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INCT 2014 - Envelhecimento e Doenças Genéticas: Genômica e Metagenômica

Resumo

Longevidade e envelhecimento saudável são temas de grande interesse. Eles dependem de uma interação complexa entre DNA nuclear e mitocondrial, o meio ambiente e a microbiota, isto é, a população de bactérias que vivem nas diferentes partes do nosso corpo com seu conjunto de genes. Entender esse equilíbrio complexo entre o genoma e o ambiente é um dos maiores desafios. Qual é a influência de variantes genômicas e epigenômicas, do sistema imune sobre o envelhecimento? Quanto nosso microbioma interfere ou contribuí com nossa saúde e doenças? Poderia o nosso microbioma ajudar a explicar a "missing herdability" em doenças complexas? Esse projeto tem como objetivo pesquisar essas questões através de diferentes estratégias e expertises. Dados sobre a manutenção da capacidade cognitiva e a estrutura do cérebro funcional serão obtidos através de ressonância magnética (MRI). Medidas sócio demográficas em vários níveis irão contribuir para estabelecer o panorama das contribuições ambientais e sua influência na saúde e longevidade. Entre o conjunto de técnicas que planejamos utilizar, modelos funcionais, principalmente a nível celular serão essenciais para ajudar-nos a entender os mecanismos específicos responsáveis pelo processo de envelhecimento normal e patológico. Na expectativa de aumentar nossa compreensão em relação a essas questões, vamos investigar três grandes grupos de indivíduos: a) indivíduos saudáveis de São Paulo, com mais de 60 anos, (coorte SABE) que foram acompanhados por muitos anos e farão parte da maioria dos suo-projetos a serem desenvolvidos; b) uma coleção de dados de pessoas que faleceram de causas naturais com mais de 50 anos, obtida do Banco de Cérebros; c) uma amostra de indivíduos com doenças genéticas associadas a uma rápida degeneração ou doenças complexas que poderiam ser causadas parcialmente pelo microbioma humano. Indivíduos averiguados no estudo populacional de São Paulo são altamente miscigenados e podem ser etnicamente diferentes das populações de outras regiões do Brasil. Portanto, para validar nossos achados moleculares em outras populações brasileiras, planejamos também incluir populações de diferentes regiões e ancestralidade e ambientes. Uma população de quilombolas, primordialmente afrodescendentes e uma coorte da Paraíba com alta consanguinidade. Além disso, duas populações de Vitória, Espírito Santo, serão averiguadas: a primeira com alta proporção de nonagenários; a segunda com alta frequência de pessoas com sobrepeso; ambas são resultantes de miscigenação europeia (Itália, Pomerania, Áustria e Portugal) e Afro-Ameríndia. Também serão estudados pacientes e modelos animais com doenças de envelhecimento precoce ou doenças neuromusculares e neurodegenerativas. Nosso objetivo principal é contribuir para a elucidação de fatores responsáveis pela grande variabilidade associada ao envelhecimento, estudando também doenças genéticas no intuito de aumentar a nossa compreensão acerca da longevidade saudável. Para conseguir esse objetivo, a constituição dessa rede com a participação de pesquisadores de diferentes Estados é fundamental. Ela permitirá reunir uma amostra expressiva de indivíduos de diferentes etnias, que não existe para a população brasileira, e que é essencial para os estudos populacionais propostos nesse projeto. É importante salientar que o grupo de S. Paulo já mantém uma estreita colaboração com os pesquisadores dos outros Estados e que já resultaram em várias publicações conjuntas. Outro objetivo desta proposta é o projeto educacional, disseminando a ciência, o qual tem o