Estudo do regime mutacional do Vírus da Imunodeficiência Humana tipo 1 (HIV-1) em cultivo celular durante o bottleneck e após estabilização da população viral

• Processo: 10/04047-3
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2010
• Data de Término da vigência: 29 de fevereiro de 2012
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia - Biologia e Fisiologia dos Microorganismos
• Pesquisador responsável: Luiz Mário Ramos Janini
• Beneficiário: Lucas Nogueira Simão
• Instituição Sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Diversidade genética Virologia HIV-1
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Diversidade Genética | gargalo genético da transmissão | Hiv-1 | Mutações adaptativas | mutações neutras | Quasispécies | Virologia

Resumo

O HIV-1 apresenta uma elevada diversidade genética, gerada como consequência de características intrínsecas ao processo de replicação viral, tais como incapacidade de correção de erros de incorporação de nucleotídeos pela transcriptase reversa viral e altas taxas de replicação viral. Essa diversidade genética elevada evidencia-se na heterogeneidade das populações virais formadas, compostas por partículas geneticamente semelhantes apresentando diferenças sutis. Tais populações são denominadas quasispecies, e dependem da diversidade genética que possuem. Porém, na transmissão do HIV-1, apenas um número reduzido de partículas virais são passadas e conseguem estabelecer a infecção no novo hospedeiro, resultando em diminuição significativa da diversidade genética dentro da população original. Esse fenômeno é denominado "bottleneck" e coloca em risco a sobrevivência da população viral. Ao infectar um novo hospedeiro, esta diversidade genética é gradativamente recuperada provavelmente como uma tentativa de restabelecer a diversidade perdida e possibilitar a sobrevivência viral no novo ambiente. Nosso grupo demonstrou que esta recuperação pode ocorrer através da intensificação de taxas mutacionais logo após os eventos bottlenecks. Um estudo recente sugere que após a ocorrência de um evento bottleneck, o genoma viral tende a acumular mutações adaptativas ou não-sinônimas, ao contrário das mutações neutras normalmente observadas quando a população viral se encontra sob o equilíbrio entre mutação e seleção. O entendimento dos eventos mutacionais após os bottlenecks é fundamental para o estudo da transmissão do HIV entre pacientes. Dessa forma, utilizando culturas de Células Mononucleares de Sangue Periférico (PBMCs), iremos mimetizar o fenômeno de gargalo genético observado na transmissão do HIV-1 e avaliar as características da diversidade genética viral resultante desse fenômeno.