Estrutura e diversidade de comunidades de microrganismos em solos sob diferentes sistemas de uso da terra na Amazônia ocidental

• Processo: 07/01868-3
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2007
• Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2009
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia - Ciência do Solo
• Pesquisador responsável: Tsai Siu Mui
• Beneficiário: Acacio Aparecido Navarrete
• Instituição Sede: Centro de Energia Nuclear na Agricultura (CENA). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Assunto(s): Ecologia dos micro-organismos Atividade microbiana Bactérias Fungos Archaea Eletroforese em gel de gradiente desnaturante Amazônia Ocidental
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Amazônia Ocidental | Archaea | Arisa | bacteria | Dgge | Fungi | Ecologia Molecular Microbiana

Resumo

As estruturas e a diversidade de comunidades microbianas no solo são influenciadas por alterações e perturbações ambientais prevalentes nesse meio. A maior parte das alterações nos ecossistemas de terra firme da Amazônia tem por finalidade a implantação de atividades agrícolas, florestais ou pastoris. Os Domínios Bacteria, Fungi e Archaea desempenham papel central em processos biogeoquímicos relacionados à manutenção da capacidade produtiva dos solos. O presente projeto tem como objetivo avaliar as estruturas de comunidades de bactérias, fungos e Archaea por meio de eletroforese em gel de poliacrilamida com gradiente desnaturante (DGGE) e análise automatizada do espaço intergênico ribossomal (ARISA), bem como a diversidade destes domínios por sequenciamento parcial dos genes 16S rRNA e 18S rRNA e dos espaços intergênicos ribossomais 16S-23S rRNA e 18S-28S rRNA nos sistemas de uso da terra denominados Floresta, Pastagem e Agricultura inseridos nas áreas amostrais do projeto BiosBrasil (Conservation and Sustainable Management of Below-Ground Biodiversity: Phase I), do qual o Laboratório de Biologia Celular e Molecular do CENA/USP participa. A área de estudo situa-se no município de Benjamin Constant, região do Alto Solimões, Estado do Amazonas. Com as ferramentas moleculares espera-se obter informações sobre as alterações das populações microbianas dos solos sob floresta primária tropical da Amazônia em decorrência do efeito antropogênico de desmatamento e uso da terra com pastagem e agricultura. A similaridade das estruturas de comunidades microbianas nos diferentes sistemas de uso da terra analisados será determinada com base na presença de amplicons detectados após DGGE e na variedade de picos correspondentes a fragmentos de DNA detectados em ARISA, usando o programa Systat 8.0 e análise de componentes principais (PCA), respectivamente. A riqueza de filotipos será estimada utilizando os métodos não-paramétricos ACE e Chao1 e os índices de diversidade de Shannon e Recíproco de Simpson serão determinados utilizando o programa SPADE. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

NAVARRETE, ACACIO APARECIDO; TAKETANI, RODRIGO GOUVEA; MENDES, LUCAS WILLIAM; CANNAVAN, FABIANA DE SOUZA; DE SOUZA MOREIRA, FATIMA MARIA; TSAI, SIU MUI. LAND-USE SYSTEMS AFFECT ARCHAEAL COMMUNITY STRUCTURE AND FUNCTIONAL DIVERSITY IN WESTERN AMAZON SOILS. Revista Brasileira de Ciência do Solo, v. 35, n. 5, p. 1527-1540, SEP-OCT 2011. (07/01868-3, 08/58114-3)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

NAVARRETE, Acacio Aparecido. Estrutura e diversidade de comunidades microbianas em solos sob diferentes sistemas de uso da terra na Amazônia Ocidental. 2009. Dissertação de Mestrado - Universidade de São Paulo (USP). Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALA/BC) Piracicaba.