Análise de associação usando SSR e SNP para obtenção de QTL para conteúdo de óleo em soja

• Processo: 09/17214-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Vigência (Início): 01 de dezembro de 2009
• Vigência (Término): 30 de novembro de 2010
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia - Fitotecnia
• Pesquisador responsável: Regina Helena Geribello Priolli
• Beneficiário: Natalia Spagnol Stabellini
• Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 08/56249-9 - Análise de associação usando SSR e SNP para obtenção de QTL para conteúdo de óleo de soja, AP.BIOEN.JP
• Assunto(s): Melhoramento genético vegetal Repetições de microssatélites Locos de características quantitativas Polimorfismo de um único nucleotídeo Ácidos graxos Soja
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: ácidos graxos | mapeamento associativo | Marcadores microssatélites | seleção assistida | Snp | Soja | Melhoramento Vegetal

Resumo

O presente projeto tem por objetivo identificar regiões genômicas e genes candidatos em soja associados ao teor de óleo e composição de seus ácidos graxos por meio de mapeamento associativo. O material vegetal objeto de estudo será constituído de duas subpopulações, com 48 acessos cada, divergentes no conteúdo de óleo. Inicialmente, serão determinadas as composições dos ácidos graxos dos 96 genótipos selecionados. As mesmas plantas serão caracterizadas pelo polimorfismo de 100 locos SSR (ou microssatélites), os quais serão escolhidos por serem locos de caracteres quantitativos (QTL) para conteúdo de óleo e também pelo alto polimorfismo apresentado em estudos prévios. Concomitantemente, serão seqüenciados cerca de 10 genes associados à biossíntese de óleo em uma amostra de 10 acessos de soja selecionados para alto e baixo teor de óleo. O sequenciamento permitirá a identificação de single nucleotide polymorphisms (SNP), os quais poderão ser associados a marcadores daqueles genes. Todos os 96 genótipos também serão genotipados para os mesmos SNPs selecionados. Serão estimados os coeficientes de desequilíbrio (D') e de correlação (r2) para todos os locos SSR e SNP a fim de ser obtido o desequilíbrio de ligação (LD) destes mesmos locos nas duas subpopulações. Diferenças apresentadas nas freqüências dos alelos nas duas subpopulações poderão ser associadas a supostos QTLs para conteúdo de óleo constituindo excelentes marcadores para seleção assistida em um programa de melhoramento de soja para teor de óleo.