Anotação genômica probabilística: estudos do framework em torno do método sifter

• Processo: 11/51477-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Vigência (Início): 01 de agosto de 2011
• Vigência (Término): 31 de janeiro de 2012
• Área do conhecimento: Interdisciplinar
• Acordo de Cooperação: Microsoft Research
• Pesquisador responsável: Ricardo Zorzetto Nicoliello Vêncio
• Beneficiário: Marcel Alexandre Fenerich
• Instituição Sede: Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto (FFCLRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Assunto(s): Genômica Bioenergia Biologia computacional
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Bioenergia | Bioinformatica | Genomica

Resumo

Fontes de energia renováveis tem sido uma boa alternativa ao uso dos combustíveis fósseis. No Brasil, a cana-de-açúcar (Saccharum officinarum) foi adotada como principal fonte de produção de etanol, por isso a importância do desenvolvimento de métodos e tecnologias que maximizem essa produção. Esse projeto visa o desenvolvimento de uma dessas ferramentas de bioinformática, o SIFTER. Esse método, baseado em Redes Bayesianas, é capaz de realizar anotações funcionais de genes de forma muito eficiente. Com o uso de implementações desse método, pretendemos predizer probabilisticamente a função de sequências com funções até então desconhecidas. Pretendemos aplicá-lo à cana-de-açúcar e também a organismos relacionados à produção de bioenergia. Com isso pretendemos contribuir para possíveis melhoramentos da cultura, e consequentemente para a produção de etanol. (AU)