Rede multidisciplinar internacional para caracterização de aspectos microbiológicos e da história natural de Infecções Fúngicas Invasivas (IFI) por espécies do gênero Candida

• Processo: 17/02203-7
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Temático
• Vigência: 01 de novembro de 2017 - 31 de outubro de 2023
• Área do conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina
• Pesquisador responsável: Arnaldo Lopes Colombo
• Beneficiário: Arnaldo Lopes Colombo
• Instituição Sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Analy Salles de Azevedo Melo ; Jacques Franciscus Meis ; João Nóbrega de Almeida Júnior ; Marcio Luiz Moore Nucci
• Bolsa(s) vinculada(s): 22/01293-0 - Avaliação de mecanismos moleculares de resistência de Candida tropicalis em amostras de hemoculturas de 3 países da América Latina, BP.TT; 21/00527-5 - Mecanismos de virulência e patogenicidade expressos por cepas de Candida spp. ao longo de episódios de Candidemia persistente, BP.PD; 20/12082-5 - Avaliação de mecanismos moleculares de resistência de Candida tropicalis em amostras de hemoculturas de 3 países da América Latina, BP.TT; 18/16641-9 - Vigilância da colonização e infecção por Candida auris em imigrantes venezuelanos no Brasil, BP.IC; 17/19095-2 - Avaliação da virulência e resposta imune frente à Candida auris utilizando o modelo alternativo Caenorhabditis elegans, BP.PD
• Assunto(s): Micologia Micoses Antifúngicos Candida Candidemia Proteômica Virulência
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: antifungal resistance | Candida spp | Candidemia | Proteomics | virulence | yeast identification | Micologia

Resumo

Infecções de Corrente Sanguínea (ICSs) por Candida spp. representam hoje um problema de saúde pública em todo o mundo, em particular no Brasil, onde ao lado de alta incidência esta complicação infecciosa apresenta taxas de mortalidade global da ordem de 50 a 70%. Ampliar o conhecimento de aspectos relacionados à epidemiologia e patogênese destas infecções, incluindo aquelas causadas por patógenos emergentes, é etapa fundamental para estabelecermos estratégias mais eficientes para o diagnóstico, controle e tratamento de Candidemia. Neste contexto, estabelecemos uma rede multidisciplinar e internacional de investigadores para estudar os seguintes aspectos: 1) epidemiologia das infecções de corrente sanguínea por Candida em centros médicos do Brasil e América Latina; 2) avaliação da ocorrência de disseminação clonal de cepas de espécies prevalentes de Candida em amostras de hemocultivo obtidas de pacientes internados em hospitais terciários do Brasil e Espanha; 3) epidemiologia das infecções invasivas por espécies crípticas de Candida e desenvolvimento de estratégias para sua identificação; 4) mecanismos de virulência e patogenicidade expressos por cepas de C. albicans ao longo de episódios de Candidemia persistente; 5) prevalência de resistência de Candida spp. a antifúngicos e mecanismos moleculares envolvidos. Utilizaremos dados clínicos, epidemiológicos e microbiológicos de mais de 2.000 episódios de Fungemia coletados ao longo de estudos de colaboração envolvendo 21 centros médicos no Brasil e América Latina. A identificação de espécies de Candida envolverá técnicas de sequenciamento da região ITS de rDNA, obtendo-se ainda a análise do perfil proteico por técnica de MALDI-TOF MS. A tipagem molecular para caracterização de disseminação clonal de cepas de Candida no ambiente hospitalar será feita por técnica de microssatélites ou AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism), na dependência das espécies envolvidas. O perfil genômico e transcriptômico de isolados de C. albicans obtidos de episódios de Fungemia persistente será analisado para caracterização de fatores de virulência. A triagem de cepas resistentes a antifúngicos será realizada por ensaios de microdiluição em caldo (CLSI), sendo que isolados com valores de CIMs acima do ECV (valor de cutoff epidemiológico) serão investigados em relação a presença de mutações nos genes ERG11, FKS1 e FKS2, expressão de bombas de efluxo e instabilidade genética em genes reparadores de mutações, na dependência do padrão de resistência encontrado. Ao final, esperamos consolidar nossa rede de colaboração com centros de pesquisa no Brasil e no exterior, trabalhando em conjunto com 8 pesquisadores de 3 diferentes continentes para esclarecer aspectos relevantes da história natural de infecções causadas por diferentes espécies de Candida, validar novas estratégias diagnósticas e ampliar o conhecimento sobre mecanismos envolvidos na patogênese de episódios de Candidemia persistente e sobre os mecanismos moleculares de resistência destes agentes a diferentes antifúngicos. (AU)

