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Anotação genômica probabilística: estudos do framework em torno do método sifter

Processo: 11/51477-6
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
Vigência (Início): 01 de agosto de 2011
Vigência (Término): 31 de janeiro de 2012
Área do conhecimento:Interdisciplinar
Convênio/Acordo: Microsoft Research
Pesquisador responsável:Ricardo Zorzetto Nicoliello Vêncio
Beneficiário:Marcel Alexandre Fenerich
Instituição-sede: Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto (FFCLRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Assunto(s):Genômica   Bioenergia   Biologia computacional

Resumo

Fontes de energia renováveis tem sido uma boa alternativa ao uso dos combustíveis fósseis. No Brasil, a cana-de-açúcar (Saccharum officinarum) foi adotada como principal fonte de produção de etanol, por isso a importância do desenvolvimento de métodos e tecnologias que maximizem essa produção. Esse projeto visa o desenvolvimento de uma dessas ferramentas de bioinformática, o SIFTER. Esse método, baseado em Redes Bayesianas, é capaz de realizar anotações funcionais de genes de forma muito eficiente. Com o uso de implementações desse método, pretendemos predizer probabilisticamente a função de sequências com funções até então desconhecidas. Pretendemos aplicá-lo à cana-de-açúcar e também a organismos relacionados à produção de bioenergia. Com isso pretendemos contribuir para possíveis melhoramentos da cultura, e consequentemente para a produção de etanol. (AU)