Desenvolvimento e aplicação de campo de força coarse-graining em sistemas auto-organizados

• Processo: 17/03204-7
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Vigência: 01 de junho de 2017 - 31 de maio de 2019
• Área do conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Química - Físico-química
• Pesquisador responsável: Luis Gustavo Dias
• Beneficiário: Luis Gustavo Dias
• Instituição Sede: Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto (FFCLRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Assunto(s): Química teórica Modelagem molecular Simulação de dinâmica molecular
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Coarse-graining | molecular dynamics | self-assembled | Soft matter | Química Teórica

Resumo

Modelagem molecular é uma importante ferramenta para avaliar processos e mecanismos em nível nanoscópico, auxiliando a compreensão dos fenômenos envolvidos e interpretação de dados experimentais. Procura-se aumentar a potencialidade desta técnica via descrição melhorada do comportamento molecular, ou seja, há um constante interesse no desenvolvimento de campos de força que reproduzam detalhadamente o que ocorre experimentalmente. Por outro lado, tem-se aliado a este interesse a busca por modelos simplificados (coarse-grained) que contenham um número menor sítios de interação ou descritos por potenciais efetivos, visando abranger maiores escalas espaços-temporais. Este projeto pretende desenvolver e/ou adaptar um campo de força coarse-grained (ELBA) para sistemas auto-organizados (p.e., biomembranas, peptídeos, copolímeros, surfatantes) de forma que as simulações reproduzam consistentemente as interações eletrostáticas e de Van der Waals e, conseqüentemente, reproduzam os fenômenos de interesse de forma inequívoca. As simulações com campos de força coarse-grained auxiliarão na interpretação de resultados experimentais. (AU)

Publicações científicas

(7)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

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FONSECA, FRANCIELE S.; CARRAO, DANIEL B.; DE ALBUQUERQUE, NAYARA C. P.; NARDINI, VIVIANI; DIAS, LUIS G.; DA SILVA, RODRIGO M.; LOPES, NORBERTO P.; DE OLIVEIRA, ANDERSON R. M.. Myclobutanil enantioselective risk assessment in humans through in vitro CYP450 reactions: Metabolism and inhibition studies. Food and Chemical Toxicology, v. 128, p. 202-211, JUN 2019. (18/07534-4, 17/03204-7, 14/50945-4, 16/07597-0, 13/08166-5)

HABENSCHUS, MAISA DANIELA; CARRAO, DANIEL BLASCKE; PEREZ DE ALBUQUERQUE, NAYARA CRISTINA; PEROVANI, ICARO SALGADO; DA SILVA, RODRIGO MOREIRA; NARDINI, VIVIANI; LOPES, NORBERTO PEPORINE; DIAS, LUIS GUSTAVO; MORAES DE OLIVEIRA, ANDERSON RODRIGO. In vitro enantioselective inhibition of the main human CYP450 enzymes involved in drug metabolism by the chiral pesticide tebuconazole. Toxicology Letters, v. 351, p. 1-9, OCT 15 2021. (14/50945-4, 18/07534-4, 17/03204-7)

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