Caracterização molecular da gp120 do HIV-1 e suas implicações sobre o tropismo pelos correceptores CCR5 e CXCR4

• Processo: 10/00222-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Vigência (Início): 01 de junho de 2010
• Vigência (Término): 31 de maio de 2014
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Jorge Simao do Rosario Casseb
• Beneficiário: Liã Bárbara Arruda
• Instituição Sede: Instituto de Medicina Tropical de São Paulo (IMT). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): HIV-1 Biologia computacional Virologia Tropismo
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformática | Correceptores | Hiv-1 | Tropismo | Virologia

Resumo

A descoberta do tropismo do HIV-1 pelos correceptores CCR5 e CXCR4 propiciou o desenvolvimento de novas estratégias terapêuticas com alvo nestes correceptores. Os antagonistas de CCR5 são uma nova classe de drogas que bloqueiam o correceptor CCR5, impedindo a entrada do HIV na célula, levando a uma diminuição significativa da viremia. Porém, antes do início da administração desta classe de drogas é necessário a determinação do tropismo e o monitoramento da possível mudança de tropismo ao longo do tempo. Os ensaios padrão-ouro para a determinação do tropismo são pouco acessíveis, mas a difusão dos softwares preditores de tropismo a partir de sequências da região V3 representam uma alternativa mais viável para a triagem dos candidatos ao uso dos antagonistas de CCR5. A alça V3 da gp120 do envelope do HIV-1 é considerada o principal determinante do tropismo, mas outros fatores como diferenças intrísecas entre as variantes do HIV-1, o número de sítios de N-glicosilação, variações da extensão de determinadas regiões e a carga elétrica global da gp120 também podem afetar o tropismo viral. No presente estudo, a análise destes fatores associada à utilização de ferramentas de bioinformática, permitirá a caracterização de alterações genotípicas específicas do tropismo viral, constituindo um modelo de estudo mais acessível e financeiramente mais viável e que proverá informações importantes para a adoção de estratégias terapêuticas mais eficiazes.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

LIÃ BÁRBARA ARRUDA; MARILIA LADEIRA DE ARAÚJO; MAIRA LUCCIA MARTINEZ; CLAUDIO ROBERTO GONSALEZ; ALBERTO JOSÉ DA SILVA DUARTE; EOIN COAKLEY; YOLANDA LIE; JORGE CASSEB. Determinação do tropismo viral por ensaios genotípicos e fenotípicos em pacientes brasileiros infectados por HIV-1. Revista do Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, v. 56, n. 4, p. 287-290, 2014-07-00. (10/00222-5, 08/58138-0, 08/51265-6)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

ARRUDA, Liã Bárbara. Caracterização molecular da gp120 do HIV-1 e suas implicações sobre o tropismo pelos correceptores CCR5 e CXCR4. 2014. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Medicina Tropical de São Paulo (IMT) São Paulo.