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Bioprospecção de genes de biossíntese de polímeros biodegradáveis a partir de uma biblioteca metagenômica de solo de Mata Atlântica

Processo: 08/55955-7
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Mestrado
Vigência (Início): 01 de agosto de 2009
Vigência (Término): 28 de fevereiro de 2011
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
Pesquisador responsável:Luiziana Ferreira da Silva
Beneficiário:Yeimy Paola Galindo Rozo
Instituição-sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Assunto(s):Plásticos biodegradáveis   Poli-hidroxialcanoatos   Cupriavidus necator   Pseudomonas aeruginosa   Ralstonia eutropha

Resumo

Problemas associados com os plásticos convencionais no mundo inteiro têm gerado interes no desenvolvimento de polímeros biodegradáveis como os polihidroxialacanoatos (PHA). Os PHA são uma família de poliésteres acumulados por diversas bactérias, na forma de grânulos intracelulares de reserva de carbono, energia e equivalentes redutores. A produção de PHA depende da natureza química da matéria-prima oferecida como fonte de carbono à bactéria assim como das vias metabólicas que esta possui. A PHA sintase é a enzima chave para a biossíntese de PHA, uma vez que sua especificidade pelo substrato definirá a natureza do polímero final. Através de ferramentas moleculares e tecnologias baseadas em seqüências gênicas, trabalhos têm sido desenvolvidos para análise da diversidade microbiana dos solos. Recentemente, foi construída uma biblioteca metagenômica de solo de Mata Atlântica que conta com cerca de 5000 clones. Este material representa uma fonte de recursos genéticos brasileiros que podem abrigar novos genes ou conjuntos de - genes com potencial para a síntese de novos PHA. Neste contexto, o presente trabalho buscará, nesta biblioteca metagenômica, a caracterização dos fragmentos abrigando genes da PHA sintase, que será realizada tendo em mente a busca de genes a ele agrupados e que potencialmente estão envolvidos na síntese de PHA. No presente estudo serão construídas sondas não radioativas a partir de genes da PHA sintase de Ralstonia eutropha (phaCRe) e de Pseudomonas aeruginosa (phaCPa) para buscar os fragmento de interes na biblioteca. Os clones que forem detectados com as sondas serão submetidos à extração de DNA plasmidial para análise e caracterização dos fragmentos, sendo estes submetidos à subclonagens e posterior análise dos seqüenciamentos obtidos. (AU)

Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
ROZO, Yeimy Paola Galindo. Bioprospecção de genes relacionados à biossíntese de polímeros biodegradáveis a partir de uma biblioteca metagenômica de solo de Mata Atlântica.. 2011. Dissertação de Mestrado - Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Ciências Biomédicas São Paulo.

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