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INCT 2014: de genômica comparativa e funcional e melhoramento assistido de citros

Resumo

O agronegócio da citricultura brasileira se destaca como uma das mais importantes atividades do setor agrícola os estados de São Paulo, Sergipe e Bahia são os principais produtores de citros e o Brasil o maior exportador de sucos concentrado congelado (FCOJ) e suco não concentrado (NFC). A baixa produtividade agrícola brasileira (média de 2 caixas de 40,8 kg/planta/ano) ainda está associada à expansão simultânea de pragas e doenças, com significativo reflexo nos custos de produção, ao plantio em áreas sem irrigação e à estreita base genética da citricultura industrial. Estima-se que mais de 80 % dos custos de produção de citros no Brasil estejam relacionados ao controle fitossanitários de pragas e doenças. Entre estas destacam-se huanglongbing (HLB), leprose, Clorose Variegada dos Citros (CVC), pinta preta (MPC), Mancha Marrom de Alternaria (MMA), morte súbita, cancro cítrico, gomose e tristeza. O esgotamento do modelo de convivência ou de controle químico de vetores de doenças com seus altos custos financeiros e ambientais têm destacado a importância dos trabalhos de melhoramento genético, como estratégia abrangente e duradoura de controle de doenças. O Centro de Citricultura Sylvio Moreira do Instituto Agronômico de Campinas e a Embrapa atuam há vários anos no melhoramento dos citros, desenvolvendo trabalhos de produção e avaliação de novos materiais genéticos incorporando ferramentas de biotecnologia para acelerar ganhos genéticos. Como sede do INCT Citros, o Centro de Citricultura ampliou o banco de dados de genomas de citros, integrando melhoramento genético, genoma comparativo e funcional de citros e alguns de seus patógenos. Além de gerar o maior banco de dados de genoma de citros no mundo, esse projeto ampliou sobremaneira o número de novos híbridos de copa e porta-enxertoscitros em avaliação de campo, além de marcadores moleculares para mapeamento genético e descobriu novos genes potencialmente associados à resistência a doenças. A presente proposta submetida ao Edital 016/2014 dos INCT representa a continuidade e expansão do programa do INCT Citros, com os principais grupos de pesquisa que trabalham com citros no Brasil, focalizando os temas relacionados ao melhoramento genético e genoma comparativo e funcional de citros e seus patógenos. Essa nova proposta do INCT Citros mantém a estrutura de três plataformas, otimizando-as e procurando integrá-Ias, com foco no desenvolvimento de novos conhecimentos e tecnologia ao setor citrícola. Plataforma de genômica comparativa, com foco nos estudos de genoma comparativo de mais genótipos de citros, conclusão dos genomas de importantes patógenos, além de ampliar a base de dados sobre miRNA e processos com regulação epigénetica. O entendimento das relações citros e seus patógenos, a prospecção de genes e promotores, a diversidade genômica do grupo citros (plataforma de SNPs) e a regulação de processos genéticos, são aspectos mais relevantes nessa plataforma. Plataforma de genômica funcional reúne projetos específicos em todos os patossistemas com objetivo de ampliar os conhecimentos potencialmente aplicáveis nas fases seguintes do programa. Todas as propostas têm focos específicos derivados dos conhecimentos gerados no INCT anterior. Plataforma melhoramento assistido é a plataforma mais tecnológica do INCT Citros e representa a interface avançada do melhoramento na qual muitas das informações geradas previamente (marcadores, mapas, genes, promotores), assim como material genético (híbridos de cruzamento controlado e eventos de transformação genética já obtidos) estão sendo validados em condições de campo, permitindo uma razoável aproximação da estratégia de melhoramento assistido por marcadores. O programa conta com a participação das principais equipes de pesquisadores no Brasil que atuam em pesquisa e desenvolvimento em citricultura. Vários colaboradores externos foram convidados por serem líderes em suas áreas e pela disponibilidade de receber alunos e pesquisadores em seus grupos. A sede do INCT será novamente o Centro de Citricultura Sylvio Moreira, do Instituto Agronômico de Campinas. Participam também do INCT como laboratórios associadas a Embrapa (Mandioca e Fruticultura, em Cruz das Almas-BA e Clima Temperado, em Pelotas-RS), Universidade de São Paulo (Instituto de Química, Esalq e Cena), Universidade Estadual Paulista (Unesp, Rio Claro), Instituto Biológico, Universidade Federal do Paraná, Laboratório Nacional de Biociências (LNBio), Universidade Estadual de Santa Cruz (Ilhéus), Universidade Federal de Campina Grande, Universidade Estadual do Sudoeste da Bahia (Vitória da Conquista), Universidade Estadual de Maringá e Instituto Agronômico do Paraná (IAPar). Como colaboradores externos incluem a Universidade da Flórida (Citurs Research and Education Center, em Lake Alfred), Universidade da Califórnia (Davis e Berkeley), John Innes Institute (Norwich, Inglaterra), Instituto Valencia no de Investigaciones Agrícolas (IVIA, Espanha), Martin-Luther-Universitãt Halte Wintenberg (Halte, Alemanha), US Department of Agriculture (USDA, Fort Pierce e Fort Collins), Instituto per Ia Protezione Sostenibile deite Plante (UOS, Bari, Itália) e University of Ghent (Bégica). Participam como colaboradores as empresas Citrosuco SA e Agrolatina Ltda. (AU)

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(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
DALIO, RONALDO J. D.; PASCHOAL, DANIELE; ARENA, GABRIELLA D.; MAGALHAES, DIOGO M.; OLIVEIRA, TIAGO S.; MERFA, MARCUS V.; MAXIMO, HEROS J.; MACHADO, MARCOS A. Hypersensitive response: From NLR pathogen recognition to cell death response. Annals of Applied Biology, NOV 2020. Citações Web of Science: 0.
COSTA ARANTES, ANA CAROLINA; COTTA, SIMONE RAPOSO; DA CONCEICAO, PATRICIA MARLUCI; MENEGHIN, SILVANA PERISSATTO; MARTINELLI, RODRIGO; PROSPERO, ALEXANDRE GONCALVES; BOARETTO, RODRIGO MARCELLI; ANDREOTE, FERNANDO DINI; MATTOS-JR, DIRCEU; DE AZEVEDO, FERNANDO ALVES. Implication of Urochloa spp. Intercropping and Conservation Agriculture on Soil Microbiological Quality and Yield of Tahiti Acid Lime in Long Term Orchard Experiment. AGRICULTURE-BASEL, v. 10, n. 11 NOV 2020. Citações Web of Science: 0.
LOURENCO PETTERS-VANDRESEN, DESIRRE ALEXIA; ROSSI, BRUNO JANOSKI; GROENEWALD, JOHANNES Z.; CROUS, PEDRO W.; MACHADO, MARCOS ANTONIO; STUKENBROCK, EVA H.; GLIENKE, CHIRLEI. Mating-type locus rearrangements and shifts in thallism states in Citrus-associated Phyllosticta species. Fungal Genetics and Biology, v. 144, NOV 2020. Citações Web of Science: 0.
PEREIRA, WILLIAN EDUARDO LINO; DE ANDRADE, SHEILA MARIA PEREIRA; DEL PONTE, EMERSON M.; ESTEVES, MARIANA BOSSI; CANALE, MARIA CRISTINA; TAKITA, MARCO AURELIO; COLETTA-FILHO, HELVECIO DELLA; DE SOUZA, ALESSANDRA ALVES. Severity assessment in the Nicotiana tabacum-Xylella fastidiosa subsp. pauca pathosystem: design and interlaboratory validation of a standard area diagram set. TROPICAL PLANT PATHOLOGY, v. 45, n. 6, SI NOV 2020. Citações Web of Science: 0.
