Caracterização de transcritos alternativos dos genes da família Dapper identificados por análises de Bioinformática

• Processo: 11/00260-7
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2011
• Data de Término da vigência: 29 de fevereiro de 2012
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Morfologia - Embriologia
• Pesquisador responsável: Lúcia Elvira Álvares
• Beneficiário: Fernanda Cristina da Veiga
• Instituição Sede: Instituto de Biologia (IB). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 06/05892-3 - Estudo das funções dos genes da família Frodo/Dapper na embriogênese dos vertebrados, AP.JP
• Assunto(s): Genética do desenvolvimento Embriogênese Processamento alternativo
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Dappers | Desenvolvimento embrionário | Splicing alternativo | Genética do Desenvolvimento

Resumo

Os genes da família Dapper (Dpr) codificam proteínas multifuncionais que desempenham importantes funções na embriogênese. Com o intuito de identificar isoformas expressas durante o desenvolvimento, foram analisadas todas as seqüências de cDNAs e ESTs de camundongo dos genes Dpr depositadas nos bancos de dados do browser genômico da Universidade Califórnia Santa Carolina (UCSC). Estas análises sugerem a existência de transcritos alternativos dos genes Dpr1 e Dpr2, enquanto não há evidências de isoformas geradas a partir de Dpr3. Além disto, análises de genômica comparativa indicam que a expressão de algumas das isoformas identificadas é conservada em outros vertebrados, como galinha e anfíbio. Desta forma, o objetivo deste projeto de pesquisa é confirmar a existência das isoformas identificadas in silico, por meio de ensaios de RT-PCR e RACE. Os dados gerados por este projeto serão cruciais para o estabelecimento das estratégias que serão empregadas nos ensaios funcionais para estudar a função dos genes Dpr na embriogênese dos vertebrados.