivan Rodrigo Wolf ; Lígia Souza Lima Silveira da Mota ; Lucilene Delazari dos Santos ; Marcelo Ricardo Vicari ; Maria Dulcetti Vibranovski ; Michelle Orane Schemberger ; Ney Lemke ; Patricia Pasquali Parise Maltempi ; Rachel Oneill ; Renato Eugenio da Silva Diniz ; Silvia Mitiko Nishida ; Thomas David Kocher ; Vanessa Bellini Bardella ; Wagner Seixas da Silva
Bolsa(s) vinculada(s):20/06188-5 - Conteúdo molecular, padrões de modificações epigenéticas e interferência dos cromossomos supranumerários em Drosophila melanogaster, BP.DR
19/18190-7 - Em direção a uma visão funcional de cromossomos B e sua interface com cromossomos sexuais, BP.PD
18/25350-8 - Desenvolvimento de marcadores genéticos para identificação do sexo de Astatotilapia latifasciata, BP.IC
+ mais bolsas vinculadas 18/21772-5 - Citogenômica cigarrinha praga Aetalion reticulatum (Aetalionidae: Hemiptera): análise dos DNAs repetitivos e cromossomos B, BP.PD
18/09553-6 - Análise genômica do roedor Holochilus sciureus (Cricetidae: Sigmodontinae: Oryzomyini) com ênfase na interface entre cromossomos B e sexuais, BP.PD
18/09127-7 - Efeitos de genes ativos em cromossomos B de Astatotilapia latifasciata e contribuições no entendimento da interação entre cromossomos B e sexuais, BP.IC
18/09010-2 - Análise do DNA repetitivo de Gryllus assimilis com ênfase nos cromossomos sexuais, BP.IC
18/08041-1 - O que você realmente sabe sobre genética? Uma percepção das demandas educacionais de estudantes do ensino médio, BP.IC
17/25193-7 - Atuação de piwiRNAs no silenciamento de elementos transponíveis na presença do cromossomo B de Astatotilapia latifasciata (Cichlidae), BP.DR
17/07484-4 - Cultivo celular de Astatotilapia latifasciata e montagem genômica de seu cromossomo B: contribuições ao entendimento dos efeitos de cromossomos supernumerários, BP.PD - menos bolsas vinculadas
Assunto(s):Cromossomos  Cromossomos sexuais  Citogenética  Evolução molecular  Genomas 

Resumo

Os cromossomos representam componentes importantes das células no empacotamento do material genético em um padrão de organização estrutural e funcional perfeito. Entretanto, o comportamento dos cromossomos durante o ciclo celular está sujeito a rearranjos genômicos produzindo uma ampla variedade de consequências funcionais com impacto em desordens celulares e também gerando novidades evolutivas. Embora diversos fatores que mediam rearranjos cromossômicos sejam conhecidos, existem ainda muitas questões sem resposta. Sob a luz da era de geração massiva de dados biológicos, os estudos cromossômicos também avançaram para um nível mais elevado, explorando análises em larga escala de DNA, RNA e proteínas, e suas redes de interação. Diante deste contexto, a presente proposta visa explorar polimorfismos cromossômicos naturalmente estabelecidos (associados a cromossomos B e cromossomos sexuais) como modelos para investigar as modificações cromossômicas e genômicas ocorridas durante o processo evolutivo. Dessa forma, os objetivos deste projeto focam na análise de sistemas de cromossomos sexuais e cromossomos B sob a luz da análise massiva de dados moleculares obtidos de diferentes modelos animais, de forma a avançar na identificação da origem e do papel das mudanças cromossômicas para compreender suas consequências evolutivas e patológicas. Adicionalmente, o projeto tem também como objetivo a divulgação científica de conhecimentos acerca dos cromossomos, sob a ótica evolutiva e funcional, como forma de diálogo entre ciência e sociedade. (AU)

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre o auxílio:
Pós-doutorado em Bioinformática com bolsa da FAPESP 
Unesp cria kit educativo para ajudar no ensino de genética nas escolas 