DILARRI, GUILHERME; ZAMUNER, CAIO F. C.; MENDES, CAROLINA R.; JUNIOR, JOSE R. M.; MORAO, LUANA G.; MONTAGNOLLI, RENATO N.; BIDOIA, EDERIO D.; FERREIRA, HENRIQUE. Evaluating the potential of electrolysed water for the disinfection of citrus fruit in packinghouses. Journal of the Science of Food and Agriculture, OCT 2020. Citações Web of Science: 0.
ANDRADE, MAXUEL OLIVEIRA; SFORCA, MAURICIO LUIS; HELENO BATISTA, FERNANDA APARECIDA; MIGLIORINI FIGUEIRA, ANA CAROLINA; BENEDETTI, CELSO EDUARDO. The MAF1 Phosphoregulatory Region Controls MAF1 Interaction with the RNA Polymerase III C34 Subunit and Transcriptional Repression in Plants. PLANT CELL, v. 32, n. 9, p. 3019-3035, SEP 2020. Citações Web of Science: 0.
ARENA, GABRIELLA D.; RAMOS-GONZALEZ, PEDRO LUIS; FALK, BRYCE W.; CASTEEL, CLARE L.; FREITAS-ASTUA, JULIANA; MACHADO, MARCOS A. Plant Immune System Activation Upon Citrus Leprosis Virus C Infection Is Mimicked by the Ectopic Expression of the P61 Viral Protein. FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, v. 11, AUG 7 2020. Citações Web of Science: 0.
CAVALCA, LUCIA B.; ZAMUNER, CAIO F. C.; SALDANHA, LUIZ L.; POLAQUINI, CARLOS R.; REGASINI, LUIS O.; BEHLAU, FRANKLIN; FERREIRA, HENRIQUE. Hexyl gallate for the control of citrus canker caused byXanthomonas citrisubspcitri. MICROBIOLOGYOPEN, v. 9, n. 9 AUG 2020. Citações Web of Science: 0.
PACHECO, INAIARA DE SOUZA; GALDEANO, DIOGO MANZANO; SPOTTI LOPES, JOAO ROBERTO; MACHADO, MARCOS ANTONIO. Development on Infected Citrus over Generations Increases Vector Infection by `CandidatusLiberibacter Asiaticus inDiaphorina citri'. INSECTS, v. 11, n. 8 AUG 2020. Citações Web of Science: 0.
GRANATO, LAIS MOREIRA; OLIVEIRA, TIAGO S.; BOSCARIOL-CAMARGO, RAQUEL L.; GALDEANO, DIOGO M.; SILVA, V, NICHOLAS; MAXIMO, HEROS J.; DALIO, RONALDO J. D.; MACHADO, MARCOS A. `CandidatusLiberibacter asiaticus' putative effectors:in silicoanalysis and gene expression in citrus leaves displaying distinct huanglongbing symptoms. TROPICAL PLANT PATHOLOGY, v. 45, n. 6, SI JUL 2020. Citações Web of Science: 0.
MOREIRA MARTINS, PAULA MARIA; ANDRADE, MAXUEL DE OLIVEIRA; BENEDETTI, CELSO EDUARDO; DE SOUZA, ALESSANDRA ALVES. Xanthomonas citri subsp. citri: host interaction and control strategies. TROPICAL PLANT PATHOLOGY, v. 45, n. 3, SI JUN 2020. Citações Web of Science: 0.
SORATTO, TATIANY APARECIDA TEIXEIRA; CURTOLO, MAIARA; MARENGO, SAMANTA; DEZOTTI, ANA LUCIA; LIMA, ROMULO PEDRO MACEDO; GAZAFFI, RODRIGO; MACHADO, MARCOS ANTONIO; CRISTOFANI-YALY, MARIANGELA. QTL and eQTL mapping associated with host response toCandidatusLiberibacter asiaticus in citrandarins. TROPICAL PLANT PATHOLOGY, v. 45, n. 6, SI MAY 2020. Citações Web of Science: 0.
