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Desenvolvimento de teste de paternidade para bovinos da raça Nelore baseado em marcadores do tipo SNP que estejam em desequilíbrio de ligação com microssatélites de referência

Processo: 11/01690-5
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Mestrado
Vigência (Início): 01 de agosto de 2011
Vigência (Término): 31 de julho de 2012
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
Pesquisador responsável:Luiz Lehmann Coutinho
Beneficiário:Milla Albuquerque de Souza
Instituição-sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
Assunto(s):Repetições de microssatélites   Melhoramento genético animal   Reação em cadeia por polimerase (PCR)   Polimorfismo genético

Resumo

Para um programa de melhoramento genético eficiente é necessária a correta identificação do parentesco dos animais. Para isso, são utilizados marcadores moleculares para a realização do teste de paternidade. No Brasil, o uso de marcadores microssatélite (MS) amplificados via PCR (Reação em Cadeia da Polimerase) continua sendo o modo mais utilizado, porém apresenta problemas técnicos inerentes a sua constituição (subjetividade da análise, dificuldade de automação), o que tem motivado o desenvolvimento de novas alternativas. Nesse sentido, os marcadores do tipo SNP (Polimorfismo de um único nucleotídeo) vem conquistando popularidade na comunidade científica internacional, por possuírem, dinâmica mutacional mais simples, gerar uma taxa menor de homoplasia, e, por outro lado, podem ser genotipados a baixo custo e em larga escala. A finalidade do presente trabalho é desenvolver um teste de paternidade para bovinos baseado em SNP. Mas, para que isto seja feito de maneira que não sejam perdidas as informações já existentes para animais que foram genotipados com marcadores MS, teremos que determinar o desequilíbrio de ligação entre os marcadores MS utilizados oficialmente para testes de paternidade e marcadores do tipo SNP. Para este fim, no presente projeto serão genotipados para nove locos microssatélites, animais de rebanhos da raça Nelore, provenientes da EMBRAPA, os quais já foram previamente genotipados com chips de SNPs de alta densidade. O desenvolvimento deste projeto deverá permitir uma maior eficiência, automação e precisão aos testes de paternidade de bovinos. (AU)

Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
SOUZA, Milla Albuquerque de. Imputação de alelos microssatélites a partir de haplótiposSNP para verificação de paternidade na raça Nelore. 2013. Dissertação de Mestrado - Universidade de São Paulo (USP). Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz Piracicaba.

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