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Estudos genômicos associados às características de resistência a endoparasitas em ovinos Santa Inês

Processo: 16/14522-7
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Temático
Vigência: 01 de julho de 2017 - 31 de janeiro de 2023
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
Pesquisador responsável:Claudia Cristina Paro de Paz
Beneficiário:Claudia Cristina Paro de Paz
Instituição Sede: Instituto de Zootecnia. Agência Paulista de Tecnologia dos Agronegócios (APTA). Secretaria de Agricultura e Abastecimento (São Paulo - Estado). Nova Odessa , SP, Brasil
Pesquisadores principais:
Danísio Prado Munari
Pesquisadores associados:Lenira El Faro Zadra ; Nedenia Bonvino Stafuzza ; Ricardo Lopes Dias da Costa ; Ricardo Vieira Ventura ; Rodrigo Pelicioni Savegnago
Bolsa(s) vinculada(s):20/15760-4 - Associação entre variações no número de cópias de segmentos de DNA no genoma de ovinos Santa Inês com características de resistência a endoparasitas, BP.MS
21/05245-8 - Estudo genômico populacional e de associação genômica ampla com características de conformidade corporal e resistência a endoparasitas em ovinos Santa Inês, BP.PD
18/01540-2 - Predição dos valores genômicos utilizando modelos Bayesianos e de redes neurais para características de resistência a endoparasitas em ovinos Santa Inês, BP.DR
18/13050-0 - Estudos genômicos associados às características de resistência a endoparasitas em ovinos Santa Inês, BP.TT
Assunto(s):Estudos de associação genética  Endogamia  Predição de genes  Ovinos  Ovelha Santa Inês 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:associação genômica | corrida de homozigose | endogamia | Genes candidatos | Predição genômica | Genética e Melhoramento Animal

Resumo

O rebanho ovino brasileiro cresce de maneira significativa, embora o país ainda não seja autossuficiente para atender a demanda de carne do mercado interno. Os principais motivos que fazem com que a demanda do mercado consumidor não seja atendida são relacionados com o manejo antiquado adotado pela maioria dos produtores, em que os animais são criados de forma extensiva com pouca ou nenhuma tecnologia empregada, e com a susceptibilidade da espécie aos endoparasitas, principalmente aos gastrointestinais. As principais características utilizadas para medir a resistência de ovinos a endoparasitas gastrointestinais são a Coloração da Conjuntiva Ocular (CCO), contagem de ovos por grama de fezes (OPG), Proteína Plasmática (PP), Volume Globular (VG) e coprocultura (%H) que mede a porcentagem do endoparasita Haemonchus contortus. Assim, os objetivos deste projeto serão: 1) genotipar cerca de 1.150 ovinos Santa Inês com o Ovine SNP50 Genotyping BeadChip (Illumina); 2) estimar parâmetros genéticos para as características relacionadas à resistência a verminose em ovinos Santa Inês, por meio de modelos mistos utilizando o método da máxima verossimilhança restrita e inferência Bayesiana; 3) realizar estudos de seleção genômica utilizando modelos lineares, Bayesianos e de Redes Neurais para obtenção dos valores genômicos para as características em estudo; 4) realizar estudo de associação genômica ampla (GWAS) para as características em estudo; 5) calcular o desequilíbrio de ligação e os níveis de endogamia da população e estimar seus efeitos (depressão endogâmica) sobre as características estudadas por meio de corridas de homozigose (ROH); 6) identificar regiões com variações no número de cópias nos segmentos de DNA (CNVs) visando detectar genes candidatos relacionadas com as características estudadas. Serão realizadas análises de enriquecimento funcional a partir das regiões identificadas por GWAS e as regiões de CNV, utilizando o software DAVID (v.6.7). Com esse projeto espera-se conhecer as estimativas de parâmetros genéticos relacionados às características de resistência a verminoses gastrointestinais para condução de programas de melhoramento genético incluindo essas características como objetivo de seleção; avaliar o ganho em acurácia de predição dos valores genéticos/genômicos utilizando informação de marcadores SNPs nos modelos de predição genômica em relação aos modelos tradicionais; avaliar a necessidade de controlar o nível de endogamia utilizando informação genômica; e caracterizar regiões genômicas associadas com essas características a fim de identificar genes candidatos. (AU)

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Publicações científicas (4)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
DE FREITAS, LUARA AFONSO; SAVEGNAGO, RODRIGO PELICIONI; MENEGATTO, LEONARDO SARTORI; DO BEM, RICARDO DUTRA; STAFUZZA, NEDENIA BONVINO; ALMEIDA ROLLO DE PAZ, ANA CAROLINA; PIRES, BIANCA VILELA; DIAS DA COSTA, RICARDO LOPES; PARO DE PAZ, CLAUDIA CRISTINA. Cluster analysis to explore additive-genetic patterns for the identification of sheep resistant, resilient and susceptible to gastrointestinal nematodes. Veterinary Parasitology, v. 301, p. 5-pg., . (16/14522-7, 18/01540-2, 12/15982-0)
OLIVEIRA, ELISA JUNQUEIRA; SAVEGNAGO, RODRIGO PELICIONI; FREITAS, ANIELLY DE PAULA; DE FREITAS, LUARA AFONSO; DE PAZ, ANA CAROLINA ALMEIDA ROLLO; EL FARO, LENIRA; SIMILI, FLAVIA FERNANDA; VERCESI FILHO, ANIBAL EUGENIO; DA COSTA, RICARDO LOPES DIAS; DE PAZ, CLAUDIA CRISTINA PARO. Genetic parameters for body weight and morphometric traits in Santa Ines sheep using Bayesian inference. Small Ruminant Research, v. 201, . (18/01540-2, 12/15982-0, 16/14522-7)
FREITAS, LUARA; FERREIRA, RAFAEL; SAVEGNAGO, RODRIGO; DOREA, JOAO R.; ROSA, GUILHERME J. J. M.; PAZ, CLAUDIA. Computer Vision System to Predict Famacha (c) Degree in Sheep from Ocular Conjunctiva Images. JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE, v. 100, p. 1-pg., . (16/14522-7, 18/01540-2, 20/03575-8)
FREITAS, LUARA; SAVEGNAGO, RODRIGO; CARVALHO ALVES, ANDERSON A.; COSTA, RICARDO; ROSA, GUILHERME J. J. M.; PAZ, CLAUDIA. Classification Performance of Multinomial Logistic Regression for Identifying Resistance, Resilience, and Susceptibility to Gastrointestinal Nematode Infections in Sheep. JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE, v. 100, p. 1-pg., . (16/14522-7, 18/01540-2, 20/03575-8)

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