MAIARA CURTOLO; LAÍS MOREIRA GRANATO; TATIANY APARECIDA TEIXEIRA SORATTO; MAISA CURTOLO; RODRIGO GAZAFFI; MARCO AURÉLIO TAKITA; MARIÂNGELA CRISTOFANI-YALY; MARCOS ANTONIO MACHADO. Expression Quantitative Trait Loci (eQTL) mapping for callose synthases in intergeneric hybrids of Citrus challenged with the bacteria Candidatus Liberibacter asiaticus. GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY, v. 43, n. 2, p. -, 2020. Citações Web of Science: 0.
GRANATO, LAIS MOREIRA; PICCHI, SIMONE CRISTINA; ANDRADE, MAXUEL DE OLIVEIRA; MARTINS, PAULA MARIA MOREIRA; TAKITA, MARCO AURELIO; MACHADO, MARCOS ANTONIO; DE SOUZA, ALESSANDRA ALVES. The ecnA Antitoxin Is Important Not Only for Human Pathogens: Evidence of Its Role in the Plant Pathogen Xanthomonas citri subsp. citri. Journal of Bacteriology, v. 201, n. 20 OCT 2019. Citações Web of Science: 0.
POLAQUINI, CARLOS R.; MORAO, LUANA G.; NAZARE, ANA C.; TORREZAN, GUILHERME S.; DILARRI, GUILHERME; CAVALCA, LUCIA B.; CAMPOS, DEBORA L.; SILVA, ISABEL C.; PEREIRA, JESSE A.; SCHEFFERS, DIRK-JAN; DUQUE, CRISTIANE; PAVAN, FERNANDO R.; FERREIRA, HENRIQUE; REGASINI, LUIS O. Antibacterial activity of 3,3 `-dihydroxycurcumin (DHC) is associated with membrane perturbation. BIOORGANIC CHEMISTRY, v. 90, n. SI SEP 2019. Citações Web of Science: 0.
PETRY, FABIANE C.; DE NADAI, FABIO B.; CRISTOFANI-YALY, MARIANGELA; LATADO, RODRIGO R.; MERCADANTE, ADRIANA Z. Carotenoid biosynthesis and quality characteristics of new hybrids between tangor (Citrus reticulata x C. sinensis) cv. `Murcott' and sweet orange (C. sinensis) cv. `Pera'. Food Research International, v. 122, p. 461-470, AUG 2019. Citações Web of Science: 5.
SHIMO, HUGO MASSAYOSHI; TERASSI, CAROLINA; SILVA, CAIO CESAR LIMA; ZANELLA, JACKELINE DE LIMA; MERCALDI, GUSTAVO FERNANDO; ROCCO, SILVANA APARECIDA; BENEDETTI, CELSO EDUARDO. Role of the Citrus sinensis RNA deadenylase CsCAF1 in citrus canker resistance. MOLECULAR PLANT PATHOLOGY, v. 20, n. 8, p. 1105-1118, AUG 2019. Citações Web of Science: 1.
RODRIGUES, CAROLINA MUNARI; TAKITA, MARCO AURELIO; SILVA, NICHOLAS VINICIUS; RIBEIRO-ALVES, MARCELO; MACHADO, MARCOS ANTONIO. Comparative genome analysis of Phyllosticta citricarpa and Phyllosticta capitalensis, two fungi species that share the same host. BMC Genomics, v. 20, JUL 5 2019. Citações Web of Science: 2.
SILVA, MATHEUS C.; SOUSA, ANDRESSA R. O.; CRUZ, ELAINE S.; SCHLICHTING, ALESSANA F.; SOARES FILHO, WALTER S.; GESTEIRA, ABELMON S.; COELHO FILHO, MAURICIO A.; COSTA, MARCIO G. C. Phenotyping of new hybrid citrus rootstocks under water deficit reveals conserved and novel physiological attributes of drought tolerance. ACTA PHYSIOLOGIAE PLANTARUM, v. 41, n. 6 JUN 2019. Citações Web of Science: 0.
