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Diversidade de arquéias e bactérias envolvidas na ciclagem do nitrogênio em sedimentos de manguezais

Processo: 08/54013-8
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Doutorado
Vigência (Início): 01 de setembro de 2008
Vigência (Término): 31 de outubro de 2012
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
Pesquisador responsável:João Lúcio de Azevedo
Beneficiário:Armando Cavalcante Franco Dias
Instituição-sede: Centro de Energia Nuclear na Agricultura (CENA). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:04/13910-6 - Biodiversidade e atividades funcionais de microrganismos de manguezais do estado de São Paulo, AP.BTA.TEM
Assunto(s):Ecologia microbiana   Biotecnologia   Metagenômica

Resumo

Dentre os ecossistemas terrestres, alguns chamam atenção devido a particular combinação de condições ambientais únicas, que resultam na evolução de espécies capazes de colonizar restritamente estes ambientes. Os manguezais compõem um bioma composto por espécies de plantas, animais e microrganismos, que interagem neste ambiente, que tem como principal característica a interface entre o continente e o oceano em regiões inter-tropicais, conferindo condições únicas ambientais, principalmente em relação à salinidade, à composição por espécies vegetais e alterações sazonais na disponibilidade de nutrientes. Em manguezais, bactérias, arqueias e fungos constituem 91% da biomassa microbiana total, sendo a comunidade microbiana diversa e produtiva neste ambiente, tendo como principal função a ciclagem de nutrientes. No entanto, muito pouco da diversidade de grupos microbianos funcionais dos manguezais é conhecida, principalmente no Brasil, onde este tema é ainda inexplorado. Neste intuito, este projeto tem como objetivo estudar por técnicas moleculares as comunidades de arqueias funcionais nos manguezais do Estado de São Paulo. O enfoque será dado na diversidade do gene que codifica a subunidade amoA, recentemente descrito em arqueias, e que atua na oxidação do amônio, passo inicial da transformação desta molécula em nitrogênio gasoso (N2). A quantificação de arqueias portadoras destes genes será realizada por meio de PCR em tempo real, enquanto que a diversidade destas populações será acessada por meio de análise do perfil das comunidades em DGGE e pela construção de bibliotecas de clones a partir do DNA de amostras ambientais de sedimento e água de três diferentes manguezais. Desta maneira, informações serão levantadas sobre estas comunidades funcionais, com a possibilidade de descrição de novos grupos filogenéticos de arqueias funcionais não encontrados em outros ambientes. (AU)

