Estudo das interações moleculares entre tioredoxinas/tioredoxinas redutase e inibidores/moduladores alostéricos e caracterização das interações moleculares presentes no sistema Trx

• Processo: 11/20720-2
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de novembro de 2011
• Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2012
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
• Pesquisador responsável: Ana Lígia Barbour Scott
• Beneficiário: Valderes de Conto
• Instituição Sede: Centro de Matemática, Computação e Cognição (CMCC). Universidade Federal do ABC (UFABC). Santo André , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 11/11857-4 - Estudo das interações moleculares entre tioredoxinas/tioredoxinas redutase e inibidores/moduladores alostéricos e caracterização das interações moleculares presentes no sistema Trx, AP.R
• Assunto(s): Biologia computacional Modelagem molecular Simulação de dinâmica molecular Tiorredoxinas Regulação alostérica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformática | Dinâmica Molecular | Docking Proteína-Ligante | Docking proteína-proteína | Mutantes | Modelagem Molecular

Resumo

Essa bolsa TT3/40 estará vinculada o auxílio regular solicitado que possui como principais objetivos: - Criar modelos, teóricos, para as Trx e TrxR através de modelagem por homologia, threading e dinâmica molecular, quando necessário; - Calcular os modos normais, de baixa frequência, da Trx e TrxR(TrxR1); - Selecionar os MNs mais significativos e gerar a estruturas da Trx e TrxR a partir dos modos normais, analisando a flexibilidade dessas moléculas; - Simular o docking flexível (usando estruturas obtidas no passo 4) da TrxR com cofatores (NADPH/NADP+, FAD) inibidores/moduladores alostéricos. (AU)