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Análise da variabilidade e estrutura haplotípica dos genes KIR2DL4, KIR3DL2, KIR3DL3, LILRB1(ILT2) e LILRB2 (ILT4) em uma amostra brasileira do estado de São Paulo

Processo: 17/19223-0
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Regular
Vigência: 01 de fevereiro de 2018 - 31 de janeiro de 2020
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
Pesquisador responsável:Erick da Cruz Castelli
Beneficiário:Erick da Cruz Castelli
Instituição Sede: Faculdade de Medicina (FMB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
Pesquisadores associados:Celso Teixeira Mendes Junior ; Eduardo Antônio Donadi
Assunto(s):Sequenciamento de nova geração  Imunogenética  Polimorfismo genético  Receptores KIR  Haplotipos  Antígenos HLA 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Haplótipos | Hla | Polimorfismos | Receptores KIR | Receptores LILR | sequenciamento de nova geração | Imunogenética

Resumo

O Complexo de Receptores Leucocitários (LRC), localizado em uma fração de aproximadamente 1Mb do cromossomo 19, é composto por genes que em sua maioria codificam moléculas da superfamília das Imunoglobulinas (Ig). Dentre esses genes, destacam-se a família de Receptores "Killer" semelhantes a Imunoglobulinas (KIR), expressos em células Natural Killer (NK) e linfócitos T citotóxicos, e os Receptores semelhantes a Imunoglobulinas de Leucócitos (LILRs), expressos tanto em células de origem mielóide como linfóide. Os principais ligantes desses receptores são as moléculas HLA de classe I, componentes do Complexo Principal de Histocompatibilidade (MHC), codificadas pelos genes mais variáveis do genoma humano. Juntos, esses complexos receptor-ligante são responsáveis por controlar e modular as respostas imunes. A variabilidade inerente aos genes KIR2DL4, KIR3DL2, KIR3DL3, LILRB1(ILT2) e LILRB2 (ILT4) é pouco explorada, embora alguns desses genes tenham se mostrado bastante polimórficos em estudos prévios que avaliaram apenas alguns éxons desses genes. Não há estudos descrevendo a variabilidade desses genes no Brasil, que possui uma população altamente heterogênea e miscigenada e se mostrou um grande repositório de variabilidade genética em estudos anteriores que caracterizam os genes do MHC de classe I. Ainda, não há uma metodologia estabelecida para se explorar a variabilidade completa desses genes. Assim, o objetivo desse estudo é elaborar uma estratégia de avaliação dos genes KIR2DL4, KIR3DL2, KIR3DL3, LILRB1(ILT2) E LILRB2 (ILT4) utilizando sequenciamento de nova geração e explorar a variabilidade genética e haplotípica desses genes em uma amostra brasileira, correlacionando os dados encontrados com a variabilidade existente nos genes do complexo HLA avaliados previamente nessas mesmas amostras. (AU)