Publicações científicas (11)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
BRAGHINI SA, ANDRE LUIS; FRANCO DIAS, ARMANDO CAVALCANTE; QUECINE, MARIA CAROLINA; COTTA, SIMONE RAPOSO; FASANELLA, CRISTIANE CIPOLA; ANDREOTE, FERNANDO DINI; DE MELO, ITAMAR SOARES. Screening of endoglucanase-producing bacteria in the saline rhizosphere of Rhizophora mangle. Brazilian Journal of Microbiology, v. 45, n. 1, p. 193-197, 2014. Citações Web of Science: 1.
FRANCO DIAS, ARMANDO CAVALCANTE; DINI-ANDREOTE, FRANCISCO; HANNULA, SILJA EMILIA; ANDREOTE, FERNANDO DINI; PEREIRA E SILVA, MICHELE DE CASSIA; SALLES, JOANA FALCAO; DE BOER, WIETSE; VAN VEEN, JOHANNES; VAN ELSAS, JAN DIRK. Different Selective Effects on Rhizosphere Bacteria Exerted by Genetically Modified versus Conventional Potato Lines. PLoS One, v. 8, n. 7 JUL 3 2013. Citações Web of Science: 20.
COTTA, SIMONE RAPOSO; FRANCO DIAS, ARMANDO CAVALCANTE; MARRIEL, IVANILDO EVODIO; GOMES, ELIANE APARECIDA; VAN ELSAS, JAN DIRK; SELDIN, LUCY. Temporal dynamics of microbial communities in the rhizosphere of two genetically modified (GM) maize hybrids in tropical agrosystems. ANTONIE VAN LEEUWENHOEK INTERNATIONAL JOURNAL OF GENERAL AND MOLECULAR MICROBIOLOGY, v. 103, n. 3, p. 589-601, MAR 2013. Citações Web of Science: 10.
FARIA, DEISE CRISTINA; FRANCO DIAS, ARMANDO CAVALCANTE; MELO, ITAMAR SOARES; DE CARVALHO COSTA, FRANCISCO EDUARDO. Endophytic bacteria isolated from orchid and their potential to promote plant growth. WORLD JOURNAL OF MICROBIOLOGY & BIOTECHNOLOGY, v. 29, n. 2, p. 217-221, FEB 2013. Citações Web of Science: 13.
SOARES JUNIOR, FABIO LINO; FRANCO DIAS, ARMANDO CAVALCANTE; FASANELLA, CRISTIANE CIPOLA; TAKETANI, RODRIGO GOUVAA; DE SOUZA LIMA, ANDRE OLIVEIRA; MELO, ITAMAR SOARES; ANDREOTE, FERNANDO DINI. Endo- and exoglucanase activities in bacteria from mangrove sediment. Brazilian Journal of Microbiology, v. 44, n. 3, p. 969-976, Set. 2013. Citações Web of Science: 8.
FRANCO DIAS, ARMANDO CAVALCANTE; PEREIRA E SILVA, MICHELE DE CASSIA; COTTA, SIMONE RAPOSO; DINI-ANDREOTE, FRANCISCO; SOARES, JR., FABIO LINO; SALLES, JOANA FALCAO; AZEVEDO, JOAO LUCIO; VAN ELSAS, JAN DIRK; ANDREOTE, FERNANDO DINI. Abundance and Genetic Diversity of nifH Gene Sequences in Anthropogenically Affected Brazilian Mangrove Sediments. Applied and Environmental Microbiology, v. 78, n. 22, p. 7960-7967, NOV 2012. Citações Web of Science: 20.
FASANELLA, CRISTIANE CIPOLA; FRANCO DIAS, ARMANDO CAVALCANTE; RIGONATO, JANAINA; FIORE, MARLI DE FATIMA; SOARES, JR., FABIO LINO; MELO, ITAMAR SOARES; PIZZIRANI-KLEINER, ALINE APARECIDA; VAN ELSAS, JAN DIRK; ANDREOTE, FERNANDO DINI. The Selection Exerted by Oil Contamination on Mangrove Fungal Communities. WATER AIR AND SOIL POLLUTION, v. 223, n. 7, p. 4233-4243, SEP 2012. Citações Web of Science: 12.
DIAS, ARMANDO CAVALCANTE FRANCO; HOOGWOUT, EELCO FRANS; PEREIRA E SILVA, MICHELE DE CASSIA; SALLES, JOANA FALCAO; VAN OVERBEEK, LEONARD SIMON; VAN ELSAS, JAN DIRK. Potato cultivar type affects the structure of ammonia oxidizer communities in field soil under potato beyond the rhizosphere. SOIL BIOLOGY & BIOCHEMISTRY, v. 50, p. 85-95, JUL 2012. Citações Web of Science: 18.
ANDREOTE, FERNANDO DINI; JAVIER JIMENEZ, DIEGO; CHAVES, DIEGO; FRANCO DIAS, ARMANDO CAVALCANTE; LUVIZOTTO, DANICE MAZZER; DINI-ANDREOTE, FRANCISCO; FASANELLA, CRISTIANE CIPOLA; LOPEZ, MARYEIMY VARON; BAENA, SANDRA; TAKETANI, RODRIGO GOUVEA; DE MELO, ITAMAR SOARES. The Microbiome of Brazilian Mangrove Sediments as Revealed by Metagenomics. PLoS One, v. 7, n. 6 JUN 21 2012. Citações Web of Science: 92.
RIGONATO, JANAINA; ALVARENGA, DANILLO OLIVEIRA; ANDREOTE, FERNANDO DINI; FRANCO DIAS, ARMANDO CAVALCANTE; MELO, ITAMAR SOARES; KENT, ANGELA; FIORE, MARLI FATIMA. Cyanobacterial diversity in the phyllosphere of a mangrove forest. FEMS MICROBIOLOGY ECOLOGY, v. 80, n. 2, p. 312-322, MAY 2012. Citações Web of Science: 27.
FRANCO DIAS, ARMANDO CAVALCANTE; DINI-ANDREOTE, FRANCISCO; TAKETANI, RODRIGO GOUVEA; TSAI, SIU MUI; AZEVEDO, JOAO LUCIO; DE MELO, ITAMAR SOARES; ANDREOTE, FERNANDO DINI. Archaeal communities in the sediments of three contrasting mangroves. Journal of Soils and Sediments, v. 11, n. 8, p. 1466-1476, DEC 2011. Citações Web of Science: 29.
Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
DIAS, Armando Cavalcante Franco. Diversidade de arquéias e bactérias envolvidas na ciclagem do nitrogênio em sedimentos de manguezais. 2012. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Centro de Energia Nuclear na Agricultura Piracicaba.

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