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Regulação epigenética do gene QQS (At3g30720) durante o desenvolvimento de Arabidopsis thaliana e em resposta a sinais abióticos

Processo: 11/06413-0
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Doutorado
Vigência (Início): 01 de julho de 2011
Vigência (Término): 31 de março de 2015
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
Pesquisador responsável:Michel Georges Albert Vincentz
Beneficiário:Raphael Ricon de Oliveira
Instituição-sede: Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:08/52071-0 - Homeostase energética e sinalização por açúcar: diversificação dos mecanismos moleculares envolvidos no controle do balanço energético em angioespermas, AP.BIOEN.TEM
Assunto(s):Epigênese genética   Desenvolvimento   Arabidopsis thaliana

Resumo

Metilação de citosina e histonas H3/H4 do DNA são modificações epigenéticas importantes para inativação de elementos transponíveis (TEs), atuando como um sistema imune, e também influenciam a formação da heterocromatina e a expressão de genes. Em plantas as metilações ocorrem nas citosinas em todos os contextos de sequência, simétrico e assimétrico, sendo encontradas tanto em regiões promotoras quanto regiões transcritas (corpo do gene). O padrão de metilação é inicialmente estabelecido pela atividade "de novo" da DNA metiltransferase DRM2, em uma via dependente de componentes da maquinaria de RNAi, e mantido por duas outras metiltransferases, MET1 e CMT3. Em Arabidopsis thaliana é observada uma demetilação massiva do genoma no endosperma e nos núcleos vegetativos do pólen que reforçam o silenciamento de TEs nos gametas, porém o impacto da dinâmica de metilação do DNA sobre o desenvolvimento ainda é pouco documentado e compreendido. O gene Qua-quine Starch (QQS) é um neogene de A. thaliana localizado numa ilha heterocromática e está envolvido no controle do metabolismo de amido. Identificamos vários epialelos estáveis de QQS que apresentaram expressão dependente do grau de metilação de seu promotor e da região 5'UTR. O gene QQS também apresenta um perfil de expressão específico durante o desenvolvimento e em resposta a determinados sinais abióticos. O objetivo deste projeto é desvendar aspectos inéditos da interação entre sinais do desenvolvimento ou do meio ambiente com vias de controle de metilação do DNA usando QQS como gene marcador para estes fenômenos.

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
OLIVEIRA, R. R.; VIANA, A. J. C.; REATEGUI, A. C. E.; VINCENTZ, M. G. A. An efficient method for simultaneous extraction of high-quality RNA and DNA from various plant tissues. Genetics and Molecular Research, v. 14, n. 4, p. 18828-18838, 2015. Citações Web of Science: 2.
Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
OLIVEIRA, Raphael Ricon de. Regulação epigenética do neogene Qua-Quine Starch durante o desenvolvimento de Arabidopsis thaliana e o impacto no metabolismo de amido. 2015. Tese de Doutorado - Universidade Estadual de Campinas. Instituto de Biologia.

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