Emprego de ferramentas de quimioinformática no estudo do perfil metabólico de plantas e na desreplicação de matrizes vegetais

• Processo: 11/17860-7
• Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Vigência (Início): 01 de dezembro de 2011
• Vigência (Término): 31 de agosto de 2015
• Área do conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Química - Química Orgânica
• Pesquisador responsável: Fernando Batista da Costa
• Beneficiário: Tiago Branquinho Oliveira
• Instituição-sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Bolsa(s) vinculada(s): 13/14239-5 - Uso de ferramentas de quimioinformática na avaliação do comportamento do tempo de retenção de produtos naturais, BE.EP.DR
• Assunto(s): Química de produtos naturais Banco de dados Ressonância magnética nuclear

Resumo

Estudos baseados na química de produtos naturais, incluindo as áreas de metaboloma de plantas e desreplicação de matrizes vegetais, tem originado uma enorme quantidade de dados como, por exemplo, espectroscópicos ou cromatográficos. Logo, surge a necessidade de se realizar a seleção, o tratamento e a análise de dados obtidos, e mesmo automatizar etapas com emprego de softwares. Este projeto tem a finalidade de contribuir em uma área ainda pouco explorada, envolvendo a química de produtos naturais e a quimioinformática, com objetivo de empregar ferramentas de quimioinformática em estudos de metaboloma de plantas. Pretende-se utilizar informações estruturais, propriedades moleculares e cromatográficas de substâncias naturais para se realizar a predição de tempos de retenção (tR) em cromatografia líquida de alta eficiência através de estudos de QSRR (Quantitative Structure-Retention Relationship). Pretende-se também coletar informações cromatográficas e espectrométricas de uma biblioteca de estruturas químicas, de uma biblioteca de substâncias puras e de uma extratoteca e desenvolver uma plataforma para realizar análise automatizada de dados. Para tal, serão reunidos tR, pesos moleculares, espectros (UV, EM e de RMN-1H) e demais dados das estruturas, das substâncias puras e da extratoteca para elaborar bases de dados. Estudos de QSRR serão realizados com as estruturas químicas com vistas à desreplicação de matrizes vegetais. Será realizada a classificação de dados experimentais e dados estimados de RMN-1H de extratos, substâncias puras e de suas misturas utilizando ferramentas de quimioinformática. Finalmente, será desenvolvida uma plataforma piloto para o estudo automatizado de metaboloma de plantas.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

OLIVEIRA, TIAGO B.; GOBBO-NETO, LEONARDO; SCHMIDT, THOMAS J.; DA COSTA, FERNANDO B. Study of Chromatographic Retention of Natural Terpenoids by Chemoinformatic Tools. JOURNAL OF CHEMICAL INFORMATION AND MODELING, v. 55, n. 1, p. 26-38, JAN 2015. Citações Web of Science: 13.

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

OLIVEIRA, Tiago Branquinho. Emprego de ferramentas de quimioinformática no estudo do perfil metabólico de plantas e na desreplicação de matrizes vegetais. 2015. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto Ribeirão Preto.