Diversidade genômica dos nativos americanos

• Processo: 15/26875-9
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Jovens Pesquisadores
• Vigência: 01 de junho de 2017 - 31 de maio de 2022
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
• Pesquisador responsável: Tábita Hünemeier
• Beneficiário: Tábita Hünemeier
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: David Comas ; Fabrício Rodrigues dos Santos ; Francisco Mauro Salzano
• Auxílios(s) vinculado(s): 21/06860-8 - Rastreando mudanças evolutivas na América pré e pós-contato usando dados genômicos de séries temporais, AP.JP2; 20/05326-5 - Aspectos genômicos e epidemiológicos COVID-19 nas populações nativas brasileiras, AP.R
• Bolsa(s) vinculada(s): 21/12238-8 - Detecção de padrões de seleção natural em população nativa americana por aprendizado de máquina, BP.TT; 18/01371-6 - Diversidade e evolução de populações brasileiras, BP.DR; 18/23480-1 - Genômica computacional populacional: aplicações em análises evolutivas e de variabilidade populacional de nativos americanos, BP.TT; 17/14916-8 - Influência da seleção natural na diversificação das populações nativas americanas, BP.DR; 16/12371-1 - Reconstruindo a história humana na América do Sul com dados paleogenômicos, BP.DR
• Assunto(s): Análise de sequência de DNA Variação genética Técnicas de genotipagem Genomas Evolução molecular Miscigenação Índios norte-americanos
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Evolução | Genomas | Nativos Americanos | Genética de Populações Humanas

Resumo

As populações nativas americanas são o grupo humano menos estudado da atualidade no que se refere a sua variabilidade genética. Embora estudos com varredura genômica tenham ajudado a melhor conhecer as populações nativas da América, as plataformas de genotipagem dessa técnica são baseadas na variação já descrita de populações africanas, asiáticas e europeias, não levando em consideração a variabilidade nativo americana, justamente pela falta de genomas de referência a serem usados. Essa falta de informação tem grandes implicações em estudos médicos, dado que a maioria dos grandes estudos de caso-controle conduzidos hoje utilizam plataformas convencionais de varredura genômica que não são adequadas para ensaios em populações que apresentem grande componente nativo americano, como é o caso de países como México, Peru e algumas regiões do Brasil. O mais abrangente projeto de genomas humanos (The 1000 Genomes Project) não inclui nem prevê o estudo de populações nativo americanas, aumentando ainda mais a negligência do ponto de vista genético na geração de informação sobre esses povos. O presente projeto se propõe a preencher essa lacuna, visando o sequenciamento de 65 genomas completos de indivíduos de populações nativo americanas, a fim de desvendar a variabilidade genômica total dessas populações, estabelecer os processos evolutivos envolvidos na geração e manutenção dessa diversidade e auxiliar na criação de métodos de alta-fidelidade para estudos clínicos envolvendo populações miscigenadas e nativo americanas. (AU)

Publicações científicas

(5)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

CASTRO E SILVA, MARCOS ARAUJO; FERRAZ, TIAGO; COUTO-SILVA, CAINA M.; LEMES, RENAN B.; NUNES, KELLY; COMAS, DAVID; HUNEMEIER, TABITA. Population Histories and Genomic Diversity of South American Natives. Molecular Biology and Evolution, v. 39, n. 1, p. 17-pg., 2021-12-21. (15/26875-9, 20/10136-0, 17/14916-8, 16/12371-1)

JACOVAS, VANESSA C.; COUTO-SILVA, CAINA M.; NUNES, KELLY; LEMES, RENAN B.; DE OLIVEIRA, MARCELO Z.; SALZANO, FRANCISCO M.; BORTOLINI, MARIA CATIRA; HUNEMEIER, TABITA. Selection scan reveals three new loci related to high altitude adaptation in Native Andeans. SCIENTIFIC REPORTS, v. 8, AUG 24 2018. (15/26875-9)

CASTRO E SILVA, MARCOS ARAUJO; NUNES, KELLY; LEMES, RENAN BARBOSA; MAS-SANDOVAL, ALEX; GUERRA AMORIM, CARLOS EDUARDO; KRIEGER, JOSE EDUARDO; MILL, JOSE GERALDO; SALZANO, FRANCISCO MAURO; BORTOLINI, MARIA CATIRA; PEREIRA, ALEXANDRE DA COSTA; et al. Genomic insight into the origins and dispersal of the Brazilian coastal natives. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, v. 117, n. 5, p. 2372-2377, FEB 4 2020. (15/26875-9)

COUTO-SILVA, CAINA M.; NUNES, KELLY; VENTURINI, GABRIELA; CASTRO E SILVA, MARCOS ARAUJO; PEREIRA, LYGIA, V; COMAS, DAVID; PEREIRA, ALEXANDRE; HUNEMEIER, TABITA. Indigenous people from Amazon show genetic signatures of pathogen-driven selection. SCIENCE ADVANCES, v. 9, n. 10, p. 1-pg., 2023-03-08. (15/26875-9, 17/14916-8, 19/11821-1)

HUNEMEIER, TABITA. The spread of genes and culture in the Late Holocene of South America. AMERICAN JOURNAL OF BIOLOGICAL ANTHROPOLOGY, v. 180, p. 1-pg., 2023-04-01. (15/26875-9, 21/06860-8)