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Simulação computacional em bioquímica: estrutura eletrônica de agregados polinucleares em metaloenzimas e ligação de inibidores a proteínas tirosina-fosfatases

Processo: 07/59345-6
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Apoio a Jovens Pesquisadores
Vigência (Início): 01 de janeiro de 2008
Vigência (Término): 14 de junho de 2010
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica
Pesquisador responsável:Guilherme Menegon Arantes
Beneficiário:Guilherme Menegon Arantes
Instituição-sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:07/52772-6 - Simulação computacional em bioquímica: estrutura eletrônica de agregados polinucleares em metaloenzimas e ligação de inibidores a proteínas tirosina-fosfatases, AP.JP
Assunto(s):Monoester fosfórico hidrolases   Inibidores   Simulação por computador

Resumo

Simulação computacional em bioquímica é uma área de pesquisa incipiente no Brasil e, em particular, no Estado de São Paulo. Este projeto visa ampliar o enfoque nesta área desenvolvendo novos métodos e aplicando metodologias consolidadas num problema relevante. Propomos a implementação de um novo método baseado em função de onda multiconfiguracional que permitirá cálculos de estrutura eletrônica de compostos com muitos elétrons desemparelhados, como, por exemplo, agregados de ferro-enxofre encontrados como grupos prostéticos em metaloenzimas. Atualmente não existe um método geral e confiável para tratar estes sistemas, portanto, o novo método permitirá a exploração de temas inéditos em bioquímica inorgânica. Ao mesmo tempo, propomos estudar os mecanismos de ligação de inibidores a' Proteínas Tirosina-Fosfatases. Estas são enzimas chaves na sinalização e regulação de processos celulares e alvos potenciais para o tratamento de doenças como câncer e diabetes. Utilizaremos métodos computacionais de perturbação estatística para estimar a energia livre de ligação de moléculas pequenas às Proteínas Tirosina-Fosfatases com objetivo de otimizar racionalmente a potência e a seletividade dos inibidores conhecidos e sugerir novos compostos líderes para o desenvolvimento de fármacos. (AU)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
ARANTES, GUILHERME MENEGON. Flexibility and inhibitor binding in Cdc25 phosphatases. PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS, v. 78, n. 14, p. 3017-3032, NOV 1 2010. Citações Web of Science: 10.
ARANTES, GUILHERME MENEGON; TAYLOR, PETER R. Approximate Multiconfigurational Treatment of Spin-Coupled Metal Complexes. JOURNAL OF CHEMICAL THEORY AND COMPUTATION, v. 6, n. 7, p. 1981-1989, JUL 2010. Citações Web of Science: 3.
ARANTES, GUILHERME MENEGON. The Catalytic Acid in the Dephosphorylation of the Cdk2-pTpY/CycA Protein Complex by Cdc25B Phosphatase. Journal of Physical Chemistry B, v. 112, n. 47, p. 15244-15247, NOV 27 2008. Citações Web of Science: 11.

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