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Estudos estruturais e funcionais das enzimas beta-galactosidases de Xanthomonas campestris

Processo: 11/05712-3
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
Vigência (Início): 01 de setembro de 2011
Vigência (Término): 31 de agosto de 2016
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
Pesquisador responsável:Igor Polikarpov
Beneficiário:Andre Schutzer de Godoy
Instituição-sede: Instituto de Física de São Carlos (IFSC). Universidade de São Paulo (USP). São Carlos , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:08/56255-9 - Structure and function of enzymes and auxiliary proteins from Trichoderma, active in cell-wall hydrolysis, AP.BIOEN.TEM
Bolsa(s) vinculada(s):15/08406-1 - Caracterização bioquímica e estrutural de novas enzimas auxiliares identificadas por técnicas de metasecretoma, BE.EP.DD
Assunto(s):Cristalografia de proteínas   Hidrólise enzimática   Síntese enzimática   Prebióticos   beta-Galactosidase

Resumo

Hidrolases de glicosídeos pertencem a um grupo bastante diversificado de enzimas que atuam em ligações glicosídicas. Baseado na sua classificação estrutural conhece-se atualmente mais de 120 famílias de hidrolases de glicosídeos. Nossa proposta é estudar as enzimas ²-galactosidases de Xanthomonas campestris, visando elucidar seu mecanismo de ação enzimática e suas propriedades bioquímicas, biofísicas e estruturais. Pretendemos também comparar as mesmas com as da ²-galactosidase do Penicillium, por nos resolvida anteriormente, bem como outras ²-galactosidases caracterizadas molecularmente até o momento. Além disso, objetivamos modificar ²-galactosidases de Xanthomonas campestris usando mutagenese sítio-dirigida, visando compreender o mecanismo de ação e modular a atividade catalítica dessa enzima tanto na hidrólise, como na síntese de oligossacarídeos. Esperamos que determinação de estruturas destas enzimas e sua análise funcional permitirão entender melhor as relações estrutura-função que governam estas hidrolases de glicosídeos e suas propriedades físico-químicas que conferem o balanço de atividades hidrolíticas e transgalactosílicas desta classe de enzimas. (AU)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
GODOY, ANDRE SCHUTZER; CAMILO, CESAR MOISES; KADOWAKI, MARCO ANTONIO; MUNIZ, HELOISA DOS S.; SANTO, MELISSA ESPIRITO; MURAKAMI, MARIO TYAGO; NASCIMENTO, ALESSANDRO S.; POLIKARPOV, IGOR. Crystal structure of beta 1 -> 6-galactosidase from Bifidobacterium bifidum S17: trimeric architecture, molecular determinants of the enzymatic activity and its inhibition by alpha-galactose. FEBS Journal, v. 283, n. 22, p. 4097-4112, NOV 2016. Citações Web of Science: 5.
GODOY, ANDRE S.; DE LIMA, MARIANA Z. T.; CAMILO, CESAR M.; POLIKARPOV, IGOR. Crystal structure of a putative exo-beta-1,3-galactanase from Bifidobacterium bifidum S17. ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY COMMUNICATIONS, v. 72, n. 4, p. 288-293, APR 2016. Citações Web of Science: 1.
PELLEGRINI, VANESSA O. A.; SERPA, VIVIANE ISABEL; GODOY, ANDRE S.; CAMILO, CESAR M.; BERNARDES, AMANDA; REZENDE, CAMILA A.; PEREIRA JUNIOR, NEI; CAIRO, JOAO PAULO L. FRANCO; SQUINA, FABIO M.; POLIKARPOV, IGOR. Recombinant Trichoderma harzianum endoglucanase I (Cel7B) is a highly acidic and promiscuous carbohydrate-active enzyme. Applied Microbiology and Biotechnology, v. 99, n. 22, p. 9591-9604, NOV 2015. Citações Web of Science: 11.
Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
GODOY, Andre Schutzer de. Estudos estruturais e funcionais das enzimas beta-galactosidases de bactérias. 2016. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Física de São Carlos São Carlos.

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