propósito de estimular a curiosidade a motivar o público para tópicos relacionados com a genética. Cartazes com questões provocativas sobre Genética serão distribuídos em estações de metrô, terminais de ônibus e em escolas públicas, direcionando para um site que pode ser acessado por telefone celular. A primeira campanha, "Similar, mas diferente", está em andamento em São Paulo (http://www.genoma.ib.usp.br). Os parceiros pesquisadores de outros estados irão coordenar estas campanhas em suas regiões. Para alcançar todos estes objetivos montamos um grupo de cientistas experientes em diferentes áreas de interesse, tal como biologia molecular (em relação ao DNA nuclear, mitocondrial, RNA e proteínas), imunologia, além de outros com experiência em imagens, metagenômica, bioinformática e ciência da computação bem como profissionais da área clínica. (AU)

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Publicações científicas (15)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
CASTELLI, ERICK C.; DE CASTRO, V, MATEUS; NASLAVSKY, MICHEL S.; SCLIAR, MARILIA O.; SILVA, NAYANE S. B.; ANDRADE, HELOISA S.; SOUZA, ANDREIA S.; PEREIRA, RAPHAELA N.; CASTRO, CAMILA F. B.; MENDES-JUNIOR, CELSO T.; et al. MHC Variants Associated With Symptomatic Versus Asymptomatic SARS-CoV-2 Infection in Highly Exposed Individuals. FRONTIERS IN IMMUNOLOGY, v. 12, . (13/08028-1, 19/19998-8, 20/09702-1, 17/19223-0, 14/50931-3)
DE CAIRES, JR., LUIZ CARLOS; GOULART, ERNESTO; MELO, UIRASOUTO; HENRIQUE ARAUJO, BRUNO SILVA; ALVIZI, LUCAS; SCHANOSKI, ALESSANDRA SOARES; DE OLIVEIRA, DANYLLO FELIPE; KOBAYASHI, GERSON SHIGERU; GRIESI-OLIVEIRA, KARINA; MUSSO, CAMILA MANSO; et al. Discordant congenital Zika syndrome twins show differential in vitro viral susceptibility of neural progenitor cells. NATURE COMMUNICATIONS, v. 9, . (14/03620-2, 14/50931-3, 13/08028-1)
NOBREGA, JULIA CRISTINA LEITE; MEDEIROS, JULIANA BARBOSA; DA SILVA FREITAS, JAVANNA LACERDA GOMES; SILVA, JAIZA M. M.; SIMOES, RAISA FERNANDES MARIZ; OLINDA, RICARDO; DE FERREIRA SANTOS, JAIR LICIO; MENEZES, TARCIANA NOBRE; DE OLIVEIRA DUARTE, YEDA APARECIDA; ZATZ, MAYANA; et al. sychosocial aspects and support networks associated with disability in two longevous populations in Brazil: a cross-sectional stud. BMC GERIATRICS, v. 22, n. 1, . (14/50931-3, 05/54947-2, 13/08028-1, 09/53778-3)
PING HSIA, GABRIELLA SHIH; ESPOSITO, JOYCE; DA ROCHA, LETICIA ALVES; GUIMARAES RAMOS, SOFIA LIGIA; OKAMOTO, OSWALDO KEITH. Clinical Application of Human Induced Pluripotent Stem Cell-Derived Organoids as an Alternative to Organ Transplantation. STEM CELLS INTERNATIONAL, v. 2021, . (14/50931-3, 13/08028-1)
GOULART, ERNESTO; DE CAIRES-JUNIOR, LUIZ CARLOS; TELLES-SILVA, KAYQUE ALVES; SILVA ARAUJO, BRUNO HENRIQUE; ROCCO, SILVANA APARECIDA; SFORCA, MAURICIO; DE SOUSA, IRENE LAYANE; KOBAYASHI, GERSON S.; MUSSO, CAMILA MANSO; ASSONI, AMANDA FARIA; et al. 3D bioprinting of liver spheroids derived from human induced pluripotent stem cells sustain liver function and viability in vitro. BIOFABRICATION, v. 12, n. 1, . (17/16283-2, 13/08028-1, 14/50931-3, 15/14821-1)
DE FARIAS, ALLYSSON ALLAN; NUNES, KELLY; LEMES, RENAN BARBOSA; MOURA, RONALD; FERNANDES, GUSTAVO RIBEIRO; MELO, UIRA SOUTO; ZATZ, MAYANA; KOK, FERNANDO; SANTOS, SILVANA. Origin and age of the causative mutations in KLC2, IMPA1, MED25 and WNT7A unravelled through Brazilian admixed populations. SCIENTIFIC REPORTS, v. 8, . (13/08028-1, 14/50931-3)
LIMA, SHIRLEY O. A.; FARIAS, ALLYSSON A.; ALBINO, VICTOR A.; MARQUES-ALVES, YANNA K.; OLINDA, RICARDO; SANTOS-SILVA, TAIS A.; ALVES, LEANDRO U.; ZATZ, MAYANA; SANTOS, SILVANA. A population-based study of inter-generational attitudes towards consanguineous marriages in north-eastern Brazil. JOURNAL OF BIOSOCIAL SCIENCE, v. 51, n. 5, p. 683-697, . (13/08028-1, 14/50931-3)
