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Identificação de padrões moleculares relacionados ao desenvolvimento do carcinoma epidermóide oral utilizando a tecnologia de micro-arranjos de cDNA

Processo: 10/08400-0
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Doutorado
Vigência (Início): 01 de setembro de 2010
Vigência (Término): 31 de agosto de 2014
Área do conhecimento:Ciências da Saúde - Medicina - Anatomia Patológica e Patologia Clínica
Pesquisador responsável:Alfredo Ribeiro da Silva
Beneficiário:João Paulo Oliveira da Costa
Instituição-sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Assunto(s):Patologia bucal   Carcinoma de células escamosas   Análise de sequência com séries de oligonucleotídeos   Estadiamento de neoplasias

Resumo

O carcinoma epidermóide oral (CEO) é a principal neoplasia maligna da cavidade oral, respondendo por mais de 95% dos tumores de boca, e tem sido associado a um pior prognóstico e alta morbidade quando diagnosticado em estágios avançados. Pouco se sabe, no entanto, sobre as mudanças no perfil de expressão gênica durante todas as fases do desenvolvimento dos carcinomas epidermóides orais. Nesse trabalho, através da técnica dos micro-arranjos de cDNA, o nosso objetivo é verificar se existem diferenças de padrões de expressão gênica entre tumores de diferentes estadiamentos e relacionar estes padrões a fatores clínicos e microscópicos de importância prognóstica nos carcinomas epidermóides orais. Do Banco de Tumores do Hospital A.C. Camargo serão retiradas amostras congeladas a -80°C de carcinomas epidermóides orais, sendo 10 casos de cada estadiamento clínico (I, II, III e IV) e dez amostras de tecido normal. Serão utilizados microarranjos de DNA complementar (cDNA microarrays) avaliando a expressão de todos os genes do genoma humano, que serão hibridizados e comparados a arranjos de tecido normal. A identificação dos genes diferencialmente expressos entre um conjunto definido de amostras se dará pela aplicação do teste estatístico para análise de microarrays SAM (Significance Analysis of Microarrays). Seus resultados serão comparados em função da classificação clínica dos tumores. Para confirmação da alteração na expressão gênica será utilizada a técnica de RT-PCR, para 10 genes diferencialmente expressos e sua expressão comparada a fatores clínicos e patológicos dos tumores. (AU)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
OLIVEIRA-COSTA, JOAO PAULO; DE CARVALHO, ALEX FIORINI; DA SILVEIRA, GIORGIA GOBBI; AMAYA, PETER; WU, YONGQI; PARK, KYOUNG-JOO JENNY; GIGLIOLA, MABEL PINILLA; LUSTBERG, MARYAM; CAVICCHIOLI BUIM, MARCILEI ELIZA; FERREIRA, ELISA NAPOLITANO; KOWALSKI, LUIZ PAULO; CHALMERS, JEFFREY J.; SOARES, FERNANDO AUGUSTO; CARRARO, DIRCE MARIA; RIBEIRO-SILVA, ALFREDO. Gene expression patterns through oral squamous cell carcinoma development: PD-L1 expression in primary tumor and circulating tumor cells. ONCOTARGET, v. 6, n. 25, p. 20902-20920, AUG 28 2015. Citações Web of Science: 44.
OLIVEIRA-COSTA, JOAO PAULO; OLIVEIRA, LUCINEI ROBERTO; DA SILVEIRA, GIORGIA GOBBI; SOAVE, DANILO FIGUEIREDO; SOARES, FERNANDO AUGUSTO; RIBEIRO-SILVA, ALFREDO. Topoisomerase expression in oral squamous cell carcinoma: relationship with cancer stem cells profiles and lymph node metastasis. JOURNAL OF ORAL PATHOLOGY & MEDICINE, v. 41, n. 10, p. 762-768, NOV 2012. Citações Web of Science: 6.
OLIVEIRA-COSTA, JOAO PAULO; ZANETTI, JULIANA S.; SILVEIRA, GIORGIA G.; SOAVE, DANILO F.; OLIVEIRA, LUCINEI R.; ZORGETTO, VERONICA A.; SOARES, FERNANDO A.; ZUCOLOTO, SERGIO; RIBEIRO-SILVA, ALFREDO. Differential expression of HIF-1 alpha in CD44(+)CD24(-/) (low) breast ductal carcinomas. DIAGNOSTIC PATHOLOGY, v. 6, AUG 8 2011. Citações Web of Science: 17.

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