Análise funcional da histona H2B variante de Trypanosoma cruzi

• Processo: 17/06104-3
• Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Vigência: 01 de julho de 2017 - 30 de junho de 2019
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Bioquímica de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Julia Pinheiro Chagas da Cunha
• Beneficiário: Julia Pinheiro Chagas da Cunha
• Instituição-sede: Instituto Butantan. Secretaria da Saúde (São Paulo - Estado). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Epigênese genética Trypanosoma cruzi Histonas Imunoprecipitação da cromatina Fenótipo Cromatina Espectrometria de massas

Resumo

O Trypanosoma cruzi é um eucarioto unicelular, agente causador da Doença de Chagas que alterna entre formas replicativas e não infectivas (epimastigotas e amastigotas) e formas não-replicativas e infectivas (tripomastigotas celulares e sanguíneas). A diferenciação entre estas formas é acompanhada tanto por diferenças dos níveis globais de transcrição quanto por alterações estruturais na cromatina. Diversos estudos apontam que a cromatina dos tripanossomas contem diversas alterações epigenéticas, incluindo deposição de variantes de histonas, enriquecidas em sítios putativos de início de transcrição. Recentemente verificamos que a histona H2Bv de T. cruzi está presente em maior quantidade na cromatina das formas não replicativas, sugerindo que a mesma possa desempenhar algum papel importante frente às diferenças fenotípicas (de expressão gênica e estrutura da cromatina) observadas entre as formas de vida de T. cruzi. Assim, neste trabalho, pretendemos estudar o papel da histona H2Bv neste parasita. Para tal, iremos: I. Identificar os parceiros de interação desta histona variante através de ensaios de co-imunoprecipitação e pulldown; II. Identificar as regiões genômicas em que esta proteína se associa, através de ensaios de imunoprecipitação da cromatina (ChIP); III. Analisar se H2Bv está preferencialmente presente em eucromatina e heterocromatina, através de ensaios de microscopia eletrônica e digestão parcial com MNase; IV. Gerar parasitas nocautes para H2Bv e avaliar o fenótipo nas diferentes formas durante o ciclo de vida; V. Avaliar o fenótipo das formas epimastigotas e células de mamíferos que superexpressam H2Bv. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

DE LIMA, LOYZE P.; POUBEL, SALOE BISPO; YUAN, ZUO-FEI; ROSON, JULIANA NUNES; DE LUNA VITORINO, FRANCISCA NATHALIA; HOLETZ, FABIOLA BARBIERI; GARCIA, BENJAMIN A.; CHAGAS DA CUNHA, JULIA PINHEIRO. Improvements on the quantitative analysis of Trypanosoma cruzi histone post translational modifications: Study of changes in epigenetic marks through the parasite's metacyclogenesis and life cycle. JOURNAL OF PROTEOMICS, v. 225, APR 15 2020. (18/21785-0, 17/06104-3, 18/14432-3, 18/15553-9, 13/07467-1, 17/18344-9)

ROSON, JULIANA NUNES; VITARELLI, MARCELA DE OLIVEIRA J.; COSTA-SILVA, HELLIDA MARINA; PEREIRA, KAMILLE SCHMITT; PIRES, DAVID DA SILVA; LOPES, LETICIA DE SOUSA; CORDEIRO, BARBARA; KRAUS, AMELIE; CRUZ, KARIN NAVARRO TOZZI; CALDERANO, SIMONE GUEDES; et al. 2B.V demarcates divergent strand-switch regions, some tDNA loci, and genome compartments in Trypanosoma cruzi and affects parasite differentiation and host cell invasio. PLOS PATHOGENS, v. 18, n. 2, FEB 2022. (18/15553-9, 16/50050-2, 17/06104-3, 19/04483-2, 19/16033-1, 13/07467-1, 19/19834-5)