ROGERIO, LUANA APARECIDA; GALDEANO, DIOGO MANZANO; ARENA, GABRIELLA DIAS; NUNES, MARIA ANDREIA; MACHADO, MARCOS ANTONIO; NOVELLI, VALDENICE MOREIRA. Reference genes for gene expression studies by RT-qPCR in Brevipalpus yothersi (Acari: Tenuipalpidae), the mite vector of citrus leprosis virus. SCIENTIFIC REPORTS, v. 9, APR 25 2019. Citações Web of Science: 0.
MORAO, LUANA G.; POLAQUINI, CARLOS R.; KOPACZ, MALGORZATA; TORREZAN, GUILHERME S.; AYUSSO, GABRIELA M.; DILARRI, GUILHERME; CAVALCA, LUCIA B.; ZIELINSKA, ALEKSANDRA; SCHEFFERS, DIRK-JAN; REGASINI, LUIS O.; FERREIRA, HENRIQUE. A simplified curcumin targets the membrane of Bacillus subtilis. MICROBIOLOGYOPEN, v. 8, n. 4 APR 2019. Citações Web of Science: 2.
GONCALVES, LUANA P.; BOSCARIOL CAMARGO, RAQUEL L.; TAKITA, MARCO AURELIO; MACHADO, MARCOS A.; DOS SOARES FILHO, WALTER S.; COSTA, MARCIO G. C. Rootstock-induced molecular responses associated with drought tolerance in sweet orange as revealed by RNA-Seq. BMC Genomics, v. 20, FEB 6 2019. Citações Web of Science: 3.
MAURICIO, F. N.; SORATTO, T. A. T.; DIOGO, J. A.; BOSCARIOL-CAMARGO, R. L.; DE SOUZA, A. A.; COLETTA-FILHO, H. D.; SILVA, J. A. A.; MEDEIROS, A. H.; MACHADO, M. A.; CRISTOFANI-YALY, M. Analysis of Defense-Related Gene Expression in Citrus Hybrids Infected by Xylella fastidiosa. PHYTOPATHOLOGY, v. 109, n. 2, p. 301-306, FEB 2019. Citações Web of Science: 1.
NAVIA, DENISE; NOVELLI, VALDENICE M.; ROMBAUTS, STEPHANE; FREITAS-ASTUA, JULIANA; DE MENDONCA, RENATA SANTOS; NUNES, MARIA ANDREIA; MACHADO, MARCOS A.; LIN, YAO-CHENG; LE, PHUONG; ZHANG, ZAICHAO; GRBIC, MIODRAG; WYBOUW, NICKY; BREEUWER, JOHANNES A. J.; VAN LEEUWEN, THOMAS; VAN DE PEER, YVES. Draft Genome Assembly of the False Spider Mite Brevipalpus yothersi. MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS, v. 8, n. 6 FEB 2019. Citações Web of Science: 2.
GUIMARAES, RONEY FONTES; CAMILLO, LUCIANA RODRIGUES; SOUSA, AURIZANGELA OLIVEIRA; GONCALVES, LUANA PEREIRA; CARDOSO MACEDO, JAMILLY COSTA; SIQUEIRA, GIOVANO SOUSA; MAGALHAES BARBOSA, ANTONIA MARLENE; ALVIM, FATIMA CERQUEIRA; CARDOSO COSTA, MARCIO GILBERTO; PIROVANI, CARLOS PRIMINHO. Genome-wide identification and expression analysis of the molecular chaperone binding protein BiP genes in Citrus. Tree Genetics & Genomes, v. 14, n. 6 DEC 2018. Citações Web of Science: 0.
ARENA, GABRIELLA D.; RAMOS-GONZALEZ, PEDRO L.; ROGERIO, LUANA A.; RIBEIRO-ALVES, MARCELO; CASTEEL, CLARE L.; FREITAS-ASTUA, JULIANA; MACHADO, MARCOS A. Making a Better Home: Modulation of Plant Defensive Response by Brevipalpus Mites. FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, v. 9, AUG 15 2018. Citações Web of Science: 4.
