Análise genômica de clones de alto risco de Acinetobacter baumannii provenientes de diferentes hospitais brasileiros

• Processo: 17/16988-6
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Vigência: 01 de março de 2018 - 29 de fevereiro de 2020
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
• Pesquisador responsável: Carlos Henrique Camargo
• Beneficiário: Carlos Henrique Camargo
• Instituição Sede: Instituto Adolfo Lutz (IAL). Coordenadoria de Controle de Doenças (CCD). Secretaria da Saúde (São Paulo - Estado). São Paulo , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Enéas de Carvalho ; Erica Chimara Silva ; Monique Ribeiro Tiba Casas
• Assunto(s): Sequenciamento de nova geração Epidemiologia molecular Resistência microbiana a medicamentos
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Epidemiologia Molecular | mobiloma | plasmidoma | resistencia antimicrobiana | resistoma | sequenciamento de nova geração | Epidemiologia da resistência antimicrobiana

Resumo

A apocalíptica era pós-antimicrobianos já é uma realidade. Patógenos pan-resistentes que demandam o uso de terapia combinada já circulam nos hospitais brasileiros, e em proporções crescentes no mundo todo. Num esforço global para enfrentar a problemática da resistência antimicrobiana, a Organização das Nações Unidas elaborou o plano global de redução da resistência antimicrobiana elencando certos patógenos prevalentes, entre eles, Acinetobacter com resistência aos carbapenêmicos (CRAB). Acinetobacter destaca-se entre os causadores de infecções relacionadas à assistência à saúde por sua resiliência e plasticidade em adquirir novos mecanismos de resistência, impactando negativamente nas taxas de morbidade e mortalidade. A epidemiologia molecular de CRAB no Brasil indica predomínio de certas linhagens clonais (Complexos Clonais CC1, 15, 25 e 79), denominadas de clones de alto risco. Os motivos destes clones serem bem-sucedidos no país ainda não são conhecidos, mas indícios desta microevolução podem estar presentes no genoma destas cepas. Por meio do uso de técnicas robustas e análises aprofundadas, que permitem caracterizar o genoma no nível mais discriminatório conhecido na atualidade, este estudo tem por objetivo identificar marcadores genéticos que expliquem os motivos que levaram ao sucesso da disseminação dos clones de alto-risco de CRAB no Brasil. O sequenciamento baseado em tecnologia de Next-Generation Sequencing (Illumina) permitirá caracterizar todo o resistoma, plasmidoma e mobiloma de 96 isolados de Acinetobacter provenientes de 30 diferentes instituições de saúde, além de elucidar aspectos evolutivos e adaptativos relacionadas ao sucesso dos clones de alto risco circulantes no Brasil. Correlações entre testes de sensibilidade fenotípico e os resultados de NGS serão estabelecidas e a tecnologia de MALDI-TOF será utilizada na tentativa de prover resultados rápidos para identificação dos clones de alto-risco. (AU)

Publicações científicas

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(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

BRISOLLA TAVARES, LAIS CALISSI; VIEIRA CUNHA, MARCOS PAULO; DE VASCONCELLOS, FRANCIELLI MAHNIC; DE JESUS BERTANI, AMANDA MARIA; FRANCO DE BARCELLOS, THAYS ALMEIDA; BUENO, MARIANA SARDINHA; SANTOS, CARLA ADRIANA; SANT'ANA, DANIEL ALMEIDA; FERREIRA, ADRIANO MARTISON; MONDELLI, ALESSANDRO LIA; et al. Genomic and Clinical Characterization of IMP-1-Producing Multidrug-Resistant Acinetobacter bereziniae Isolates from Bloodstream Infections in a Brazilian Tertiary Hospital. MICROBIAL DRUG RESISTANCE, v. 26, n. 11, MAR 2020. (16/20727-0, 15/13179-4, 17/16988-6)

DE BARCELLOS, THAYS ALMEIDA FRANCO; BUENO, MARIANA SARDINHA; CUNHA, MARCOS PAULO VIEIRA; NAGAMORI, FILIPE ONISHI; DE CARVALHO, ENEAS; TAKAGI, ELIZABETH HARUMMYY; MORENO, LUISA ZANOLLI; MORENO, ANDREA MICKE; CHIMARA, ERICA; TIBA-CASAS, MONIQUE RIBEIRO; et al. Silent mutations in ribosomal protein genes are associated with high-risk clones of carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii prevalent in Brazil. INFECTION GENETICS AND EVOLUTION, v. 88, MAR 2021. (17/16988-6)

CAMARGO, CARLOS HENRIQUE; YAMADA, AMANDA YAEKO; NAGAMORI, FILIPE ONISHI; DE SOUZA, ANDREIA RODRIGUES; TIBA-CASAS, MONIQUE RIBEIRO; DE MORAES FRANCA, FLAVIA APARECIDA; TRIGUEIRO NOBREGA PORTO, MARIA HELENA; DE LIMA GARZON, MAGDA LOURDES; HIGGINS, PAUL; MADALOSSO, GERALDINE; et al. Clonal spread of ArmA- and OXA-23-coproducing Acinetobacter baumannii International Clone 2 in Brazil during the first wave of the COVID-19 pandemic. Journal of Medical Microbiology, v. 71, n. 4, p. 6-pg., 2022-01-01. (17/16988-6, 20/06157-2, 17/50333-7, 18/21192-9, 18/21193-5)

BUENO, MARIANA SARDINHA; FREIRE, MARISTELA PINHEIRO; VIEIRA CUNHA, MARCOS PAULO; FRANCO DE BARCELLOS, THAYS ALMEIDA; DE JESUS BERTANI, AMANDA MARIA; DOS SANTOS, CARLA ADRIANA; CHIMARA, ERICA; NAGAMORI, FILIPE ONISHI; TAKAGI, ELIZABETH HARUMMYY; COSTA, SILVIA FIGUEIREDO; et al. Detection of pandrug-resistant ST15 Acinetobacter baumannii causing bloodstream infection in an HSCT patient in Brazil. Journal of Antimicrobial Chemotherapy, v. 75, n. 9, p. 4-pg., 2020-09-01. (17/16988-6)