| Processo: | 07/08354-5 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Doutorado |
| Data de Início da vigência: | 01 de junho de 2008 |
| Data de Término da vigência: | 31 de agosto de 2010 |
| Área de conhecimento: | Ciências Agrárias - Agronomia - Ciência do Solo |
| Pesquisador responsável: | Marli de Fátima Fiore |
| Beneficiário: | Janaina Rigonato |
| Instituição Sede: | Centro de Energia Nuclear na Agricultura (CENA). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil |
| Vinculado ao auxílio: | 04/13910-6 - Biodiversidade e atividades funcionais de microrganismos de manguezais do estado de São Paulo, AP.BTA.TEM |
| Assunto(s): | Biodiversidade Ecossistemas de mangue Cianobactérias DNA Reação em cadeia por polimerase (PCR) |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | Biodiversidade | Dna | Ecologia | Ecossistemas de Manguezal | Pcr | sequenciamento | Ecologia Molecular de Cianobacterias |
Resumo Este projeto de pesquisa tem como objetivo avaliar a diversidade de cianobactérias em ecossistemas de manguezal, bem como, verificar possíveis alterações na população deste microrganismo em ambiente impactado por derramamento de petróleo contrastando com outro não impactado. Para tanto, serão utilizadas ferramentas moleculares, como DGGE e biblioteca do gene de DNAr 16S. Serão coletados solos de manguezais situados no Estado de São Paulo (Cananéia-Ilha do Cardoso e Bertioga), o DNA total será extraído, o gene de DNAr 16S será amplificado com iniciadores específicos para cianobactérias, e o produto será analisado usando a metodologia do DGGE. Os amplicons resultantes serão excisados do gel e sequenciados. A identificação das cianobactérias será feita por meio da comparação das sequências obtidas na análise BLAST (NCBI). As relações entre essas sequências serão estudadas por meio da construção de árvores filogenéticas. A biblioteca do gene de DNAr 16S será construída a partir da amplificação por PCR do DNA total do solo e o produto será clonado em Escherichia coli. Os insertos contidos nos plasmídeos serão amplificados por PCR e sequenciados. As análises serão efetuadas da mesma maneira que para o DGGE. Informações a respeito da diversidade de cianobactérias presentes em ecossistemas de manguezal brasileiros são praticamente inexistentes e este projeto irá gerar conhecimentos sobre a distribuição deste grupo de bactérias tão importante para esse ambiente. (AU) | |
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