Publicações científicas (15)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
MARTINS, CESAR; JEHANGIR, MARYAM. A genomic glimpse of B chromosomes in cichlids. GENES & GENOMICS, FEB 2021. Citações Web of Science: 0.
DULZ, THAIS APARECIDA; AZAMBUJA, MATHEUS; NASCIMENTO, VIVIANE DEMETRIO; LORSCHEIDER, CARLA ANDREA; NOLETO, RAFAEL BUENO; MOREIRA-FILHO, ORLANDO; NOGAROTO, VIVIANE; DINIZ, DEBORA; AFFONSO, PAULO ROBERTO ANTUNES DE MELLO; VICARI, MARCELO RICARDO. Karyotypic Diversification in TwoMegaleporinusSpecies (Characiformes, Anostomidae) Inferred fromIn SituLocalization of Repetitive DNA Sequences. ZEBRAFISH, v. 17, n. 5, p. 333-341, OCT 1 2020. Citações Web of Science: 0.
AHMAD, SYED F.; JEHANGIR, MARYAM; CARDOSO, ADAUTO L.; WOLF, IVAN R.; MARGARIDO, VLADIMIR P.; CABRAL-DE-MELLO, DIOGO C.; O'NEILL, RACHEL; VALENTE, GUILHERME T.; MARTINS, CESAR. B chromosomes of multiple species have intense evolutionary dynamics and accumulated genes related to important biological processes. BMC Genomics, v. 21, n. 1 SEP 23 2020. Citações Web of Science: 0.
FERRETTI, ANA B. S. M.; MILANI, DIOGO; PALACIOS-GIMENEZ, OCTAVIO M.; RUIZ-RUANO, FRANCISCO J.; CABRAL-DE-MELLO, DIOGO C. High dynamism for neo-sex chromosomes: satellite DNAs reveal complex evolution in a grasshopper. HEREDITY, v. 125, n. 3 JUN 2020. Citações Web of Science: 0.
SCHEMBERGER, MICHELLE ORANE; NASCIMENTO, VIVIANE DEMETRIO; COAN, RAFAEL; RAMOS, ERICA; NOGAROTO, VIVIANE; ZIEMNICZAK, KALINE; VALENTE, GUILHERME TARGINO; MOREIRA-FILHO, ORLANDO; MARTINS, CESAR; VICARI, MARCELO RICARDO. DNA transposon invasion and microsatellite accumulation guide W chromosome differentiation in a Neotropical fish genome. CHROMOSOMA, v. 128, n. 4, p. 547-560, DEC 2019. Citações Web of Science: 0.
FERRETTI, ANA B. S. M.; RUIZ-RUANO, FRANCISCO J.; MILANI, DIOGO; LORETO, VILMA; MARTI, DARDO A.; RAMOS, ERICA; MARTINS, CESAR; CABRAL-DE-MELLO, DIOGO C. How dynamic could be the 45S rDNA cistron? An intriguing variability in a grasshopper species revealed by integration of chromosomal and genomic data. CHROMOSOMA, v. 128, n. 2, p. 165-175, JUN 2019. Citações Web of Science: 0.
JEHANGIR, MARYAM; AHMAD, SYED F.; CARDOSO, ADAUTO L.; RAMOS, ERICA; VALENTE, GUILHERME T.; MARTINS, CESAR. De novo genome assembly of the cichlid fish Astatotilapia latifasciata reveals a higher level of genomic polymorphism and genes related to B chromosomes. CHROMOSOMA, v. 128, n. 2, p. 81-96, JUN 2019. Citações Web of Science: 1.
CARDOSO, ADAUTO LIMA; DE ALMEIDA FANTINATTI, BRUNO EVARISTO; VENTURELLI, NATALIA BORTHOLAZZI; CARMELLO, BIANCA DE OLIVEIRA; DE OLIVEIRA, ROGERIO ANTONIO; MARTINS, CESAR. Epigenetic DNA Modifications Are Correlated With B Chromosomes and Sex in the Cichlid Astatotilapia latifasciata. FRONTIERS IN GENETICS, v. 10, APR 12 2019. Citações Web of Science: 0.
AHMAD, SYED FARHAN; MARTINS, CESAR. The Modern View of B Chromosomes Under the Impact of High Scale Omics Analyses. CELLS, v. 8, n. 2 FEB 2019. Citações Web of Science: 5.
MILANI, DIOGO; BARDELLA, VANESSA B.; FERRETTI, ANA B. S. M.; PALACIOS-GIMENEZ, OCTAVIO M.; MELO, ADRIANA DE S.; MOURA, RITA C.; LORETO, VILMA; SONG, HOJUN; CABRAL-DE-MELLO, DIOGO C. Satellite DNAs Unveil Clues about the Ancestry and Composition of B Chromosomes in Three Grasshopper Species. GENES, v. 9, n. 11 NOV 2018. Citações Web of Science: 3.
COAN, RAFAEL L. B.; MARTINS, CESAR. Landscape of Transposable Elements Focusing on the B Chromosome of the Cichlid Fish Astatotilapia latifasciata. GENES, v. 9, n. 6 JUN 2018. Citações Web of Science: 8.
PINHAL, DANILLO; BOVOLENTA, LUIZ A.; MOXON, SIMON; OLIVEIRA, ARTHUR C.; NACHTIGALL, PEDRO G.; ACENCIO, MARCIO L.; PATTON, JAMES G.; HILSDORF, ALEXANDRE W. S.; LEMKE, NEY; MARTINS, CESAR. Genome-wide microRNA screening in Nile tilapia reveals pervasive isomiRs' transcription, sex-biased arm switching and increasing complexity of expression throughout development. SCIENTIFIC REPORTS, v. 8, MAY 29 2018. Citações Web of Science: 4.
PALACIOS-GIMENEZ, OCTAVIO MANUEL; BARDELLA, VANESSA BELLINI; LEMOS, BERNARDO; CABRAL-DE-MELLO, DIOGO CAVALCANTI. Satellite DNAs are conserved and differentially transcribed among Gryllus cricket species. DNA Research, v. 25, n. 2, p. 137-147, APR 2018. Citações Web of Science: 1.
CARMELLO, BIANCA O.; COAN, RAFAEL L. B.; CARDOSO, ADAUTO L.; RAMOS, ERICA; FANTINATTI, BRUNO E. A.; MARQUES, DIEGO F.; OLIVEIRA, ROGERIO A.; VALENTE, GUILHERME T.; MARTINS, CESAR. The hnRNP Q-like gene is retroinserted into the B chromosomes of the cichlid fish Astatotilapia latifasciata. Chromosome Research, v. 25, n. 3-4, p. 277-290, OCT 2017. Citações Web of Science: 4.
MILANI, DIOGO; RAMOS, ERICA; LORETO, VILMA; ANDREA MARTI, DARDO; CARDOSO, ADAUTO LIMA; MARTINEZ DE MORAES, KAREN CRISTIANE; MARTINS, CESAR; CABRAL-DE-MELLO, DIOGO CAVALCANTI. The satellite DNA AflaSAT-1 in the A and B chromosomes of the grasshopper Abracris flavolineata. BMC GENETICS, v. 18, AUG 29 2017. Citações Web of Science: 1.

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