BRIDE, LAIS; NASLAVSKY, MICHEL; YAMAMOTO, GUILHERME LOPES; SCLIAR, MARILIA; PIMASSONI, LUCIA H. S.; AGUIAR, PAOLA SOSSAI; DE PAULA, FLAVIA; WANG, JAQUELINE; DUARTE, YEDA; PASSOS-BUENO, MARIA RITA; et al. TCF7L2 rs7903146 polymorphism association with diabetes and obesity in an elderly cohort from Brazil. PeerJ, v. 9, . (13/08028-1, 14/50931-3)
LEITE NOBREGA, JULIA CRISTINA; MEDEIROS, JULIANA BARBOSA; DE MELO SANTOS, TACILA THAMIRES; VIEIRA ALVES, SAIONARA ACUCENA; GOMES DA SILVA FREITAS, JAVANNA LACERDA; SILVA, JAIZA M. M.; MARIZ SIMOES, RAISA FERNANDES; BRITO, ALLISSON DE LIMA; WELLER, MATHIAS; DE FERREIRA SANTOS, JAIR LICIO; et al. ocioeconomic Factors and Health Status Disparities Associated with Difficulty in ADLs and IADLs among Long-Lived Populations in Brazil: A Cross-Sectional Stud. INQUIRY-THE JOURNAL OF HEALTH CARE ORGANIZATION PROVISION AND FINANCING, v. 58, . (13/08028-1, 14/50931-3, 09/53778-3, 05/54947-2)
ROMANELLI TAVARES, VANESSA LUIZA; MONFARDINI, FREDERICO; LOURENCO, NAILA CRISTINA VILACA; DA ROCHA, KATIA MARIA; WEINMANN, KARINA; PAVANELLO, RITA; ZATZ, MAYANA. Newborn Screening for 5q Spinal Muscular Atrophy: Comparisons between Real-Time PCR Methodologies and Cost Estimations for Future Implementation Programs. INTERNATIONAL JOURNAL OF NEONATAL SCREENING, v. 7, n. 3, . (14/50931-3)
NASLAVSKY, MICHEL S.; SCLIAR, MARILIA O.; NUNES, KELLY; WANG, JAQUELINE Y. T.; YAMAMOTO, GUILHERME L.; GUIO, HEINNER; TARAZONA-SANTOS, EDUARDO; DUARTE, YEDA A. O.; PASSOS-BUENO, MARIA RITA; MEYER, DIOGO; et al. Biased pathogenic assertions of loss of function variants challenge molecular diagnosis of admixed individuals. AMERICAN JOURNAL OF MEDICAL GENETICS PART C-SEMINARS IN MEDICAL GENETICS, v. 187, n. 3, SI, p. 357-363, . (13/08028-1, 14/50649-6, 14/50931-3)
GALDINO GALISA, STEFFANY LARISSA; JACOB, PRISCILA LIMA; DE FARIAS, ALLYSSON ALLAN; LEMES, RENAN BARBOSA; ALVES, LEANDRO UCELA; LEITE NOBREGA, JULIA CRISTINA; ZATZ, MAYANA; SANTOS, SILVANA; WELLER, MATHIAS. aplotypes of single cancer driver genes and their local ancestry in a highly admixed long-lived population of Northeast Brazi. GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY, v. 45, n. 1, . (14/50931-3, 13/08028-1)
FIGUEIREDO, THALITA; MENDES, ANA P. D.; MOREIRA, DANIELLE P.; GOULART, ERNESTO; OLIVEIRA, DANYLLO; KOBAYASHI, GERSON S.; STERN, SHANI; KOK, FERNANDO; MARCHETTO, MARIA C.; SANTOS, RENATA; et al. Inositol monophosphatase 1 (IMPA1) mutation in intellectual disability patients impairs neurogenesis but not gliogenesis. MOLECULAR PSYCHIATRY, v. 26, n. 7, p. 3558-3571, . (16/09618-5, 17/19877-0, 13/08028-1, 19/18469-1, 14/50931-3)
NASLAVSKY, MICHEL SATYA; VIDIGAL, MATEUS; BARROS MATOS, LARISSA DO REGO; CORIA, VIVIAN ROMANHOLI; BATISTA JUNIOR, PEDRO BENEDITO; RAZUK, ALVARO; NASCIMENTO SALDIVA, PAULO HILARIO; DOLHNIKOFF, MARISA; SCHIDLOWSKI, LAIRE; PRANDO, CAROLINA; et al. Extreme phenotypes approach to investigate host genetics and COVID-19 outcomes. GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY, v. 44, n. 1, 1, . (13/08028-1, 14/50931-3)
AMARAL, MURILO SENA; GOULART, ERNESTO; CAIRES-JUNIOR, LUIZ CARLOS; MORALES-VICENTE, DAVID ABRAHAM; SOARES-SCHANOSKI, ALESSANDRA; GOMES, ROSELANE PAIVA; OLBERG, GIOVANNA GONCALVES DE OLIVEIRA; ASTRAY, RENATO MANCINI; KALIL, JORGE E.; ZATZ, MAYANA; et al. Differential gene expression elicited by ZIKV infection in trophoblasts from congenital Zika syndrome discordant twins. PLoS Neglected Tropical Diseases, v. 14, n. 8, . (14/03620-2, 13/08028-1, 14/50931-3, 18/23693-5)

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