Estudo de proteômica como estratégia para identificação de biomarcadores para diagnóstico precoce de candidemia

• Processo: 10/17179-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2010
• Data de Término da vigência: 30 de novembro de 2013
• Área de conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina
• Pesquisador responsável: Arnaldo Lopes Colombo
• Beneficiário: Fernando César Bizerra
• Instituição Sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 07/08575-1 - Candidíase hematogênica: uma abordagem multidisciplinar para o aprimoramento de ferramentas diagnósticas e caracterização de biomarcadores relacionados ao seu prognóstico, AP.TEM
• Assunto(s): Infectologia Candidemia Biomarcadores Diagnóstico precoce Proteômica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: biomarcadores | Candidemia | diagnóstico | proteômica | Infectologia

Resumo

Atualmente, Candida spp. responde pela grande maioria dos casos de infecções fúngicas invasivas hospitalares. A infecção de corrente sanguínea por Candida spp. (candidemia), muitas vezes, é diagnosticada tardiamente e está associada à alta taxa de mortalidade, repercutindo ainda no tempo e no custo de internação hospitalar. Apesar dos esforços da comunidade científica, ainda não há métodos adequados para diagnóstico precoce da candidemia. Neste contexto, a proteômica tem surgido como importante ferramenta aplicada à pesquisa e à busca por novos biomarcadores para diagnóstico. Assim, utilizando a proteômica como estratégia de estudo, este projeto tem como objetivos: 1) Padronizar ensaios de espectrometria de massa para identificação de proteínas presentes no plasma de pacientes com diagnóstico de candidemia; 2) Comparar o perfil protéico do plasma de pacientes com candidemia ao de pacientes de grupos controle; 3) Identificar possíveis proteínas fúngicas circulantes, presentes especificamente no plasma de pacientes com candidemia; 4) Validar as estratégias diagnósticas desenvolvidas a partir dos objetivos 2 e 3. Inicialmente, em um ensaio piloto, nos propomos a padronizar algumas etapas essenciais ao desenvolvimento deste estudo, incluindo análise do volume ideal de plasma a ser utilizado, do método de extração das proteínas e do impacto da depuração da albumina na identificação das demais proteínas presentes no plasma. Para o objeto 2 e 3, as seguintes coortes serão formadas: pacientes com candidemia (n=10); pacientes com bacteremia (n=10); indivíduos sadios (n=10). As proteínas plasmáticas serão analisadas diretamente em um espectrômetro de massa, através da tecnologia Multidimensional Protein Identification Technology (MudPIT). Através dos resultados da espectrometria de massa, nos propomos a caracterizar o perfil protéico específico de pacientes com candidemia comprovada (objetivo 2), assim como identificar possíveis proteínas fúngicas circulantes (objetivo 3). Uma vez encontrados biomarcadores sugestivos de candidemia, sua utilidade clínica será validada em coortes com maior número de pacientes por grupo (n=50, por grupo). Este projeto visa o desenvolvimento de novas estratégias diagnósticas que possibilitem o reconhecimento precoce de candidemia, o que pode resultar na diminuição do tempo para início da terapia antifúngica e, conseqüentemente, diminuição das taxas de mortalidade, repercutindo ainda na diminuição do tempo e dos custos de internação hospitalar. Este estudo conta com as colaborações do Laboratório de Proteômica da UNIFESP, Laboratório ThoMSon - UNICAMP e da empresa Waters, fabricante do espectrômetro de massa, com os quais já possuímos projetos em andamento. (AU)

Publicações científicas

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(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

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ITURRIETA-GONZALEZ, ISABEL ANTONIETA; BARBOSA PADOVAN, ANA CAROLINA; BIZERRA, FERNANDO CESAR; HAHN, ROSANE CHRISTINE; COLOMBO, ARNALDO LOPES. Multiple Species of Trichosporon Produce Biofilms Highly Resistant to Triazoles and Amphotericin B. PLoS One, v. 9, n. 10, OCT 31 2014. (10/17179-5, 07/08575-1)

BIZERRA, FERNANDO CESAR; JIMENEZ-ORTIGOSA, CRISTINA; SOUZA, ANA CAROLINA R.; BREDA, GIOVANNI LUIS; QUEIROZ-TELLES, FLAVIO; PERLIN, DAVID S.; COLOMBO, ARNALDO L.. Breakthrough Candidemia Due to Multidrug-Resistant Candida glabrata during Prophylaxis with a Low Dose of Micafungin. Antimicrobial Agents and Chemotherapy, v. 58, n. 4, p. 2438-2440, APR 2014. (12/04769-4, 10/17179-5, 12/04767-1, 07/08575-1)