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Publicações científicas (12)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
SOUZA, ANDREIA S.; SONON, PAULIN; PAZ, MICHELLE A.; TOKPLONOU, LEONIDAS; LIMA, THALITTA H. A.; PORTO, IANE O. P.; ANDRADE, HELOISA S.; SILVA, NAYANE DOS S. B.; VEIGA-CASTELLI, LUCIANA C.; OLIVEIRA, MARIA LUIZA G.; et al. Hla-Cgenetic diversity and evolutionary insights in two samples from Brazil and Benin. HLA, . (17/19223-0, 13/17084-2)
CASTELLI, ERICK C.; DE CASTRO, V, MATEUS; NASLAVSKY, MICHEL S.; SCLIAR, MARILIA O.; SILVA, NAYANE S. B.; ANDRADE, HELOISA S.; SOUZA, ANDREIA S.; PEREIRA, RAPHAELA N.; CASTRO, CAMILA F. B.; MENDES-JUNIOR, CELSO T.; et al. MHC Variants Associated With Symptomatic Versus Asymptomatic SARS-CoV-2 Infection in Highly Exposed Individuals. FRONTIERS IN IMMUNOLOGY, v. 12, . (13/08028-1, 19/19998-8, 20/09702-1, 17/19223-0, 14/50931-3)
CASTELLI, ERICK C.; DE ALMEIDA, BIBIANA S.; MUNIZ, YARA C. N.; SILVA, NAYANE S. B.; PASSOS, MARILIA R. S.; SOUZA, ANDREIA S.; PAGE, ABIGAIL E.; DYBLE, MARK; SMITH, DANIEL; AGUILETA, GABRIELA; et al. HLA-G genetic diversity and evolutive aspects in worldwide populations. SCIENTIFIC REPORTS, v. 11, n. 1, . (17/19223-0)
DE CASTRO, MATEUS, V; SILVA, MONIZE V. R.; NASLAVSKY, MICHEL S.; SCLIAR, MARILIA O.; NUNES, KELLY; PASSOS-BUENO, MARIA RITA; CASTELLI, ERICK C.; MAGAWA, JHOSIENE Y.; ADAMI, FLAVIA L.; MORETTI, ANA I. S.; et al. The oldest unvaccinated Covid-19 survivors in South America. IMMUNITY & AGEING, v. 19, n. 1, p. 9-pg., . (14/50890-5, 17/19223-0, 14/50931-3, 13/08028-1)
NASLAVSKY, MICHEL S.; SCLIAR, MARILIA O.; YAMAMOTO, GUILHERME L.; WANG, JAQUELINE YU TING; ZVERINOVA, STEPANKA; KARP, TATIANA; NUNES, KELLY; MAGLIOCCO CERONI, JOSE RICARDO; DE CARVALHO, DIEGO LIMA; DA SILVA SIMOES, CARLOS EDUARDO; et al. Whole-genome sequencing of 1,171 elderly admixed individuals from Sao Paulo, Brazil. NATURE COMMUNICATIONS, v. 13, n. 1, p. 11-pg., . (12/24731-1, 20/02413-4, 14/50649-6, 13/08028-1, 18/15579-8, 15/25020-0, 17/19223-0, 13/17084-2)
WEISS, EMILIANA; ANDRADE, HELOISA S.; LARA, JULIANA RODRIGUES; SOUZA, ANDREIA S.; PAZ, MICHELLE A.; LIMA, THALITTA H. A.; PORTO, IANE O. P.; S. B. SILVA, NAYANE; CASTRO, CAMILA F. BANNWART; GROTTO, REJANE M. T.; et al. KIR2DL4 genetic diversity in a Brazilian population sample: implications for transcription regulation and protein diversity in samples with different ancestry backgrounds. IMMUNOGENETICS, v. 73, n. 3, . (17/19223-0, 17/05042-4)
CASTELLI, ERICK C.; DE CASTRO, MATEUS V.; NASLAVSKY, MICHEL S.; SCLIAR, MARILIA O.; SILVA, NAYANE S. B.; PEREIRA, RAPHAELA N.; CIRIACO, VIVIANE A. O.; CASTRO, CAMILA F. B.; MENDES-JUNIOR, CELSO T.; SILVEIRA, ETIELE DE S.; et al. MUC22, HLA-A, and HLA-DOB variants and COVID-19 in resilient super-agers from Brazil. FRONTIERS IN IMMUNOLOGY, v. 13, p. 15-pg., . (14/50931-3, 20/09702-1, 17/19223-0, 19/19998-8, 13/08028-1)
TELLES CARRATTO, THASSIA MAYRA; MARCORIN, LETICIA; DEBORTOLI, GUILHERME; HUNEMEIER, TABITA; NORTON, HEATHER; PARRA, ESTEBAN JUAN; CASTELLI, ERICK C.; MENDES-JUNIOR, CELSO TEIXEIRA. Insights on hair, skin and eye color of ancient and contemporary Native Americans. FORENSIC SCIENCE INTERNATIONAL-GENETICS, v. 48, p. 9-pg., . (17/19223-0, 13/15447-0)
GUIMARAES DE OLIVEIRA, MARIA LUIZA; CASTELLI, ERICK C.; VEIGA-CASTELLI, LUCIANA C.; PEREIRA, ALISON E.; MARCORIN, LETICIA; CARRATTO, THASSIA M. T.; SOUZA, ANDREIA S.; ANDRADE, HELOISA S.; SIMOES, AGUINALDO L.; DONADI, EDUARDO A.; et al. Genetic diversity of the LILRB1 and LILRB2 coding regions in an admixed Brazilian population sample. HLA, v. 100, n. 4, p. 24-pg., . (13/15447-0, 17/19223-0)
SOUZA, ANDREIA S.; SONON, PAULIN; PAZ, MICHELLE A.; TOKPLONOU, LEONIDAS; LIMA, THALITTA H. A.; PORTO, IANE O. P.; ANDRADE, HELOISA S.; SILVA, NAYANE DOS S. B.; VEIGA-CASTELLI, LUCIANA C.; OLIVEIRA, MARIA LUIZA G.; et al. Hla-C genetic diversity and evolutionary insights in two samples from Brazil and Benin. HLA, v. 96, n. 4, p. 19-pg., . (17/19223-0, 13/17084-2)
SILVA, NAYANE DOS SANTOS BRITO; SOUZA, ANDREIA DA SILVA; ANDRADE, HELOISA DE SOUZA; PEREIRA, RAPHAELA NETO; CASTRO, CAMILA FERREIRA BANNWART; VINCE, NICOLAS; LIMOU, SOPHIE; NASLAVSKY, MICHEL SATYA; ZATZ, MAYANA; DUARTE, YEDA APARECIDA DE OLIVEIRA; et al. Immunogenetics of HLA-B: SNP, allele, and haplotype diversity in populations from different continents and ancestry backgrounds. HLA, v. 101, n. 6, p. 13-pg., . (17/19223-0, 13/17084-2, 21/02815-8)
CASTELLI, E. C.; OLIVEIRA, M. G.; VEIGA-CASTELLI, L. C.; SOUZA, A. S.; LIMA, T. H. A.; ANDRADE, H. S.; WEISS, E.; PASSOS, M. R. S.; MARCORIN, L.; DEBORTOLI, G.; et al. A deep characterization of the LILRB2/ILT4 genetic variability in Brazilian samples with different ancestry compositions. European Journal of Human Genetics, v. 27, p. 1-pg., . (17/19223-0)

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