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Integrando citogenética e genômica na compreensão da estrutura e evolução de Cromossomos B em eucariotos utilizando o peixe ciclídeo Haplochromis obliquidens como modelo

Processo: 10/17225-7
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de março de 2011
Vigência (Término): 31 de julho de 2011
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
Pesquisador responsável:César Martins
Beneficiário:Diogo Cavalcanti Cabral de Mello
Instituição-sede: Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
Assunto(s):Citogenética   Peixes   Evolução animal   Genomas

Resumo

Os cromossomos B ocorrem em adição ao complemento cromossômico A em cerca de 15% das espécies de eucariotos. Diversos estudos têm sido conduzidos relacionados à distribuição, freqüência, mecanismos de transmissão, efeitos na expressão gênica, estrutura e origem destes cromossomos. Quanto à composição, a maioria dos cromossomos B são heterocromáticos ou compostos basicamente de elementos repetitivos, entretanto a presença de genes cópia única não tem sido rigorosamente testada. Além disso, estudos de expressão gênica relacionados a cromossomos B ou sua influência na expressão do genoma A são restritos a poucos grupos. Os peixes ciclídeos têm recebido grande interesse científico, devido muitas espécies apresentarem grande importância para a aqüicultura e alguns grupos terem sofrido um rápido e extenso processo de radiação adaptativa. Além disso, em algumas espécies do grupo tem sido relatada a presença de cromossomos B, como observado em Haplochromis obliquidens. Diversas espécies do grupo, tais como Oreochromis niloticus já possuem genomas seqüenciados e outras estão em processo de seqüenciamento. Adicionalmente, plataformas de microarray estão disponíveis para as espécies O. niloticus e A. burtoni. Considerando os aspectos citados, atrelados à possibilidade do uso de ferramentas que integram dados genômicos, por exemplo, genomas inteiros seqüenciados e plataformas de microarray e citogenética molecular (citogenômica), o presente projeto visa analisar a conteúdo genômico, origem, evolução e alterações na expressão gênica relacionada presença de cromossomos B, utilizando a espécie H. obliquidens como modelo. Estas análises citogenômicas mostram-se promissoras na elucidação de diversas questões em relação a vários mecanismos/processos e estruturas biológicas, como os cromossomos B, abrindo perspectivas ao aprofundamento quanto ao conhecimento do significado biológico dos mesmos em eucariotos. (AU)