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Ecologia molecular e taxonomia polifásica de bactérias de importância ambiental e agroindustrial

Processo: 98/05068-0
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Programa BIOTA - Temático
Vigência: 01 de outubro de 1999 - 31 de março de 2004
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
Pesquisador responsável:Gilson Paulo Manfio
Beneficiário:Gilson Paulo Manfio
Instituição-sede: Centro Pluridisciplinar de Pesquisas Químicas, Biológicas e Agrícolas (CPQBA). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Paulínia , SP, Brasil
Pesquisadores principais:Laura Maria Mariscal Ottoboni ; Maria Ines Zanoli Sato ; Vanderlei Perez Canhos
Bolsa(s) vinculada(s):01/09990-6 - Análise de linhagens de Acidithiobacillus thiooxidans isoladas de ambientes antrópicos através de RFLP e sequenciamento de RDNA 16s, BP.IC
01/02057-2 - Caracterização molecular de linhagens de Acidithiobacillus thiooxidans isoladas de ambientes antrópicos, BP.MS
01/03850-8 - Molecular diversity of thiobacilli from antropic environments, BP.TT
+ mais bolsas vinculadas 00/11900-2 - Degradação anaeróbica de pentaclorofenol em sedimentos estuarinos: resposta metabólica de metanoarqueas e bactérias redutoras do íon sulfato, BP.DR
00/11180-0 - Molecular ecology and polyphasic taxonomy of bacteria of environmental and agroindustrial importance, BP.TT
00/08653-3 - Bactérias acido-termorresistentes envolvidas no processamento de sucos de laranja, BP.MS
00/08323-3 - Contribuição à exploração tecnológica dos estudos microbianos realizados no Programa BIOTA-FAPESP: avaliação do potencial da degradação anaeróbia de pentaclorofenol (PCP) em reator anaeróbio horizontal de leito fixo (RAHLF) inoculado com sedimentos do Estuário de Baixada Santista (estado de São Paulo), BP.DR
00/07811-4 - Diversidade de genes catabólicos de microrganismos degradadores de xenobióticos na Baixada Santista, SP, BP.DR
00/05402-0 - Caracterização molecular de bactérias fixadoras de nitrogênio associados a gramíneas de importância econômica, BP.MS
00/03657-0 - Distribuição e biodiversidade de consórcios biodegradadores de compostos xenobióticos na Baixada Santista, BP.MS
00/03470-8 - Caracterização polifásica da biodiversidade de isolados degradadores de poluentes xenobióticos na Baixada Santista, BP.MS
00/08408-9 - Nitrogen fixing endophytic (Nfeb) and humus associated (Nfhb) bacteria: characterization and biotechnological applications, BP.TT
00/06826-8 - Molecular ecology and poliphasic taxonomy of environmental and agroindustrial importance, BP.TT
00/04462-9 - Polyphasic taxonomy and preservation of microorganisms of environmental and agro-industrial importance, BP.TT
99/10739-4 - Ecologia molecular de bactérias associadas a sedimentos sob impacto de compostos xenobióticos organoclorados em rios da Baixada Santista, SP, BP.DR
99/12985-2 - Molecular ecology and poliphasic taxonomy of bacteria of environmental and agroindustrial importance, BP.TT
99/11417-0 - Caracterização molecular de Xanthomonas spp. fitopatogênicas isoladas de diferentes hospedeiros e regiões geográficas do Estado de São Paulo, BP.PD - menos bolsas vinculadas
Assunto(s):Microbiologia ambiental  Zoologia (classificação)  Ecologia molecular  Diversidade microbiana  Bactérias  Bioprospecção 

