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Identificação in silico de potenciais sítios regulatórios em regiões não-traduzidas nos genomas de Leishmania spp

Processo: 06/01650-5
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Mestrado
Vigência (Início): 01 de setembro de 2006
Vigência (Término): 31 de agosto de 2008
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
Pesquisador responsável:Angela Kaysel Cruz
Beneficiário:Elton José Rosas de Vasconcelos
Instituição-sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Assunto(s):Biologia computacional

Resumo

Os protozoários Leishmania spp. são organismos unicelulares, pertencentes à ordem Kinetoplastida e à família Trypanosomatidae. São os agentes causadores de uma ampla gama de manifestações patológicas conhecidas como leishmanioses as quais variam desde lesões cutâneas auto-cicatrizantes a distúrbios viscerais que podem levar a morte. Com relação à pesquisa genômica de tripanossomatídeos, os avanços recentes têm revelado a importância da coordenação e análise da vasta informação acumulada com vistas à biologia dos organismos estudados. Particularmente com referência a Leishmania spp., estudos comparativos entre diferentes espécies, centrados na identificação in silico com posterior validação experimental dos padrões de conservação associados às regiões intergênicas (5’- e 3’-UTRs), podem ser as chaves computacionais para um entendimento biológico mais completo dos mecanismos de controle transcricional desses parasitas, que ainda permanecem não completamente elucidados. No presente projeto de mestrado, utilizaremos como modelo experimental in silico os genomas anotados de Leishmania braziliensis (versão 2.0), L. infantum (versão 2.0) e L. major (versão 5.2), disponibilizados pelo The Wellcome Trust Sanger Institute (http://www.sanger.ac.uk). O projeto estará inicialmente centrado na identificação e caracterização in silico de potenciais seqüências conservadas localizadas nas regiões não-traduzidas dos genomas das três espécies e posteriormente na validação experimental de alguns alvos identificados.