Publicações científicas

(23)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

DE ALMEIDA, JR., JOAO N.; FRANCISCO, ELAINE C.; HAGEN, FERRY; BRANDAO, IGOR B.; PEREIRA, FELICIDADE M.; PRESTA DIAS, PEDRO H.; DE MIRANDA COSTA, MAGDA M.; DE SOUZA JORDAO, REGIANE T.; DE GROOT, THEUN; COLOMBO, ARNALDO L.. Emergence of Candida auris in Brazil in a COVID-19 Intensive Care Unit. JOURNAL OF FUNGI, v. 7, n. 3, MAR 2021. (18/19347-4, 17/02203-7)

BARRETO, THAYNA LOPES; ROSSATO, LUANA; DUARTE DE FREITAS, ALINE LUIZA; MEIS, JACQUES F.; LOPES, LUCIANA BIAGINI; COLOMBO, ARNALDO LOPES; ISHIDA, KELLY. Miltefosine as an alternative strategy in the treatment of the emerging fungus Candida auris. INTERNATIONAL JOURNAL OF ANTIMICROBIAL AGENTS, v. 56, n. 2, AUG 2020. (17/19374-9, 18/13877-1, 18/03708-8, 17/15226-5, 17/02203-7, 17/19095-2)

DIAZ-GARCIA, JUDITH; ARENDRUP, MAIKEN C.; CANTON, RAFAEL; GARCIA-RODRIGUEZ, JULIO; GOMEZ, ANA; GOMEZ, ELIA; ORDEN, BEATRIZ; PARISI, GABRIELLA; PEMAN, JAVIER; POSTERARO, BRUNELLA; et al. Candidemia Candida albicans clusters have higher tendency to form biofilms than singleton genotypes. Medical Mycology, v. 58, n. 7, p. 887-895, OCT 2020. (17/02203-7)

ESTEVES, PATRICIA; LOPES LIMA, SORAIA; SALLES DE AZEVEDO MELO, ANALY; MARIA BEIRAO, ELISA; NUCCI, MARCIO; COLOMBO, ARNALDO L.. (1,3)-beta-D-glucan is able to predict therapeutic failure of patients with candidemia and not only mortality. MYCOSES, v. 64, n. 3, DEC 2020. (17/02203-7)

PECANHA-PIETROBOM, PAULA M.; COLOMBO, ARNALDO LOPES. Mind the gaps: challenges in the clinical management of invasive candidiasis in critically ill patients. Current Opinion in Infectious Diseases, v. 33, n. 6, p. 441-448, DEC 2020. (17/02203-7)

LIMA, SORAIA LOPES; FRANCISCO, ELAINE CRISTINA; DE ALMEIDA JUNIOR, JOAO NOBREGA; SANTOS, DANIEL WAGNER DE CASTRO LIMA; CARLESSE, FABIANE; QUEIROZ-TELLES, FLAVIO; MELO, ANALY SALLES DE AZEVEDO; COLOMBO, ARNALDO LOPES. Increasing Prevalence of Multidrug-ResistantCandida haemuloniiSpecies Complex among All Yeast Cultures Collected by a Reference Laboratory over the Past 11 Years. JOURNAL OF FUNGI, v. 6, n. 3, SEP 2020. (17/02203-7)

LIMA, SORAIA L.; COLOMBO, ARNALDO L.; DE ALMEIDA JUNIOR, JOAO N.. Fungal Cell Wall: Emerging Antifungals and Drug Resistance. FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, v. 10, NOV 21 2019. (17/02203-7)

BASTOS, RAFAEL WESLEY; ROSSATO, LUANA; VALERO, CLARA; LAGROU, KATRIEN; COLOMBO, ARNALDO LOPES; GOLDMAN, GUSTAVO H.. Potential of Gallium as an Antifungal Agent. FRONTIERS IN CELLULAR AND INFECTION MICROBIOLOGY, v. 9, DEC 11 2019. (16/07870-9, 17/02203-7, 17/19095-2)