Resumo

Alguns grupos de pesquisas no estado de São Paulo vêm desenvolvendo estudos de microbiologia aplicada voltada para a caracterização taxonômica e exploração tecnológica da diversidade microbiana, incluindo a aplicação de bactérias em biorremediação ambiental de áreas poluídas e biodigestão de compostos recalcitrantes em efluentes industriais, fixação biológica de nitrogênio e reciclagem de nutrientes, estudo sistemático de fitopatógenos de importância agrícola e de bactérias ambientais contaminantes de importantes processos de produção industrial. A caracterização taxonômica polifásica dos microrganismos, envolvendo a caracterização molecular, quimiotaxonômica e fenotípica, é fundamental para a identificação dos principais componentes da microbiota envolvidos nestes processos, e estudo da diversidade biológica (fenotípica e genômica) e funcional dos mesmos. O depósito dos microrganismos isolados em coleções de culturas (preservação ex-situ), quando possível, possibilitará a realização de estudos complementares visando, entre outros objetivos, o seu emprego em aplicações biotecnológicas. A presente proposta, dentro do escopo do Programa BiotaSP (Anexo I), visa a estruturação de uma rede temática voltada para o desenvolvimento de metodologias rápidas de caracterização e de sistemática molecular microbiana, destacando-se: sequenciamento de rDNA 16S, para análise filogenética e enquadramento taxonômico de organismos desconhecidos em gêneros e espécies e identificação rápida de organismos de difícil caracterização ou cultivo, homologia DNA-DNA, para verificação da identidade entre organismos em nível de espécie, avaliação de grupos taxonômicos heterogêneos de organismos e definição de novas espécies; quimiotaxonomia; metodologias de tipagem molecular diversas, incluindo RAPD, RFLP de rDNA 16S e regiões espaçadoras, REP-, ERIC- e BOX-PCR, DGGE, e PAGE, direcionadas à avaliação da diversidade de organismos em nível de gênero, espécie e infra-específico; e metodologias de detecção rápida e análise funcional de microrganismos: sondas moleculares grupo-específicas (incluindo sondas para análise de diversidade in situ) e sondas para genes funcionais (e.g., genes de fixação de nitrogênio, vias de biodegradação, genes de patogenicidade). Como objetivos a longo prazo e produtos da cooperação de pesquisa proposta, objetiva-se: estruturação de uma rede cooperativa de laboratórios e especialistas em microbiologia sistemática e taxonomia polifásica de bactérias, voltada principalmente à caracterização e identificação de microrganismos de importância ambiental, agrícola e industrial; estruturação de acervos de microrganismos representativos da diversidade microbiana associada aos diversos temas de pesquisa em coleções de culturas existentes no estado de São Paulo com bases de dados associadas disponibilizando via Internet as informações de cunho científico-tecnológico à comunidade; estruturação de cursos de treinamento de curta e média duração, incluindo cursos de pós-graduação, destinados à formação de pessoal em nível técnico e/ou universitário nos aspectos de aplicação de metodologias avançadas para caracterização e identificação de microrganismos, sistemática microbiana, ecologia de microrganismos e exploração tecnológica da diversidade microbiana; publicação e disponibilização on-line (através da Internet) de protocolos de aplicação de métodos taxonômicos na caracterização e identificação de bactérias e outros microrganismos voltados à aplicação em diversas áreas de microbiologia, incluindo microbiologia ambiental, microrganismos de importância agrícola e industrial, e potencialmente a aplicações futuras em epidemiologia e microbiologia clínica; realização e publicação de resultados de trabalhos científicos nas áreas específicas de atuação dos participantes do projeto, enfocando o aspecto de aplicação prática dos conhecimentos gerados na exploração tecnológica da diversidade microbiana brasileira. (AU)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
SAIA, FLAVIA; DOMINGUES, MERCIA; PELLIZARI, VIVIAN; VAZOLLER, ROSANA. Occurrence of Methanogenic Archaea in Highly Polluted Sediments of Tropical Santos-So Vicente Estuary (So Paulo, Brazil). Current Microbiology, v. 60, n. 1, p. 66-70, JAN 2010. Citações Web of Science: 5.

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