Variação alélica em cana-de-açúcar: quantificação do polimorfismo de sequência

• Processo: 10/02610-2
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2010
• Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2012
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
• Pesquisador responsável: Michel Georges Albert Vincentz
• Beneficiário: Mariane de Mendonça Vilela
• Instituição Sede: Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Assunto(s): Genética molecular vegetal Frequência do gene Homeostase Cana-de-açúcar
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Cana de Açúcar | homeostasia de expressão | variação alélica | Genética Molecular

Resumo

A cana-de-açúcar, pertencente ao gênero Saccharum L., originária do sudeste asiático e onde desde tempos remotos tem sido utilizada para a produção de açúcar. O bioetanol, um dos subprodutos da cana, representa uma importante fonte de energia renovável e menos poluidora que os derivados do petróleo. Até o momento, os programas de melhoramento da cana baseiam-se basicamente em cruzamentos e seleção das novas variedades originadas de cruzamentos entre híbridos de S. officinarum e S. spontaneum. Novos recursos genômicos foram desenvolvidos para auxiliar a pesquisa genética em cana: mapas genéticos, coleções de ESTs e biblioteca de BACs já estão disponíveis. No entanto a alta poliploidia, heterozigose e o comportamento meiótico irregular têm tornado um desafio a aplicação de marcadores moleculares e os estudos genéticos em geral. Sendo um dos genomas mais complexos que se conhece, a sintenia observada em gêneros próximos tem se tornado mais uma ferramenta essencial para o entendimento do genoma da cana. Diante da crescente importância econômica e da intrigante complexidade do genoma da cana-de-açúcar, propomos sequenciar e anotar as regiões homo/homeólogas dos genes únicos Leafy, TOR quinase e Fitocromo C, a fim de avaliar a variação alélica e a homeostasia de expressão destes genes em populações segregantes. Os conhecimentos adquiridos deverão permitir revelar novos aspectos da evolução do genoma da cana assim como aprimorar de maneira mais precisa o processo do melhoramento desta planta. O projeto também se enquadra dentro do contexto de um esforço internacional de se sequenciar o genoma da cana. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

VILELA, MARIANE DE MENDONCA; DEL BEM, LUIZ EDUARDO; VAN SLUYS, MARIE-ANNE; DE SETTA, NATHALIA; KITAJIMA, JOAO PAULO; QUEIROGA CRUZ, GUILHERME MARCELO; SFORCA, DANILO AUGUSTO; DE SOUZA, ANETE PEREIRA; GOMES FERREIRA, PAULO CAVALCANTI; GRATIVOL, CLICIA; et al. Analysis of Three Sugarcane Homo/Homeologous Regions Suggests Independent Polyploidization Events of Saccharum officinarum and Saccharum spontaneum. GENOME BIOLOGY AND EVOLUTION, v. 9, n. 2, p. 266-278, FEB 2017. (10/02610-2)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

VILELA, Mariane de Mendonça. Understanding polyploid genomes: insights on the organization and evolution of sugarcane genome = Compreendendo os genomas poliploides : 'insights' sobre a organização e evolução do genoma da cana-de-açúcar. 2015. Tese de Doutorado - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de Biologia Campinas, SP.