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Desenvolvimento e otimização de primers EST-SSRs em Glycine Max

Processo: 08/09083-8
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
Vigência (Início): 01 de outubro de 2008
Vigência (Término): 31 de dezembro de 2009
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Agronomia - Fitotecnia
Pesquisador responsável:José Baldin Pinheiro
Beneficiário:Keila de Cássia Brioschi
Instituição-sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:07/06249-0 - Mapeamento de QTLs associados à resistência da soja ao complexo de percevejos, AP.R
Assunto(s):Melhoramento genético   Repetições de microssatélites   Glycine max   Marcador molecular

Resumo

Os percevejos sugadores de sementes são considerados uma das pragas de maior importância para a cultura da soja (Glycine max). Estudos utilizando marcadores moleculares são fundamentais na identificação dos QTLs envolvidos na resistência aos percevejos, permitindo aumento na eficiência de avaliação e facilitando a seleção de alelos favoráveis sem a ocorrência de arraste genético. Microssatélites ou Simple Sequence Repeat (SSR) têm sido amplamente utilizados na construção de mapas genéticos por serem loco-específicos, multialélicos e possuírem caráter co-dominante. Entretanto, os SSRs, apesar de informativos, ainda apresentam um custo elevado quando comparados a outros marcadores. Com isso, vários projetos de seqüenciamento de plantas vêm optando pela utilização de Expressed Sequence Tags (EST), na qual apenas os genes expressos pelo organismo são seqüenciados. A vantagem dos EST-SSRs é que eles podem ser utilizados de forma específica para mapeamento genético se apresentarem homologia com genes candidatos gerando um mapa funcional. No caso da soja, dispomos atualmente de um banco com mais de 458 mil ESTs (NCBI), cujas análises preliminares já revelaram a presença de centenas de microssatélites, que serão utilizados para realização do presente projeto.