SAVIETTO, ABIGAIL; POLAQUINI, CARLOS ROBERTO; KOPACZ, MALGORZATA; SCHEFFERS, DIRK-JAN; MARQUES, BEATRIZ CARVALHO; REGASINI, LUIS OCTAVIO; FERREIRA, HENRIQUE. Antibacterial activity of monoacetylated alkyl gallates against Xanthomonas citri subsp citri. Archives of Microbiology, v. 200, n. 6, p. 929-937, AUG 2018. Citações Web of Science: 6.
LIMA, ROMULO P. M.; CURTOLO, MAIARA; MERFA, MARCUS V.; CRISTOFANI-YALY, MARIANGELA; MACHADO, MARCOS A. QTLs and eQTLs mapping related to citrandarins' resistance to citrus gummosis disease. BMC Genomics, v. 19, JUL 3 2018. Citações Web of Science: 0.
PEREIRA, SUZAM L. S.; MARTINS, CRISTINA P. S.; SOUSA, AURIZANGELA O.; CAMILLO, LUCIANA R.; ARAUJO, CAROLINE P.; ALCANTARA, GRAZIELLE M.; CAMARGO, DANIELLE S.; CIDADE, LUCIANA C.; DE ALMEIDA, ALEX-ALAN F.; COSTA, MARCIO G. C. Genome-wide characterization and expression analysis of citrus NUCLEAR FACTOR-Y (NF-Y) transcription factors identified a novel NF-YA gene involved in drought-stress response and tolerance. PLoS One, v. 13, n. 6 JUN 15 2018. Citações Web of Science: 4.
MARTINS, PAULA M. M.; MERFA, MARCUS V.; TAKITA, MARCO A.; DE SOUZA, ALESSANDRA A. Persistence in Phytopathogenic Bacteria: Do We Know Enough?. FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, v. 9, MAY 25 2018. Citações Web of Science: 13.
DURIGAN DALIO, RONALDO JOSE; MAXIMO, HEROS JOSE; OLIVEIRA, TIAGO SILVA; AZEVEDO, THAMARA DE MEDEIROS; FELIZATTI, HENRIQUE LEME; CAMPOS, MAGNOLIA DE ARAUJO; MACHADO, MARCOS ANTONIO. Molecular Basis of Citrus sunki Susceptibility and Poncirus trifoliata Resistance Upon Phytophthora parasitica Attack. MOLECULAR PLANT-MICROBE INTERACTIONS, v. 31, n. 3, p. 386-398, MAR 2018. Citações Web of Science: 4.
CURTOLO, MAIARA; TEIXEIRA SORATTO, TATIANY APARECIDA; GAZAFFI, RODRIGO; TAKITA, MARCO AURELIO; MACHADO, MARCOS ANTONIO; CRISTOFANI-YALY, MARIANGELA. High-density linkage maps for Citrus sunki and Poncirus trifoliata using DArTseq markers. Tree Genetics & Genomes, v. 14, n. 1 FEB 2018. Citações Web of Science: 3.
DALIO, RONALDO J. D.; HERLIHY, JOHN; OLIVEIRA, TIAGO S.; MCDOWELL, JOHN M.; MACHADO, MARCOS. Effector Biology in Focus: A Primer for Computational Prediction and Functional Characterization. MOLECULAR PLANT-MICROBE INTERACTIONS, v. 31, n. 1, p. 22-33, JAN 2018. Citações Web of Science: 5.
FERNANDES DE CAMPOS, KELLY APARECIDA; DE AZEVEDO, FERNANDO ALVES; BASTIANEL, MARINES; CRISTOFANI-YALY, MARIANGELA. RESISTANCE TO ALTERNARIA BROWN SPOT OF NEW CITRUS HYBRIDS. Revista Brasileira de Fruticultura, v. 39, n. 5, p. 1-10, 2017. Citações Web of Science: 0.

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