Caracterização da resposta de Citrus sinensis à infecção por Xylella fastidiosa e filogenômica de suas diferentes linhagens.

• Processo: 11/01217-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Vigência (Início): 01 de julho de 2011
• Vigência (Término): 30 de junho de 2014
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
• Pesquisador responsável: Aline Maria da Silva
• Beneficiário: Joaquim Martins Junior
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Xylella Filogenia Transcriptoma
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Filogenômica | interação patógeno-planta | pirossequenciamento | transcritoma | xylella | Expressão gênica, filogenômica

Resumo

Neste projeto pretendemos investigar a interação de diferentes cepas de Xylella fastidiosa associadas à Clorose Variegada dos Citrus (CVC) e seu hospedeiro vegetal (Citrus sinensis) e,também, reconstruir a filogenia da X. fastidiosa, através de uma abordagem filogenômica. Temoscomo objetivos responder às seguintes questões: (i) Quais as variações no perfil de expressão gênica de C. sinensis ao longo da infecção com distintas cepas de citros (estirpes que exibem diferentes fenótipos quanto à formação de biofilme in vitro e/ou virulência in planta)? (ii) Como se deu a origem e a diversidade das diferentes cepas e patovares de X. fastidiosa, sua distribuição e qual sua relação filogenética? Para responder à primeira pergunta, pretendemos avaliar e comparar o transcritoma ao longo da infecção de plantas suscetíveis com as diferentes cepas utilizando-se sequenciamento intensivo de nova geração (RNA-seq). Para responder à segunda questão, o projeto prevê a análise filogenômica de cepas de X. fastidiosa isoladas de hospedeiros variados (videira, citros, café, amendoeira, espirradeira, ameixeira, hibiscus) cujas sequências genômicas já estão disponíveis ou em fase de obtenção e, também, o pirossequenciamento do genoma de outras cepas, em particular cepas sul-americanas. As análises serão realizadas utilizando-se diferentes métodos deconstrução de árvores filogenéticas. Em conjunto, tais estudos possibilitarão compreender como sedá a resposta da planta frente à infecção por Xylella e, também, qual a relação filogenética, adistribuição e origem das diferentes cepas.

Publicações científicas

(4)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

PIERRY, PAULO MARQUES; UCEDA-CAMPOS, GUILLERMO; FEITOSA-JUNIOR, OSEIAS RODRIGUES; MARTINS-JUNIOR, JOAQUIM; DE SANTANA, WESLEY OLIVEIRA; DELLA COLETTA-FILHO, HELVECIO; ZAINI, PAULO ADRIANO; DA-SILVA, ALINE MARIA. Genetic Diversity ofXylella fastidiosaPlasmids Assessed by Comparative Genomics. TROPICAL PLANT PATHOLOGY, v. 45, n. 3, SI, JUN 2020. (09/13527-1, 08/11703-4, 11/01217-8)

PIERRY, PAULO MARQUES; DE SANTANA, WESLEY OLIVEIRA; KITAJIMA, JOAO PAULO; MARTINS-JUNIOR, JOAQUIM; ZAINI, PAULO ADRIANO; UCEDA-CAMPOS, GUILLERMO; FEITOSA-JUNIOR, OSEIAS R.; SILVA PESSOA, PATRICIA ISABELA; DELLA COLETTA-FILHO, HELVECIO; DE SOUZA, ALESSANDRA ALVES; et al. High-Quality Draft Genome Sequence Resources of Eight Xylella fastidiosa Strains Isolated from Citrus, Coffee, Plum, and Hibiscus in South America. PHYTOPATHOLOGY, v. 110, n. 11, p. 1751-1755, NOV 2020. (08/11703-4, 11/01217-8, 09/13527-1)

PIERRY, PAULO MARQUES; UCEDA-CAMPOS, GUILLERMO; FEITOSA-JUNIOR, OSEIAS RODRIGUES; MARTINS-JUNIOR, JOAQUIM; DE SANTANA, WESLEY OLIVEIRA; DELLA COLETTA-FILHO, HELVECIO; ZAINI, PAULO ADRIANO; DA-SILVA, ALINE MARIA. Genetic Diversity ofXylella fastidiosaPlasmids Assessed by Comparative Genomics. ROPICAL PLANT PATHOLOG, v. 45, n. 3, p. 19-pg., 2020-06-10. (11/01217-8, 09/13527-1, 08/11703-4)

UCEDA-CAMPOS, GUILLERMO; FEITOSA-JUNIOR, OSEIAS R.; SANTIAGO, CAIO R. N.; PIERRY, PAULO M.; ZAINI, PAULO A.; DE SANTANA, WESLEY O.; MARTINS, JOAQUIM; BARBOSA, DEIBS; DIGIAMPIETRI, LUCIANO A.; SETUBAL, JOAO C.; et al. Comparative Genomics of Xylella fastidiosa Explores Candidate Host-Specificity Determinants and Expands the Known Repertoire of Mobile Genetic Elements and Immunity Systems. MICROORGANISMS, v. 10, n. 5, p. 20-pg., 2022-05-01. (11/09409-3, 08/11703-4, 21/04062-7, 09/13527-1, 11/01217-8)