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Análise e caracterização molecular, estrutural e populacional de proteases de HIV-1 do estado de São Paulo

Processo: 08/58559-5
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
Vigência (Início): 01 de abril de 2009
Vigência (Término): 31 de março de 2012
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
Pesquisador responsável:Paolo Marinho de Andrade Zanotto
Beneficiário:Atila Iamarino
Instituição-sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Assunto(s):HIV-1   Peptídeo hidrolases   Mutação   Inibidores da protease de HIV   Farmacorresistência viral

Resumo

Apesar dos esforços mundiais para o controle da infecção por HIV-1, a extrema variedade de formas recombinantes tem contribuído para o aumento no número de pacientes contaminados em todo o mundo. No Brasil inúmeros recombinantes também têm sido descritos, principalmente entre os subtipos B/F, B/C e F/D. Durante a tarefa coordenada de HIV-1 da Rede de Diversidade Genética Viral (VGDN), também foi encontrado um grande número de vírus recombinantes (B/F, B/D, B/A). A grande maioria dos vírus recombinantes BF encontrados pelo projeto VGDN possui uma protease predominantemente F. Dados estruturais sobre proteases F apontam que polimorfismos característicos do subtipo F podem atuar como mutações restauradoras da atividade enzimática de proteases resistentes a inibidores. Este estudo visa modelar e simular in silico a interação entre proteases B e F portadoras de mutações primárias de resistência similares com o inibidor Nelfinavir, amplamente utilizado no estado de São Paulo. Com base nos resultados das simulações serão induzidas as mutações mais relevantes em proteases não resistentes do subtipo B e F para medir a atividade enzimática na presença do inibidor Nelfinavir, permitindo assim inferir a influência dos polimorfismos do subtipo F na atividade de proteases resistentes. (AU)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
FAUSTO, SIBELE; MACHADO, FABIO A.; BENTO, LUIZ FERNANDO J.; IAMARINO, ATILA; NAHAS, TATIANA R.; MUNGER, DAVID S. Research Blogging: Indexing and Registering the Change in Science 2.0. PLoS One, v. 7, n. 12 DEC 12 2012. Citações Web of Science: 46.
IAMARINO, ATILA; DE MELO, FERNANDO LUCAS; BRACONI, CARLA TORRES; DE ANDRADE ZANOTTO, PAOLO MARINHO. BF Integrase Genes of HIV-1 Circulating in Sao Paulo, Brazil, with a Recurrent Recombination Region. PLoS One, v. 7, n. 4 APR 2 2012. Citações Web of Science: 3.
Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
IAMARINO, Atila. Análise e caracterização molecular, estrutural e populacional de proteases de HIV-1 do Estado de São Paulo.. 2012. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Ciências Biomédicas São Paulo.

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