Auxílio à pesquisa 18/00546-7 - Haplotipos, Pecuária de corte - BV FAPESP
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Associação genômica para precocidade sexual em novilhas de corte usando pré-seleção de genes e reconstrução de haplótipos

Processo: 18/00546-7
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Publicações científicas - Artigo
Data de Início da vigência: 01 de março de 2018
Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2018
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
Pesquisador responsável:Gerardo Alves Fernandes Júnior
Beneficiário:Gerardo Alves Fernandes Júnior
Instituição Sede: Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil
Assunto(s):Haplotipos  Pecuária de corte 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:associação genômica | Beef cattle | Haplótipos | Estudo de associação genômica

Resumo

As características reprodutivas são de suma importância em qualquer exploração pecuária, porém são difíceis de serem mensuradas e interpretadas, já que são influenciadas por vários fatores. Este trabalho teve como objetivo detectar associações entre polimorfismos conhecidos em genes candidatos, relacionados a precocidade sexual em novilhas da raça Nelore visando sua utilização em programas de melhoramento. Foram analisadas medidas de 1.689 novilhas precoces e não precoces provenientes de fazendas participantes do programa de melhoramento genética da Conexão Delta G. Do painel de 777.000 SNPs do High DensityBovine SNP BeadChip, foram selecionados SNPs localizados na região dos genes candidatos, com uma distância de até 5 Kb dos limites de cada um deles. Modelos lineares mistos foram utilizados para análise estatística da característica prenhez precoce de novilha, relacionando-a isoladamente com os marcadores SNPs isolados ou na forma de grupos de haplótipos. O modelo de análise inclui como efeito fixo o grupo de contemporâneo (ano e mês de nascimento) e como aleatório o pai do animal (efeito touro). Os programas fastPHASE® e GenomeStudio® foram utilizados para a reconstrução dos haplótipos e análise do LD a partir da estatística r². Foram analisados 125 genes candidatos e um total de 2.024 SNPs, formadores de haplótipos. As análises estatísticas revelaram, após correção de Bonferroni, que 9 haplótipos tiveram efeito significativo (p<0,05), para a precocidade sexual, sendo que destes 4 haplótipos estavam localizados no gene PAPP-A2, 2 haplótipos no gene ESRRG e 1 haplótipo nos genes PAPP-A, XKR4 e MBL-1. Apesar dos resultados do presente estudo indicarem que os genes PAPP-A2, PAPP-A, XKR4, MBL-1 e ESRRG influenciam a precocidade sexual de novilhas da raça Nelore, mais estudos são necessários para avaliar a possibilidade de sua utilização em programas de melhoramento. (AU)

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