KORDALEWSKA, MILENA; CANCINO-PRADO, GESELLE; DE ALMEIDA JR, JOAO NOBREGA; BRANDAO, IGOR BRASIL; PERAL, RENATA TIGULINI DE SOUZA; COLOMBO, ARNALDO. L. L.; PERLIN, DAVID. S. S.. Novel Non-Hot Spot Modification in Fks1 of Candida auris Confers Echinocandin Resistance. Antimicrobial Agents and Chemotherapy, v. 67, n. 6, p. 4-pg., 2023-05-24. (17/02203-7)

LIMA, RICARDO; RIBEIRO, FELIPE C.; COLOMBO, ARNALDO L.; DE ALMEIDA JR, JOAO N.. The emerging threat antifungal-resistant Candida tropicalis in humans, animals, and environment. FRONTIERS IN FUNGAL BIOLOGY, v. 3, p. 11-pg., 2022-08-15. (17/02203-7, 18/19347-4)

ROSSATO, LUANA; CARLESSE, FABIANNE; DE ALMEIDA, JOAO NOBREGA, JR.; KONTOYIANNIS, DIMITRIOS P.; COLOMBO, ARNALDO LOPES. How different is invasive fusariosis in pediatric patients than in adults? A systematic review. Current Opinion in Infectious Diseases, v. 34, n. 6, p. 8-pg., 2021-12-01. (18/19347-4, 17/02203-7)

NOBREGA DE ALMEIDA, JR., JOAO; BRANDAO, IGOR B.; FRANCISCO, ELAINE C.; DE ALMEIDA, SILVIO LUIS R.; DE OLIVEIRA DIAS, PATRICIA; PEREIRA, FELICIDADE M.; SANTOS FERREIRA, FABIO; DE ANDRADE, THAISSE SOUZA; DE MIRANDA COSTA, MAGDA M.; DE SOUZA JORDAO, REGIANE T.; et al. Axillary Digital Thermometers uplifted a multidrug-susceptible Candida auris outbreak among COVID-19 patients in Brazil. MYCOSES, v. 64, n. 9, p. 1062-1072, SEP 2021. (17/02203-7)

NOBREGA DE ALMEIDA, JR., JOAO; BRANDAO, IGOR B.; FRANCISCO, ELAINE C.; DE ALMEIDA, SILVIO LUIS R.; DE OLIVEIRA DIAS, PATRICIA; PEREIRA, FELICIDADE M.; SANTOS FERREIRA, FABIO; DE ANDRADE, THAISSE SOUZA; DE MIRANDA COSTA, MAGDA M.; DE SOUZA JORDAO, REGIANE T.; et al. Axillary Digital Thermometers uplifted a multidrug-susceptible Candida auris outbreak among COVID-19 patients in Brazil. MYCOSES, JUN 2021. (17/02203-7)

ROSSATO, LUANA; COLOMBO, ARNALDO LOPES. Candida auris: What Have We Learned About Its Mechanisms of Pathogenicity?. FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, v. 9, DEC 12 2018. (17/19095-2, 17/02203-7)

DIAZ-GARCIA, JUDITH; ARENDRUP, MAIKEN C.; CANTON, RAFAEL; GARCIA-RODRIGUEZ, JULIO; GARCIA DE LA PEDROSA, ELIA GOMEZ; PARISI, GABRIELLA; PEMAN, JAVIER; POSTERARO, BRUNELLA; SANGUINETTI, MAURIZIO; DA MATTA, DANIEL ARCHIMEDES; et al. Lack of relationship between genotype and virulence in Candida species. REVISTA IBEROAMERICANA DE MICOLOGIA, v. 38, n. 1, p. 9-11, JAN-MAR 2021. (17/02203-7)

GUINEA, JESUS; ARENDRUP, MAIKEN C.; CANTON, RAFAEL; CANTON, EMILIA; GARCIA-RODRIGUEZ, JULIO; GOMEZ, ANA; DE LA PEDROSA, ELIA GOMEZ G.; HARE, RASMUS K.; ORDEN, BEATRIZ; SANGUINETTI, MAURIZIO; et al. Genotyping Reveals High Clonal Diversity and Widespread Genotypes of Candida Causing Candidemia at Distant Geographical Areas. FRONTIERS IN CELLULAR AND INFECTION MICROBIOLOGY, v. 10, MAY 5 2020. (17/02203-7)

