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Análise de associação usando SSR e SNP para obtenção de QTL para conteúdo de óleo em soja

Processo: 09/17214-8
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
Vigência (Início): 01 de dezembro de 2009
Vigência (Término): 30 de novembro de 2010
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Agronomia - Fitotecnia
Pesquisador responsável:Regina Helena Geribello Priolli
Beneficiário:Natalia Spagnol Stabellini
Instituição-sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:08/56249-9 - Análise de associação usando SSR e SNP para obtenção de QTL para conteúdo de óleo de soja, AP.BIOEN.JP
Assunto(s):Melhoramento genético vegetal   Repetições de microssatélites   Locos de características quantitativas   Polimorfismo de um único nucleotídeo   Ácidos graxos   Soja

Resumo

O presente projeto tem por objetivo identificar regiões genômicas e genes candidatos em soja associados ao teor de óleo e composição de seus ácidos graxos por meio de mapeamento associativo. O material vegetal objeto de estudo será constituído de duas subpopulações, com 48 acessos cada, divergentes no conteúdo de óleo. Inicialmente, serão determinadas as composições dos ácidos graxos dos 96 genótipos selecionados. As mesmas plantas serão caracterizadas pelo polimorfismo de 100 locos SSR (ou microssatélites), os quais serão escolhidos por serem locos de caracteres quantitativos (QTL) para conteúdo de óleo e também pelo alto polimorfismo apresentado em estudos prévios. Concomitantemente, serão seqüenciados cerca de 10 genes associados à biossíntese de óleo em uma amostra de 10 acessos de soja selecionados para alto e baixo teor de óleo. O sequenciamento permitirá a identificação de single nucleotide polymorphisms (SNP), os quais poderão ser associados a marcadores daqueles genes. Todos os 96 genótipos também serão genotipados para os mesmos SNPs selecionados. Serão estimados os coeficientes de desequilíbrio (D') e de correlação (r2) para todos os locos SSR e SNP a fim de ser obtido o desequilíbrio de ligação (LD) destes mesmos locos nas duas subpopulações. Diferenças apresentadas nas freqüências dos alelos nas duas subpopulações poderão ser associadas a supostos QTLs para conteúdo de óleo constituindo excelentes marcadores para seleção assistida em um programa de melhoramento de soja para teor de óleo.

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