AGNELLI, CAROLINE; VALERIO, MARICELA; BOUZA, EMILIO; GUINEA, JESUS; SUKIENNIK, TERESA; GUIMARAES, THAIS; QUEIROZ-TELLES, FLAVIO; MUNOZ, PATRICIA; COLOMBO, ARNALDO LOPES. Prognostic factors of Candida spp. bloodstream infection in adults: A nine-year retrospective cohort study across tertiary hospitals in Brazil and Spain. LANCET REGIONAL HEALTH-AMERICAS, v. 6, p. 9-pg., 2022-02-01. (17/02203-7)

ROSENBERG, ALEXANDER; ENE, V, IULIANA; BIBI, MAAYAN; ZAKIN, SHIRI; SEGAL, ELLA SHTIFMAN; ZIV, NAOMI; DAHAN, ALON M.; COLOMBO, ARNALDO LOPES; BENNETT, RICHARD J.; BERMAN, JUDITH. Antifungal tolerance is a subpopulation effect distinct from resistance and is associated with persistent candidemia. NATURE COMMUNICATIONS, v. 9, JUN 25 2018. (17/02203-7)

FRANCISCO, ELAINE CRISTINA; DE JONG, AUKE WIEBREN; COLOMBO, ARNALDO LOPES. Candida haemulonii Species Complex: A Mini-review. Mycopathologia, v. N/A, p. 9-pg., 2023-06-30. (17/02203-7, 19/24960-0)

REMONDI SOUZA, ANA CAROLINA; FUCHS, BETH BURGWYN; ALVES, VIVIANE DE SOUZA; JAYAMANI, ELAMPARITHI; COLOMBO, ARNALDO LOPES; MYLONAKIS, ELEFTHERIOS. Pathogenesis of the Candida parapsilosis Complex in the Model Host Caenorhabditis elegans. GENES, v. 9, n. 8, AUG 2018. (17/02203-7, 12/04769-4, 13/07405-6)

DE JONG, AUKE W.; FRANCISCO, ELAINE C.; DE ALMEIDA, JR., JOAO NOBREGA; BRANDAO, IGOR B.; PEREIRA, FELICIDADE M.; DIAS, PEDRO H. PRESTA; DE MIRANDA COSTA, MAGDA M.; DE SOUZA JORDAO, REGIANE T.; VU, DUONG; COLOMBO, ARNALDO L.; et al. Nanopore Genome Sequencing and Variant Analysis of the Susceptible Candida auris Strain L1537/2020, Salvador, Brazil. Mycopathologia, v. 186, n. 6, OCT 2021. (17/02203-7)

DANESHNIA, FARNAZ; HILMIOGLU POLAT, SULEYHA; ILKIT, MACIT; SHOR, ERIKA; DE ALMEIDA, JOAO NOBREGA; FAVARELLO, LARISSA M.; COLOMBO, ARNALDO LOPES; ARASTEHFAR, AMIR; PERLIN, DAVID S.. Determinants of fluconazole resistance and the efficacy of fluconazole and milbemycin oxim combination against Candida parapsilosis clinical isolates from Brazil and Turkey. FRONTIERS IN FUNGAL BIOLOGY, v. 3, p. 9-pg., 2022-07-28. (17/02203-7)

AGNELLI, CAROLINE; GUIMARAES, THAIS; SUKIENNIK, TERESA; LIMA, PAULO ROBERTO PASSOS; SALLES, MAURO JOSE; BREDA, GIOVANNI LUIS; QUEIROZ-TELLES, FLAVIO; MAGRI, MARCELLO MIHAILENKO CHAVES; MENDES, ANA VERENA; CAMARGO, LUIS FERNANDO ARANHA; et al. Prognostic Trends and Current Challenges in Candidemia: A Comparative Analysis of Two Multicenter Cohorts within the Past Decade. JOURNAL OF FUNGI, v. 9, n. 4, p. 11-pg., 2023-04-01. (17/02203-7)